Tooted

BMKMANU S1000 ruumiline transkriptoom

BMKMANU S1000 ruumilise transkriptsiooni esiletõstetud pilt

Rakkude ruumiline korraldus mängib olulist rolli erinevates bioloogilistes protsessides, nagu immuunsüsteemi infiltratsioon, embrüo areng jne. Ruumiline transkriptoomide järjestamine, mis näitab geeniekspressiooni profiilide koostamist, säilitades samal ajal teabe ruumilise asukoha kohta, on andnud suurepärase ülevaate transkriptoomi tasemel koearhitektuurist.Tehnoloogia arenedes tuleb üliselget koe morfoloogiat ja ruumilise molekulaarse ekspressiooni tegelikku struktuurset erinevust uurida suurema eraldusvõimega.BMKGENE pakub kõikehõlmavat ühekordset ruumilise transkriptsiooni järjestamise teenust proovidest kuni bioloogiliste arusaamadeni.

Ruumilise transkriptoomika tehnoloogiad võimaldasid uudseid perspektiive mitmekesises uurimisareenis, lahendades heterogeensete proovide ruumilise sisuga geeniekspressiooniprofiili.

Ruumiline transkriptsioonikiip: BMKMANU S1000

Platvorm: Illumina NovaSeqi platvorm

Võta meiega ühendust

Teenuse üksikasjad

Bioinformaatika

Demo tulemused

BMKMANU S1000 ruumilise transkriptsiooni tehniline skeem

BMKMANU S1000 eelised

1) Subtsellulaarne eraldusvõime: iga pildistamisala sisaldas > 2 miljonit ruumilist vöötkoodiga täppi läbimõõduga 2,5 µm ja täpikeskuste vahelise kaugusega 5 µm, võimaldades ruumilise transkriptoomi analüüsi subtsellulaarse eraldusvõimega (5 µm).

2) Mitmetasandiline eraldusvõime analüüs: paindlik mitmetasandiline analüüs vahemikus 100 μm kuni 5 μm, et lahendada kudede erinevad omadused optimaalse eraldusvõimega.

3) Põhjalik transkriptsiooniprofiil: kogu koeslaidilt kogutud transkripte saab analüüsida ilma sihtgeenide arvu ja sihtpiirkonna piiranguteta.

Teenuse spetsifikatsioonid

Raamatukogu	Järjestusstrateegia	Soovitatav andmeväljund
S1000 cDNA raamatukogu	BMKMANU S1000-Illumina PE150	60Gb/proov

Näidisnõuded

Näidis	Number	Suurus	RNA kvaliteet
OCT sisseehitatud koeblokaad	2-3 plokki/ näidis	u.6,8x6,8x6,8 mm³	RIN≥7

Näidiste ettevalmistamise juhiste ja teeninduse töövoo kohta lisateabe saamiseks võtke ühendust aadressil aBMKGENE ekspert

Teeninduse töövoog

Katsekujundus

Näidiste kohaletoimetamine

Eelkatse

Ruumiline vöötkood

Raamatukogu ehitus

Järjestus

Andmete analüüs

Müügijärgsed teenused

Eelmine: 10x Genomics Visiumi ruumiline transkriptoom

Järgmine: Taime/looma kogu genoomi järjestamine

BMKMANU S1000 genereeritud andmeid analüüsitakse BMKGENE poolt iseseisvalt loodud tarkvara “BSTMatrix” abil, sealhulgas:

1) Geeniekspressiooni maatriksi genereerimine
2) HE pilditöötlus
3) Ühildub analüüsimiseks allavoolu kolmanda osapoole tarkvaraga
4) Online “BSTViewer” aitab saada visualiseerimistulemusi erinevatel eraldusvõimetel.

1.Punktide rühmitamine

s1000 (4)