Bakterite täielik genoom
Teenuse eelised
● Erinevate uurimiseesmärkide jaoks on saadaval mitu järjestusstrateegiat
● Bakterite täielik genoom garanteeritud 0 vahega.
● Suure kogemusega bakterite genoomi kokkupanemisel, kokku on kokku pandud üle 10 000 täieliku genoomi.
● Professionaalne müügijärgne tehnilise toe meeskond, kes täidab spetsiifilisemaid uurimisvajadusi.
Teenuse spetsifikatsioonid
| Järjestusstrateegia | Raamatukogu | Kvaliteet garanteeritud | Eeldatav läbimisaeg |
| Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanopore 20K PE150 | 0 vahe | 30 päeva |
| PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
Bioinformaatika analüüsid
● Toorandmete kvaliteedi kontroll
● Genoomi kokkupanek
● Genoomikomponentide analüüs
● Geenifunktsiooni annotatsioon
● Võrdlev genoomianalüüs
Näidisnõuded ja kohaletoimetamine
Näidisnõuded:
SestDNA ekstraktid:
| Proovi tüüp | Summa | Keskendumine | Puhtus |
| DNA ekstraktid | ＞ 2 μg | ＞ 20 ng/μl | OD260/280 = 1,6-2,5 |
Koeproovide jaoks:
| Proovi tüüp | Soovitatav proovitöötlus | Näidiste ladustamine ja saatmine |
| Bakterid | Jälgige baktereid mikroskoobi all ja koguge baktereid nende eksponentsiaalses faasis Viige bakterikultuur (sisaldab umbes 3-4,5e9 rakku) 1,5 või 2 ml eppendorfi.(Hoia jääl) Tsentrifuugige katseklaasi 1 minut 14000 g juures, et koguda bakterid ja eemaldada ettevaatlikult supernatant Sulgege toru ja külmutage bakterid vedelas lämmastikus vähemalt 30 minutiks.Hoida tuubi -80 ℃ külmikus. | Külmutage proove vedelas lämmastikus 3-4 tunniks ja säilitage vedelas lämmastikus või -80 kraadises pikaajalises reservatsioonis.Näidis saatmine kuiva jääga on nõutav. |
Teeninduse töövoog
Näidiste kohaletoimetamine
Raamatukogu ehitus
Järjestus
Andmete analüüs
Müügijärgsed teenused
1.Circos of bakteri genoom
2. Kodeeriva geeni ennustamine
3. Võrdlev genoomika analüüs: fülogeneetiline puu
