Secuenciación de bisulfito de representación reducida (RRBS)
Especificaciones de servicio
Plataforma: plataforma NovaSeq, PE150
Tipo de biblioteca: biblioteca de ADN tratada con bisulfito con inserto de 200-400 pb
Estrategia de secuenciación: extremo emparejado 150 pb
Salida de datos recomendada: 10 Gb de datos sin procesar/muestra
Requisitos de muestra
Cantidad de ADN: ≥ 2ug
Concentración de ADN: ≥ 20 ng/μl.
Pureza: OD260/280 = 1,8 a 2,0 sin degradación ni contaminación de ARN
Análisis bioinformático
Flujo de trabajo del servicio
Entrega de muestra
construcción de biblioteca
Secuenciación
Análisis de los datos
Servicios postventa
a.Estadísticas de alineación del genoma de referencia.
Estadísticas de lecturas de mapeo
SEstadísticas de profundidad de secuenciación y cobertura del sitio C.
Acobertura acumulada
Deficiencia de digestión de cada muestra
b.Detección del sitio de metilación
Lista de niveles de metilación en el sitio C
Bconversión S
Mcitosina etilada
Distribución del nivel de metilación.
c.Mapa de metilación
Gtodo el enoma
Gelemento enoma
d.Comparación de niveles de metilación entre muestras.
PCorrelación aérea de la metilación de CG.
PMetilación de CA-CG
Cbrillo de la metilación CG
d.Análisis diferencial de metilación.
Sestadísticas de DMR
Distribución de longitud DMR
Hcomer mapa
DDistribución de MR en la región objetivo
