-
Ühetuumalise RNA sekveneerimine
Edusammud üksikute rakkude hõivamise ja individuaalse raamatukogu ehitamise tehnikas koos suure läbilaskevõimega sekveneerimisega võimaldavad geeniekspressiooni uuringuid rakupõhiselt.See võimaldab keerukate rakupopulatsioonide sügavamat ja täielikku süsteemianalüüsi, milles see väldib suures osas nende heterogeensuse varjamist, võttes kõigi rakkude keskmise.
Mõned rakud ei sobi siiski üherakulise suspensiooni valmistamiseks, mistõttu on vaja kasutada teisi proovide ettevalmistamise meetodeid – kudedest tuuma eraldamist, see tähendab, et tuum ekstraheeritakse otse kudedest või rakust ja valmistatakse sellest ühetuumaline suspensioon. rakkude järjestamine.
BMK pakub 10× Genomics ChromiumTM-il põhinevat üherakulise RNA sekveneerimisteenust.Seda teenust on laialdaselt kasutatud haigustega seotud uuringutes, nagu immuunrakkude diferentseerumine, kasvaja heterogeensus, kudede areng jne.
Ruumiline transkriptoomikiip: 10 × genoomika
Platvorm: Illumina NovaSeqi platvorm
-
BMKMANU S1000 ruumiline transkriptoom
Ruumiline transkriptoomika on teadusliku innovatsiooni esirinnas, andes teadlastele võimaluse süveneda kudede keerulistesse geeniekspressiooni mustritesse, säilitades samal ajal nende ruumilise konteksti.Erinevate platvormide keskel on BMKGene välja töötanud BMKManu S1000 ruumilise transkriptsioonikiibi, millel ontäiustatud eraldusvõime5 µM, jõudes subtsellulaarsesse vahemikku ja võimaldadesmitmetasandilised eraldusvõime sätted.Ligikaudu 2 miljoni täpiga S1000 kiip kasutab mikrosüvendeid, mis on kaetud ruumiliselt vöötkoodiga püüdmissondidega täidetud helmestega.Ruumiliste vöötkoodidega rikastatud cDNA raamatukogu valmistatakse S1000 kiibist ja sekveneeritakse seejärel Illumina NovaSeq platvormil.Ruumiliselt vöötkoodiga näidiste ja UMI-de kombinatsioon tagab genereeritud andmete täpsuse ja spetsiifilisuse.BMKManu S1000 kiibi ainulaadne atribuut seisneb selle mitmekülgsuses, pakkudes mitmetasandilisi eraldusvõime sätteid, mida saab peenhäälestada erinevatele kudedele ja detailitasemetele.See kohanemisvõime positsioneerib kiibi suurepärase valikuna erinevate ruumilise transkriptoomika uuringute jaoks, tagades täpse ruumilise rühmituse minimaalse müraga.
Kasutades BMKManu S1000 kiipi ja muid ruumilise transkriptoomika tehnoloogiaid, saavad teadlased paremini mõista rakkude ruumilist korraldust ja kudedes toimuvaid keerulisi molekulaarseid interaktsioone, pakkudes hindamatut teavet bioloogiliste protsesside aluseks olevate mehhanismide kohta paljudes valdkondades, sealhulgas onkoloogia, neuroteadus, arengubioloogia, immunoloogia ja botaanikauuringud.
Platvorm: BMKManu S1000 kiip ja Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visiumi ruumiline transkriptoom
Ruumiline transkriptoomika on tipptehnoloogia, mis võimaldab teadlastel uurida kudedes geeniekspressiooni mustreid, säilitades samal ajal nende ruumilise konteksti.Üks võimas platvorm selles domeenis on 10x Genomics Visium koos Illumina sekveneerimisega.10X Visiumi põhimõte seisneb spetsiaalsel kiibil, millel on määratud püüdmisala, kuhu asetatakse kudede lõigud.See püüdmisala sisaldab vöötkoodiga laike, millest igaüks vastab ainulaadsele ruumilisele asukohale koes.Seejärel märgistatakse koest püütud RNA molekulid pöördtranskriptsiooniprotsessi ajal ainulaadsete molekulaarsete identifikaatoritega (UMI).Need vöötkoodiga laigud ja UMI-d võimaldavad täpset ruumilist kaardistamist ja geeniekspressiooni kvantifitseerimist üherakulise eraldusvõimega.Ruumiliselt vöötkoodiga näidiste ja UMI-de kombinatsioon tagab genereeritud andmete täpsuse ja spetsiifilisuse.Selle ruumilise transkriptoomika tehnoloogia abil saavad teadlased sügavamalt mõista rakkude ruumilist korraldust ja kudedes toimuvaid keerukaid molekulaarseid interaktsioone, pakkudes hindamatut teavet bioloogiliste protsesside aluseks olevate mehhanismide kohta mitmes valdkonnas, sealhulgas onkoloogias, neuroteaduses, arengubioloogias ja immunoloogias. ja botaanilised uuringud.
Platvorm: 10X Genomics Visium ja Illumina NovaSeq
