-
BSA
Masseeritud segregantanalüüsi platvorm koosneb üheastmelisest standardanalüüsist ja täiustatud analüüsist koos kohandatud parameetrite seadistustega.BSA on meetod, mida kasutatakse fenotüübiga seotud geneetiliste markerite kiireks tuvastamiseks.BSA põhitöövoog sisaldab: 1. kahe äärmiselt vastandlike fenotüüpidega indiviidide rühma valimist;2. kõigi indiviidide DNA, RNA või SLAF-seq (Developed by Biomarker) ühendamine, et moodustada kaks osa DNA-st;3. diferentsiaaljärjestuste tuvastamine võrdlusgenoomi või nende vahel; 4. kandidaat-seotud piirkondade ennustamine ED ja SNP-indeksi algoritmi abil;5. Funktsionaalne analüüs ja geenide rikastamine kandidaatpiirkondades jne. Saadaval on ka täpsem andmete kaevandamine, sealhulgas geneetiliste markerite sõelumine ja praimerite kavandamine.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) platvorm on välja töötatud mikroobide mitmekesisuse projektianalüüsi aastatepikkuse kogemusega, mis sisaldab standardiseeritud põhianalüüsi ja personaliseeritud analüüsi: põhianalüüs hõlmab praeguste mikroobiuuringute peavoolu analüüsisisu, analüüsisisu on rikkalik ja kõikehõlmav, ja analüüsitulemused esitatakse projektiaruannete kujul;Personaliseeritud analüüsi sisu on mitmekesine.Proove saab valida ja parameetreid paindlikult seadistada vastavalt põhianalüüsi aruandele ja uurimise eesmärgile, et realiseerida isikupärastatud nõudeid.Windowsi operatsioonisüsteem, lihtne ja kiire.
-
Evolutsiooniline geneetika
Evolutsiooniline geneetika on pakitud sekveneerimisteenus, mis on loodud selleks, et pakkuda geneetilistel variatsioonidel, sealhulgas SNP-d, InDel-id, SV-d ja CNV-d, põhinevate materjalide evolutsioonilise teabe terviklikku tõlgendust.See sisaldab kõiki fundamentaalseid analüüse, mis on vajalikud populatsioonide evolutsiooniliste muutuste ja geneetiliste tunnuste kirjeldamiseks, nagu populatsiooni struktuur, geneetiline mitmekesisus, fülogeneesi suhted jne. See sisaldab ka geenivoo uuringuid, mis võimaldavad hinnata populatsiooni efektiivset suurust ja lahknemisaega.
-
Võrdlev genoomika
Võrdlev genoomika tähendab sõna-sõnalt erinevate liikide täielike genoomijärjestuste ja struktuuride võrdlemist.Selle distsipliini eesmärk on paljastada liikide evolutsioon, geenifunktsioon, geenide reguleerimise mehhanism genoomi tasemel, tuvastades järjestuste struktuurid ja elemendid, mis eri liikide lõikes säilisid või diferentseerusid.Tüüpiline võrdlev genoomika uuring hõlmab geeniperekonna, evolutsioonilise arengu, kogu genoomi dubleerimise, selektiivse rõhu jne analüüse.
-
Evolutsiooniline geneetika
Rahvastiku ja evolutsioonilise geneetilise analüüsi platvorm on loodud BMK teadus- ja arendusmeeskonnas aastate jooksul kogutud tohutute kogemuste põhjal.See on kasutajasõbralik tööriist eelkõige teadlastele, kes ei tegele bioinformaatikaga.See platvorm võimaldab põhilist evolutsioonilise geneetikaga seotud põhianalüüsi, sealhulgas fülogeneetilise puude konstrueerimist, sidemete tasakaalustamatuse analüüsi, geneetilise mitmekesisuse hindamist, selektiivset pühkimisanalüüsi, sugulusanalüüsi, PCA, populatsiooni struktuuri analüüsi jne.
-
Hi-C-põhine genoomikoost
Hi-C on meetod, mis on loodud kromosoomi konfiguratsiooni jäädvustamiseks, kombineerides sondeerimisel põhinevaid interaktsioone ja suure läbilaskevõimega järjestamist.Arvatakse, et nende interaktsioonide intensiivsus on negatiivses korrelatsioonis kromosoomide füüsilise kaugusega.Seetõttu võivad Hi-C andmed suunata kokkupandud järjestuste rühmitamist, järjestamist ja orienteerumist mustandi genoomis ning kinnitada need teatud arvule kromosoomidele.See tehnoloogia annab populatsioonipõhise geneetilise kaardi puudumisel võimaluse kromosoomi tasemel genoomi koostamiseks.Iga genoom vajab Hi-C-d.
Platvorm: Illumina NovaSeq platvorm / DNBSEQ
-
Taimede/loomade de Novo genoomi järjestamine
De Novosekveneerimine viitab liigi kogu genoomi konstrueerimisele, kasutades sekveneerimistehnoloogiaid, nt PacBio, Nanopore, NGS jne, võrdlusgenoomi puudumisel.Kolmanda põlvkonna sekveneerimistehnoloogiate lugemispikkuse märkimisväärne paranemine on toonud uusi võimalusi keerukate genoomide, näiteks suure heterosügootsuse, suure korduvate piirkondade, polüploidide jms genoomide kokkupanemiseks. Kuna lugemispikkus on kümnete kilobaaside tasemel, võimaldavad need järjestuslugemised korduvate elementide, ebanormaalse GC sisuga piirkondade ja muude väga keerukate piirkondade lahendamine.
Platvorm: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq platvorm
-
Inimese kogu eksoomi järjestamine
Tervet eksoomi sekveneerimist (WES) peetakse kulutõhusaks järjestusstrateegiaks haigusi põhjustavate mutatsioonide tuvastamiseks.Kuigi eksonid võtavad kogu genoomist vaid ligikaudu 1,7%, esindab see otseselt valgu kogufunktsioonide profiili.Inimese genoomis on teatatud, et enam kui 85% haigusega seotud mutatsioonidest esineb valku kodeerivas piirkonnas.
BMKGENE pakub terviklikke ja paindlikke inimese terve eksoomi sekveneerimisteenuseid koos erinevate eksonite hõivamise strateegiatega, mis on saadaval erinevate uurimiseesmärkide saavutamiseks.
Platvorm: Illumina NovaSeqi platvorm
-
Spetsiifilise lookusega võimendatud fragmentide järjestus (SLAF-Seq)
Suure läbilaskevõimega genotüpiseerimine, eriti suuremahuliste populatsioonide puhul, on geeniassotsiatsiooniuuringute põhietapp, mis loob geneetilise aluse funktsionaalseks geenide avastamiseks, evolutsiooniliseks analüüsiks jne. Põhjaliku kogu genoomi ümbersekveneerimise asemel kasutatakse vähendatud esindusliku genoomi järjestamist (RRGS). ).Tavaliselt saavutatakse see restriktsioonifragmendi ekstraheerimisega etteantud suurusvahemikus, mida nimetatakse vähendatud esitusraamatukoguks (RRL).Spetsiifilise lookusega amplifitseeritud fragmentide järjestamine (SLAF-Seq) on enda väljatöötatud strateegia SNP genotüpiseerimiseks võrdlusgenoomiga või ilma.
Platvorm: Illumina NovaSeqi platvorm -
Illumina ja BGI
Illumina sekveneerimistehnoloogia, mis põhineb Sequencing by Synthesis (SBS) meetodil, on ülemaailmselt omaks võetud NGS-i innovatsioon, mis vastutab enam kui 90% maailma sekveneerimisandmete genereerimise eest.SBS-i põhimõte hõlmab iga dNTP lisamisel fluorestsentsmärgistatud pöörduvate terminaatorite pildistamist ja seejärel lõhustamist, et võimaldada järgmise aluse lisamist.Kui igas sekveneerimistsüklis on kõik neli pöörduvat terminaatoriga seotud dNTP-d, minimeerib loomulik konkurents inkorporeerimise kõrvalekaldeid.See mitmekülgne tehnoloogia toetab nii ühe lugemisega kui ka paarisotsaga raamatukogusid, mis pakuvad erinevaid genoomirakendusi.Illumina sekveneerimise suure läbilaskevõime ja täpsus asetavad selle genoomikauuringute nurgakiviks, andes teadlastele võimaluse genoomide keerukusest võrreldamatu detaili ja tõhususega lahti harutada.
BGI välja töötatud DNBSEQ on veel üks uuenduslik NGS-tehnoloogia, mis on suutnud järjestuse kulusid veelgi vähendada ja läbilaskevõimet suurendada.DNBSEQ raamatukogude ettevalmistamine hõlmab DNA fragmenteerimist, ssDNA valmistamist ja veereva ringi amplifikatsiooni, et saada DNA nanopallid (DNB).Seejärel laaditakse need tahkele pinnale ja sekveneeritakse kombinatoorse sondi-ankru sünteesi (cPAS) abil.
Meie eelvalmistatud raamatukogude sekveneerimisteenus hõlbustab klientidel erinevatest allikatest (muu hulgas mRNA, kogu genoom, amplikon) oma sekveneerimisraamatukogude ettevalmistamist.Seejärel saab need teegid saata meie sekveneerimiskeskustesse kvaliteedikontrolliks ja Illumina või BGI platvormidel järjestamiseks.
