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Secuenciación de ARN de un solo núcleo
El avance en la captura de células individuales y la técnica de construcción de bibliotecas individuales combinadas con la secuenciación de alto rendimiento permite estudios de expresión génica célula por célula.Permite un análisis de sistemas más profundo y completo en poblaciones de células complejas, en el que evita en gran medida el enmascaramiento de su heterogeneidad al tomar el promedio de todas las células.
Sin embargo, algunas células no son adecuadas para convertirse en suspensiones unicelulares, por lo que se necesitan otros métodos de preparación de muestras (extracción del núcleo de los tejidos, es decir, el núcleo se extrae directamente de los tejidos o células y se prepara en una suspensión de un solo núcleo para una sola suspensión). secuenciación celular.
BMK proporciona un servicio de secuenciación de ARN unicelular basado en 10× Genomics ChromiumTM.Este servicio ha sido ampliamente utilizado en estudios relacionados con enfermedades, como diferenciación de células inmunes, heterogeneidad tumoral, desarrollo de tejidos, etc.
Chip transcriptoma espacial: 10× Genómica
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
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Transcriptoma espacial BMKMANU S1000
La transcriptómica espacial está a la vanguardia de la innovación científica y permite a los investigadores profundizar en intrincados patrones de expresión genética dentro de los tejidos preservando al mismo tiempo su contexto espacial.En medio de varias plataformas, BMKGene ha desarrollado el chip de transcriptoma espacial BMKManu S1000, que cuenta con unaresolución mejoradade 5 µM, alcanzando el rango subcelular, y permitiendoconfiguración de resolución multinivel.El chip S1000, que presenta aproximadamente 2 millones de puntos, emplea micropocillos en capas con perlas cargadas con sondas de captura con códigos de barras espaciales.Se prepara una biblioteca de ADNc, enriquecida con códigos de barras espaciales, a partir del chip S1000 y posteriormente se secuencia en la plataforma Illumina NovaSeq.La combinación de muestras con códigos de barras espaciales y UMI garantiza la precisión y especificidad de los datos generados.El atributo único del chip BMKManu S1000 radica en su versatilidad, ya que ofrece configuraciones de resolución de múltiples niveles que se pueden ajustar con precisión a diferentes tejidos y niveles de detalle.Esta adaptabilidad posiciona al chip como una excelente opción para diversos estudios de transcriptómica espacial, asegurando una agrupación espacial precisa con un ruido mínimo.
Utilizando el chip BMKManu S1000 y otras tecnologías de transcriptómica espacial, los investigadores pueden obtener una mejor comprensión de la organización espacial de las células y las complejas interacciones moleculares que ocurren dentro de los tejidos, proporcionando información invaluable sobre los mecanismos subyacentes a los procesos biológicos en una amplia gama de campos, incluyendo oncología, neurociencia, biología del desarrollo, inmunología y estudios botánicos.
Plataforma: chip BMKManu S1000 e Illumina NovaSeq
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Transcriptoma espacial 10x Genomics Visium
La transcriptómica espacial es una tecnología de vanguardia que permite a los investigadores investigar patrones de expresión genética dentro de los tejidos preservando al mismo tiempo su contexto espacial.Una plataforma poderosa en este dominio es 10x Genomics Visium junto con la secuenciación de Illumina.El principio de 10X Visium reside en un chip especializado con un área de captura designada donde se colocan secciones de tejido.Esta área de captura contiene puntos con códigos de barras, cada uno de los cuales corresponde a una ubicación espacial única dentro del tejido.Luego, las moléculas de ARN capturadas del tejido se etiquetan con identificadores moleculares únicos (UMI) durante el proceso de transcripción inversa.Estos puntos con códigos de barras y UMI permiten un mapeo espacial preciso y la cuantificación de la expresión genética con una resolución unicelular.La combinación de muestras con códigos de barras espaciales y UMI garantiza la precisión y especificidad de los datos generados.Al utilizar esta tecnología de transcriptómica espacial, los investigadores pueden obtener una comprensión más profunda de la organización espacial de las células y las complejas interacciones moleculares que ocurren dentro de los tejidos, ofreciendo información invaluable sobre los mecanismos subyacentes a los procesos biológicos en múltiples campos, incluida la oncología, la neurociencia, la biología del desarrollo y la inmunología. y estudios botánicos.
Plataforma: 10X Genomics Visium e Illumina NovaSeq
