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Secuenciación de inmunoprecipitación de cromatina (ChIP-seq)
ChIP-Seq proporciona perfiles de todo el genoma de objetivos de ADN para la modificación de histonas, factores de transcripción y otras proteínas asociadas al ADN.Combina la selectividad de la inmunoprecipitación de cromatina ChIP para recuperar complejos de proteína y ADN específicos con el poder de la secuenciación de próxima generación NGS para la secuenciación de alto rendimiento del ADN recuperado.Además, debido a que los complejos proteína-ADN se recuperan de células vivas, los sitios de unión se pueden comparar en diferentes tipos de células y tejidos, o en diferentes condiciones.Las aplicaciones van desde la regulación transcripcional hasta las vías de desarrollo, los mecanismos de las enfermedades y más.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
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Secuenciación Metagenómica -NGS
Metagenoma se refiere a una colección de material genético total de una comunidad mixta de organismos, como el metagenoma ambiental, el metagenoma humano, etc. Contiene genomas de microorganismos tanto cultivables como no cultivables.La secuenciación metagenómica es una herramienta molecular utilizada para analizar los materiales genómicos mixtos extraídos de muestras ambientales, que proporciona información detallada sobre la diversidad y abundancia de especies, estructura poblacional, relación filogenética, genes funcionales y red de correlación con factores ambientales.
Plataforma:Plataforma Illumina NovaSeq
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Secuenciación metagenómica-Nanopore
La metagenómica es una herramienta molecular utilizada para analizar los materiales genómicos mixtos extraídos de muestras ambientales, que proporciona información detallada sobre la diversidad y abundancia de especies, estructura poblacional, relación filogenética, genes funcionales y red de correlación con factores ambientales, etc. Recientemente se han introducido plataformas de secuenciación de nanoporos. a los estudios metagenómicos.Su excelente rendimiento en longitud de lectura mejoró en gran medida el análisis metagenómico posterior, especialmente el ensamblaje del metagenoma.Aprovechando las ventajas de la longitud de lectura, el estudio metagenómico basado en nanoporos puede lograr un ensamblaje más continuo en comparación con la metagenómica de escopeta.Se ha publicado que la metagenómica basada en nanoporos generó con éxito genomas bacterianos completos y cerrados a partir de microbiomas (Moss, EL, et. al,Biotecnología de la naturaleza, 2020)
Plataforma:Nanoporo PromethION P48
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Secuenciación del genoma completo con bisulfito.
La metilación del ADN en la quinta posición de la citosina (5-mC) tiene una influencia fundamental en la expresión génica y la actividad celular.Los patrones anormales de metilación se han asociado con varias afecciones y enfermedades, como el cáncer.WGBS se ha convertido en el estándar de oro para estudiar la metilación de todo el genoma con una resolución de base única.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
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Ensayo de cromatina accesible a transposasa con secuenciación de alto rendimiento (ATAC-seq)
ATAC-seq es un método de secuenciación de alto rendimiento para el análisis de la accesibilidad a la cromatina en todo el genoma, que es importante para el control epigenético global de la expresión genética.Los adaptadores de secuenciación se insertan en regiones abiertas de cromatina mediante la transposasa Tn5 hiperactiva.Después de la amplificación por PCR, se construye una biblioteca de secuenciación.Todas las regiones de cromatina abiertas se pueden obtener en unas condiciones espacio-temporales específicas, no limitadas sólo a los sitios de unión de un factor de transcripción o a una determinada región modificada con histonas.
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Secuenciación de amplicones 16S/18S/ITS-PacBio
La subunidad del ARNr 16S y 18S que contiene regiones altamente conservadas e hipervariables es una huella molecular perfecta para la identificación de organismos procarióticos y eucariotas.Aprovechando la secuenciación, estos amplicones pueden dirigirse en función de las partes conservadas y las regiones hipervariables pueden caracterizarse completamente para la identificación microbiana, contribuyendo a estudios que cubren análisis de diversidad microbiana, taxonomía, filogenia, etc. ) la secuenciación de la plataforma PacBio permite la obtención de lecturas largas de alta precisión, que podrían cubrir amplicones de longitud completa (aproximadamente 1,5 Kb).La visión más amplia del campo genético mejoró enormemente la resolución en la anotación de especies en la comunidad de bacterias u hongos.
Plataforma:PacBio Secuela II
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Secuenciación de amplicones 16S/18S/ITS-NGS
La secuenciación de amplicones 16S/18S/ITS tiene como objetivo revelar la filogenia, la taxonomía y la abundancia de especies en una comunidad microbiana mediante la investigación de productos de PCR de marcadores genéticos internos que contienen partes altamente conversadas e hipervariables.La introducción de estas huellas dactilares moleculares perfectas por Woeses et al, (1977) permite la elaboración de perfiles de microbiomas sin aislamiento.La secuenciación de 16S (bacterias), 18S (hongos) y espaciador transcrito interno (ITS, hongos) permite la identificación tanto de especies abundantes como de especies raras y no identificadas.Esta tecnología se ha convertido en una herramienta importante y ampliamente aplicada para identificar la composición microbiana diferencial en diversos entornos, como la boca humana, los intestinos, las heces, etc.
Plataforma:Plataforma Illumina NovaSeq
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Resecuenciación del genoma completo de bacterias y hongos
La resecuenciación del genoma completo de bacterias y hongos es una herramienta fundamental para completar los genomas de bacterias y hongos conocidos, así como para comparar múltiples genomas o mapear genomas de nuevos organismos.Es de gran importancia secuenciar genomas completos de bacterias y hongos para generar genomas de referencia precisos, realizar identificación microbiana y otros estudios genómicos comparativos.
Plataforma:Plataforma Illumina NovaSeq
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PacBio-Secuenciación de amplicones 16S/18S/ITS de longitud completa
La plataforma Amplicon (16S/18S/ITS) se desarrolla con años de experiencia en análisis de proyectos de diversidad microbiana, que contiene análisis básicos estandarizados y análisis personalizados: el análisis básico cubre el contenido de análisis principal de la investigación microbiana actual, el contenido del análisis es rico y completo. y los resultados del análisis se presentan en forma de informes de proyecto;El contenido del análisis personalizado es diverso.Se pueden seleccionar muestras y establecer parámetros de manera flexible de acuerdo con el informe de análisis básico y el propósito de la investigación, para cumplir con los requisitos personalizados.Sistema operativo Windows, sencillo y rápido.
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Transcriptoma completo de PacBio (sin referencia)
Tomando como entrada los datos de secuenciación de isoformas de Pacific Biosciences (PacBio), esta aplicación puede identificar secuencias de transcripción completas (sin ensamblaje).Al mapear secuencias de longitud completa con respecto al genoma de referencia, las transcripciones se pueden optimizar mediante genes, transcripciones, regiones codificantes, etc. conocidos. En este caso, se puede lograr una identificación más precisa de las estructuras del ARNm, como el empalme alternativo, etc.El análisis conjunto con datos de secuenciación del transcriptoma NGS permite una anotación más completa y una cuantificación más precisa en la expresión a nivel de transcripción, lo que beneficia en gran medida la expresión diferencial y el análisis funcional posteriores.
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Secuenciación de bisulfito de representación reducida (RRBS)
La investigación sobre la metilación del ADN siempre ha sido un tema candente en la investigación de enfermedades y está estrechamente relacionada con la expresión genética y los rasgos fenotípicos.RRBS es un método preciso, eficiente y económico para la investigación de la metilación del ADN.El enriquecimiento del promotor y de las regiones insulares CpG mediante escisión enzimática (Msp I), combinado con secuenciación con bisulfito, proporciona una detección de metilación del ADN de alta resolución.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
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Secuenciación de ARNm procariótico
La secuenciación de ARNm permite la elaboración de perfiles completos de todas las transcripciones de ARNm dentro de las células en condiciones específicas.Esta tecnología de vanguardia sirve como una herramienta potente, que revela intrincados perfiles de expresión genética, estructuras genéticas y mecanismos moleculares asociados con diversos procesos biológicos.Ampliamente adoptada en la investigación fundamental, el diagnóstico clínico y el desarrollo de fármacos, la secuenciación de ARNm ofrece información sobre las complejidades de la dinámica celular y la regulación genética.Nuestro procesamiento de muestras de ARNm procariótico está diseñado para transcriptomas procarióticos, lo que implica el agotamiento del ARNr y la preparación de bibliotecas direccionales.
Plataforma: Illumina NovaSeq X
