BMKGENE pakkus ruumilise transkriptoomi sekveneerimisteenuseid uuringule "STEEL võimaldab kõrgresolutsiooniga piiritleda ruumilise ja ajalise transkriptoomilisi andmeid", mis avaldati ajakirjas Briefings in Bioinformatics.
Selles uuringus pakuti välja järelevalveta ja mitmekülgne õppepõhine algoritm, ruumilise transkriptoomi rakutüübi klasterdamine (STEEL), mis tuvastab ruumilise transkriptoomi domeenid, koondades helmed, millel on nii väga sarnased geeniekspressiooniprofiilid kui ka graafikute kujul lähedane ruumiline kaugus.
STEELi põhjalik hindamine 10X Visiumi platvormi ruumiliste transkriptoomiliste andmekogumite kohta näitab, et see mitte ainult ei saavuta kõrge eraldusvõimet hiire aju peenstruktuuride iseloomustamiseks, vaid võimaldab ka integreerida mitu üksikult analüüsitud koeslaidi suuremaks.
Ruumilise transkriptoomi tehnoloogiate edenemisega on meie meetodil suur kasutatavus domeeni tuvastamisel ja geeniekspressiooni atlase rekonstrueerimisel.
Klõpsakesiinselle uuringu kohta lisateabe saamiseks.
Postitusaeg: 20. oktoober 2023