Illumina eta BGI
Ezaugarriak
●Plataformak:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten eta BGI-DNB-T7
●Sekuentziazio moduak:PE50, PE100, PE150, PE250
●Liburutegien kalitate-kontrola sekuentziatu aurretik
●Datuen entrega eta QC sekuentziazioa:QC txostena eta datu gordinak fastq formatuan entregatu Q30 irakurketak desmultiplexatu eta iragazi ondoren.
Zerbitzu Abantailak
●Sekuentziazio zerbitzuen aldakortasuna:bezeroak erreiaren, fluxu-zelularen edo datu kopuruaren arabera sekuentziatzea aukera dezake.
●Plataformen aldakortasuna:DNB liburutegiak Illumina plataformetara transferitu daitezke
●Esperientzia zabala Illumina sekuentziazio plataforman:hainbat espezierekin itxitako milaka proiekturekin.
●Sekuentziazioaren QC txostena bidaltzea:kalitate-neurriekin, datuen zehaztasunarekin eta sekuentziazio proiektuaren errendimendu orokorrarekin.
●Sekuentziazio-prozesu heldua:buelta-epe laburrarekin.
●Kalitate Kontrol zorrotza: QC eskakizun zorrotzak ezartzen ditugu kalitate handiko emaitzak koherentziaz entregatzeko.
Lagin-baldintzak*
Errei Partziala Sekuentziazioa
| Datu kopurua (X) | Kontzentrazioa (qPCR/nM) | Bolumena |
| X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| 50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
| X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Errei bakarra (Illumina)
| Plataforma | Kontzentrazioa (qPCR/nM) | Bolumena |
| HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Kontzentrazioaz eta kopuru osoaz gain, gailur eredu egokia ere beharrezkoa da.
Mesedez, jarri gurekin harremanetan zure laginek hasierako materialen baldintzak betetzen ez baditu.
Zerbitzuaren lan-fluxua
Liburutegiaren kalitate-kontrola
Sekuentziazioa
Datuen kalitatearen kontrola
Proiektuaren entrega
Liburutegiko QC txostena
Liburutegiaren kalitateari buruzko txostena ematen da sekuentziatu, liburutegiaren zenbatekoa ebaluatu eta zatikatu aurretik.
Sekuentziazioaren QC txostena
1. taula. Sekuentziazio-datuen estatistikak.
| Lagina ID | BMKID | Irakurketa gordinak | Datu gordinak (bp) | Irakurketa garbiak (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
1. Irudia. Kalitatearen banaketa lagin bakoitzeko irakurketetan zehar
2. Irudia. Oinarrizko edukien banaketa
3. irudia. Irakurritako edukien banaketa sekuentziazio datuetan
