-
Metatranskriptoomide järjestamine
Metatranskriptoomiline sekveneerimine tuvastab mikroobide (nii eukarüootide kui ka prokarüootide) geeniekspressiooni looduslikus keskkonnas (st pinnases, vees, meres, väljaheites ja soolestikus). Täpsemalt võimaldab see teenus hankida komplekssete mikroobikoosluste geeniekspressiooni profiile ja taksonoomilist analüüsi. liikide, erinevalt ekspresseeritud geenide funktsionaalse rikastamise analüüsi ja palju muud.
Platvorm: Illumina NovaSeqi platvorm
-
Seene genoom
Biomarker Technologies pakub sõltuvalt konkreetsest uurimiseesmärgist seente genoomiuuringut, peengenoomi ja peenist täielikku genoomi.Genoomi sekveneerimist, kokkupanekut ja funktsionaalset annotatsiooni saab saavutada, ühendades järgmise põlvkonna sekveneerimise + kolmanda põlvkonna sekveneerimise, et saavutada kõrgetasemeline genoomi kokkupanek.Hi-C tehnoloogiat saab kasutada ka genoomi kokkupanemise hõlbustamiseks kromosoomi tasemel.
Platvorm:PacBio järg II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq platvorm
-
Tööriistakomplektid
BMKCloud on juhtiv bioinformaatikaplatvorm, mis pakub genoomiprogrammidele ühtset lahendust, mida laialdaselt usaldavad teadlased erinevatest valdkondadest, sealhulgas meditsiini-, põllumajandus-, keskkonna- jne. BMKCloud on pühendunud integreeritud, usaldusväärsete ja tõhusate teenuste, sealhulgas bioinformaatilise analüüsi platvormide ja tööriistade pakkumisele. , arvutusressursid, avalik andmebaas, bioinformaatika veebikursused jne. BMKCloudil on mitmesuguseid sageli kasutatavaid bioinformaatilisi tööriistu, sealhulgas geeniannotatsioon, evolutsioonilised geneetilised tööriistad, ncRNA, andmete kvaliteedi kontroll, kokkupanek, joondamine, andmete ekstraheerimine, mutatsioonid, statistika, jooniste generaator, järjestuse analüüs jne.
-
Bakterite täielik genoom
Biomarker Technologies pakub sekveneerimisteenust täieliku nullvahega bakterite genoomi konstrueerimiseks.Bakterite täieliku genoomi ehitamise peamine töövoog hõlmab kolmanda põlvkonna sekveneerimist, kokkupanekut, funktsionaalset annotatsiooni ja täiustatud bioinformaatilist analüüsi, mis täidavad konkreetsed uurimiseesmärgid.Bakterite genoomi põhjalikum profiilide koostamine võimaldab paljastada nende bioloogiliste protsesside aluseks olevad põhimehhanismid, mis võiksid olla ka väärtuslik viide kõrgemate eukarüootsete liikide genoomiuuringutele.
Platvorm:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq platvorm
PacBio järg II
-
väike RNA
Väikesed RNA-d on tüüpi lühikesed mittekodeerivad RNA-d, mille keskmine pikkus on 18–30 nt, sealhulgas miRNA, siRNA ja piRNA.On teatatud, et need väikesed RNA-d osalevad massiliselt erinevates bioloogilistes protsessides, nagu mRNA lagunemine, translatsiooni pärssimine, heterokromatiini moodustumine jne. Väikese RNA sekveneerimisanalüüsi on laialdaselt kasutatud loomade/taimede arengu, haiguste, viiruste jne uuringutes. Väike RNA sekveneerimisanalüüsi platvorm koosneb standardanalüüsist ja täiustatud andmete kaevandamisest.RNA-seq andmete põhjal võib standardanalüüsiga saavutada miRNA identifitseerimise ja ennustamise, miRNA sihtgeeni ennustamise, annotatsiooni ja ekspressioonianalüüsi.Täiustatud analüüs võimaldab kohandatud miRNA otsimist ja ekstraheerimist, Venni diagrammi genereerimist, miRNA ja sihtgeenivõrgu ülesehitamist.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS on terve genoomi uuesti sekveneerimise analüüsiplatvorm, mis on välja töötatud rikkalike kogemuste põhjal Biomarker Technologies.See lihtsalt kasutatav platvorm võimaldab integreeritud analüüsi töövoo kiiret esitamist, määrates lihtsalt mõned põhiparameetrid, mis sobivad nii Illumina platvormilt kui ka BGI sekveneerimisplatvormilt genereeritud DNA sekveneerimisandmete jaoks.Seda platvormi kasutatakse suure jõudlusega andmetöötlusserveris, mis võimaldab väga tõhusat andmeanalüüsi väga piiratud aja jooksul.Isikupärastatud andmete kaevandamine on saadaval standardanalüüsi alusel, sealhulgas muteeritud geenipäring, PCR praimeri disain jne.
-
mRNA (viide)
Transkriptoom on seos genoomse geneetilise teabe ja bioloogilise funktsiooni proteoomi vahel.Transkriptsioonitaseme reguleerimine on organismide kõige olulisem ja enim uuritud reguleerimisviis.Transkriptoomide sekveneerimine võib sekveneerida transkriptoomi mis tahes ajahetkel või mis tahes tingimustes ühe nukleotiidi täpsusega. See võib dünaamiliselt kajastada geeni transkriptsiooni taset, samaaegselt tuvastada ja kvantifitseerida haruldasi ja normaalseid transkripte ning anda struktuuriteavet konkreetsete ärakirjade näidised.
Praegu on transkriptoomide järjestamise tehnoloogiat laialdaselt kasutatud agronoomias, meditsiinis ja muudes uurimisvaldkondades, sealhulgas loomade ja taimede arengu reguleerimises, keskkonnaga kohanemises, immuunkoostoimes, geenide lokaliseerimises, liikide geneetilises evolutsioonis ning kasvajate ja geneetiliste haiguste tuvastamises.
-
Metagenoomika (NGS)
See analüüsiplatvorm on mõeldud haavli metagenoomiliste andmete analüüsimiseks aastatepikkuse kogemuse põhjal.See koosneb integreeritud töövoost, mis sisaldab mitmesuguseid tavaliselt vajalikke metagenoomika analüüse, sealhulgas andmetöötlust, liigitaseme uuringuid, geenifunktsiooni taseme uuringuid, metagenoomide sidumist jne. Lisaks on standardse analüüsi töövoo korral saadaval kohandatud andmekaevetööriistad, sealhulgas geenide ja liikide päring. , parameetrite seadistamine, isikupärastatud figuuri genereerimine jne.
-
LncRNA
Pikad mittekodeerivad RNA-d (lncRNA) on teatud tüüpi transkriptid, mille pikkus on üle 200 nt ja mis ei suuda valke kodeerida.Kogunenud tõendid näitavad, et enamik lncRNA-sid on suure tõenäosusega funktsionaalsed.Suure läbilaskevõimega sekveneerimistehnoloogiad ja bioinformaatilised analüüsitööriistad võimaldavad meil tõhusamalt paljastada lncRNA järjestusi ja asukohateavet ning viia meid avastama oluliste regulatiivsete funktsioonidega lncRNA-sid.BMKCloud pakub uhkusega oma klientidele lncRNA sekveneerimise analüüsiplatvormi, et saavutada kiire, usaldusväärne ja paindlik lncRNA analüüs.
-
GWAS
Genoomi hõlmava assotsiatsiooniuuringu (GWAS) eesmärk on tuvastada geneetilisi variante (genotüüp), mis on seotud spetsiifiliste tunnustega (fenotüüp).GWA uuringud uurivad geneetilisi markereid, mis läbivad suure hulga indiviidide kogu genoomi ja ennustavad genotüübi-fenotüübi seoseid statistilise analüüsi abil populatsiooni tasandil.Terve genoomi resekveneerimine võib potentsiaalselt avastada kõik geneetilised variandid.Seoses fenotüübiandmetega saab GWAS-i töödelda fenotüübiga seotud SNP-de, QTL-de ja kandidaatgeenide tuvastamiseks, mis toetab tugevalt kaasaegset looma-/taimekasvatust.SLAF on enda väljatöötatud lihtsustatud genoomi järjestamise strateegia, mis avastab genoomi hõlmavaid hajutatud markereid, SNP.Neid SNP-sid kui molekulaarseid geneetilisi markereid saab töödelda suunatud tunnustega assotsiatsiooniuuringuteks.See on kulutõhus strateegia keeruliste tunnustega seotud geneetiliste variatsioonide tuvastamiseks.
-
Nanopore Täispikk transkriptoomika
Organismide komplekssed ja varieeruvad alternatiivsed isovormid on olulised geneetilised mehhanismid geeniekspressiooni ja valkude mitmekesisuse reguleerimiseks.Transkriptsioonistruktuuride täpne tuvastamine on aluseks geeniekspressiooni regulatsioonimustrite põhjalikule uurimisele.Nanopooride sekveneerimisplatvorm on edukalt viinud transkriptoomilise uuringu isovormi tasemele.See analüüsiplatvorm on loodud Nanopore platvormil genereeritud RNA-Seq andmete analüüsimiseks võrdlusgenoomi baasil, mis võimaldab kvalitatiivseid ja kvantitatiivseid analüüse nii geenitasemel kui ka transkriptsioonide tasemel.
-
ring-RNA
Tsirkulaarne RNA (circRNA) on teatud tüüpi mittekodeeriv RNA, millel on hiljuti leitud oluline roll regulatoorsetes võrkudes, mis on seotud arenguga, keskkonnaresistentsusega jne. Erineb lineaarsetest RNA molekulidest, nt mRNA, lncRNA, 3' ja 5'. tsircRNA otsad on omavahel ühendatud, moodustades ringikujulise struktuuri, mis säästab neid eksonukleaasi seedimisest ja on stabiilsem kui enamik lineaarset RNA-d.On leitud, et CircRNA-l on geeniekspressiooni reguleerimisel erinevad funktsioonid.CircRNA võib toimida tseRNA-na, mis seob konkureerivalt miRNA-d, tuntud kui miRNA käsn.CircRNA sekveneerimisanalüüsi platvorm võimaldab circRNA struktuuri ja ekspressiooni analüüsi, sihtmärgi ennustamist ja ühisanalüüsi teist tüüpi RNA molekulidega
