BMKCloud Log in
条形bänner-03

Uudised

Nanopooripõhine täispikk transkriptsioonijärjestus

Nanopooride sekveneerimine erineb teistest sekveneerimisplatvormidest selle poolest, et nukleotiide loetakse otse ilma DNA sünteesita ja see tekitab pikki lugemisi kümnete kilobaaside juures.See võimaldab täispikkade ärakirjade otse lugemist ja transkriptoomiliste uuringute väljakutsete lahendamist.

√ Madal järjestusespetsiifiline kallutatus

√ cDNA täispikk näit geenistruktuuri uuringute jaoks

√ Sama arvu ärakirjade katmiseks on vaja vähem andmeid

√ Mitme isovormi tuvastamine geeni kohta

√ Ekspressiooni kvantifitseerimine isovormi tasemel

nanopoor-1

Tüüpiline bioinformaatika torujuhe

Täispikk-trans-bix-1024x254

Viimased edukad juhtumid biomarkeritehnoloogiaga

1. Täispikkade transkriptoomide võrdlevad analüüsid näitavad Gnetum luofuense varre arengudünaamikat

Ajakiri: Frontiers in Genetics

Avaldatud: märts 2021

Märksõnad: MinION |Alternatiivne splaissimine |APA |lncRNA |Erinevalt väljendatud ärakirjad

Loe täisteksti

2. Väikeste RNA-de ühesuunaline liikumine võrsetelt juurteni liikidevahelistes heterotransplantaatides

Ajakiri: Nature Plants

Avaldatud: jaanuar 2021

Märksõnad: Nanopore |Illumina |täispikk mobiilse mRNA tuvastamine

3. Spargli juurte täispikk transkriptoomianalüüs paljastab arbuskulaarsete mükoriisaseente poolt indutseeritud soolataluvuse molekulaarse mehhanismi

Ajakiri: Environmental and Experimental Botany

Avaldatud: jaanuar 2021

Märksõnad: MinION |Erinevalt väljendatud ärakirjad |Transkriptsioonifaktorid |Alternatiivne splaissimine

4. Roosi (Rosa chinensis) juurte ja lehtede füsioloogilised iseloomulikud muutused ja täispikk transkriptsioon vastuseks põuastressile

Ajakiri: Plant and Cell Physiology

Avaldatud: oktoober 2020

Märksõnad: PromethION |Erinevalt väljendatud ärakirjad |Funktsionaalne ennustus |Splaissitud isovormid |TF ja lncRNA

5. Arabidopsise transkriptoomi PacBio ja nanopooripõhise RNA järjestuse analüüs ja põhjalik võrdlus

Ajakiri: Plant Method

Avaldatud: aprill 2020

Märksõnad: GridION |PromethION |PacBio järg |Illumina NovaSeq |Genoomi joondamine |Ärakirja tuvastamine |Alternatiivne splaissimine |SSR |LncRNA |Isovormi kvantifitseerimine

Uudised ja tipphetked eesmärk on jagada uusimaid edukaid juhtumeid ettevõttega Biomarker Technologies, jäädvustada nii uudseid teadussaavutusi kui ka uuringu käigus kasutatud silmapaistvaid tehnikaid.


Postitusaeg: jaanuar 08-2022

Saada meile oma sõnum: