Produktuak

DNA/RNA sekuentziazioa - Nanopore sekuentziatzailea

DNA/RNA sekuentziazioa - Nanopore Sequencer Irudi nabarmendua

ONT sekuentziazioa denbora errealeko seinale elektrikoaren sekuentziazio teknologia molekula bakarrekoa da, nanoporoetan oinarrituta, plataforma bakoitzaren sekuentziazio printzipioa berdina da.Hari bikoitzeko DNA/RNA biofilmean txertatutako proteina nanoporotsuarekin lotuko da eta proteina motorraren gidaritzapean desegiten da, biofilmaren bi aldeetako tentsio-diferentziaren eraginez, DNA/RNA kateak nanoporoen kanaleko proteina jakin batean zehar igarotzen dira. tasa.DNA/RNA katearen oinarri ezberdinen propietate kimikoen desberdintasunak direla eta, base edo DNA molekula bakar bat nanoporoen kanaletik pasatzen denean, seinale elektriko ezberdinen aldaketa eragingo du.Seinale horiei detektatuz eta haiei dagozkion oinarri-motak kalkula daitezke, eta sekuentziaren denbora errealeko detekzioa osa daiteke.

Jarri gurekin harremanetan

Zerbitzuaren xehetasunak

Demo Emaitza

Zerbitzuaren xehetasunak Ezaugarriak

Plataforma	Liburutegiaren Tamaina	Datuen etekin teorikoa (zelula bakoitzeko)	Oinarri bakarreko zehaztasuna	Aplikazioak
Nanoporoa	8Kb, 10kb, 20kb, Ultraluzea, cDNA-PCR	70-90Gb/zelula	%85-92	SV deitzea, De novo, sekuentziazio luzea, Iso-Seq, Geneen oharpena, DNA metilazioa detektatzea

Zerbitzu Abantailak

● 5 urte baino gehiagoko esperientzia PacBio sekuentziazio plataforman hainbat espezierekin itxitako milaka proiekturekin.
● BMKGENE Oxford Nanopore-ren bazkide ofiziala da, plataforma bikoitzeko RNA/DNA ziurtagiria duena.
● Sekuentziatzaileen eredu nagusiak daude ekipamendu osoarekin eta sekuentziazio-erritmo nahikoarekin.
● Nanopore plataforman oinarrituta, Denovo animalia eta landareen 10 ikerketa baino gehiago argitaratu dira nazioartean ospe handiko aldizkarietan.

Lagin-baldintzak

Lagin mota

Zenbatekoa

Kontzentrazioa (Qubit ®)

Bolumena

Garbitasuna

Beste batzuk

DNA genomikoa

Datu-eskakizunaren arabera

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1.5；

260 nm-ko gailur garbia, kutsadurarik gabe

Kontzentrazioa Qubit eta Qubit/Nanopore ≤ 2 bidez neurtu behar da

RNA osoa

≥1,2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; kutsadurarik gabe

RIN balioa ≥7,5

Zerbitzuaren lan-fluxua

Laginak prestatzea

Liburutegiaren eraikuntza

Sekuentziazioa

Datuen azterketa

Proiektuaren entrega

Aurrekoa: DNA/RNA sekuentziazioa - Illumina sekuentziatzailea

Hurrengoa: Loku espezifikoko zatien sekuentziazioa (SLAF-Seq)

DNA Laginaren Datuen Kalitatearen Ebaluazioa

1. taula. Datu garbiei buruzko estatistikak.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	garbiSeqNum	cleanSumBase	garbiN50Len	garbiN90Len	cleanMeanLen	garbiMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1.218.239	26.37	1.121.736	25.90	28.014	15.764	23.090	143.181	9

RNA Laginaren Datuen Kalitatearen Ebaluazioa

1. taula. Datu garbiei buruzko estatistikak.

Fitxategi izena	Bezeroaren ID	Irakurri Zenbakia	BaseNum	N50	Batez besteko Luzera	MaxLength	Batez besteko Q puntuazioa
RNA_BMK001	C2	8.947.708	4.047.230.083	398	452	129.227	12.G