● Suure kogemusega: BMK-s on töödeldud üle 200 000 proovi, mis hõlmavad erinevaid proovitüüpe, sealhulgas rakukultuuri, koe, kehavedelikku jne, ja üle 7000 mRNA-Seq projekti, mis hõlmavad erinevaid uurimisvaldkondi, on suletud.
● Range kvaliteedikontrolli süsteem: kvaliteetsete tulemuste saamiseks jälgitakse hoolikalt kõiki põhilisi kvaliteedikontrolli punkte, sealhulgas proovide ettevalmistamist, raamatukogu ettevalmistamist, järjestamist ja bioinformaatikat.
● Funktsiooni annotatsiooni ja rikastamise uuringute jaoks on saadaval mitu andmebaasi, et täita erinevaid uurimiseesmärke.
● Müügijärgsed teenused: müügijärgsed teenused, mis kehtivad 3 kuud pärast projekti lõppu, sealhulgas projekti järelkontroll, tõrkeotsing, tulemuste küsimused ja vastused jne.
Raamatukogu | Järjestusstrateegia | Soovitatavad andmed | Kvaliteedi kontroll |
Polü A rikastatud | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Nukleotiidid:
Kontsentr. (ng/μl) | Kogus (μg) | Puhtus | Terviklikkus |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Geelil näidatud valgu- või DNA-saaste on piiratud või puudub üldse. | Taimedele: RIN≥6,5; Loomadele: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; algtaseme tõus on piiratud või puudub |
Kude: kaal (kuiv):≥1 g
*Kudede puhul, mis on väiksemad kui 5 mg, soovitame saata kiirkülmutatud (vedelas lämmastikus) koeproov.
Rakkude suspensioon:Rakkude arv = 3 × 106- 1 × 107
*Soovitame tarnida külmutatud rakulüsaati.Kui selle rakkude arv on väiksem kui 5 × 105.
Vereproovid:Maht≥1 ml
Mikroorganism:Mass ≥ 1 g
Mahuti: 2 ml tsentrifuugitoru (tinafoolium pole soovitatav)
Näidismärgistus: rühm+kordus nt A1, A2, A3;B1, B2, B3.....
Saadetis:
Bioinformaatika
Eukarüootne mRNA sekveneerimise analüüsi töövoog
Bioinformaatika
ØToorandmete kvaliteedi kontroll
ØVõrdlusgenoomi joondamine
ØÄrakirja struktuuri analüüs
ØEkspressiooni kvantifitseerimine
ØDiferentsiaalväljenduse analüüs
ØFunktsiooni annotatsioon ja rikastamine
1.mRNA andmete küllastuskõver
2.Diferentsiaalekspressiooni analüüs - Vulkaani graafik
3.KEGG-i annotatsioon DEG-de kohta
4.GO klassifikatsioon DEG-de järgi