Mapa de calor
El archivo de datos matriciales se utiliza para dibujar mapas de calor, que pueden filtrar, normalizar y agrupar datos matriciales.Se utiliza principalmente para análisis de conglomerados del nivel de expresión genética entre diferentes muestras.
Anotación genética
La anotación de la función genética se realiza mapeando secuencias en un archivo FASTA con varias bases de datos.
Anotación genética
Herramienta básica de búsqueda de alineación local
CDS_UTR_Predicción
Esta herramienta está diseñada para predecir regiones codificantes (CDS) y regiones no codificantes (UTR) en secuencias de transcripción determinadas basándose en la explosión de bases de datos de proteínas conocidas y la predicción de ORF.
Parcela de Manhattan
El gráfico de Manhattan permite la visualización de datos con una gran cantidad de puntos de datos.Se utiliza habitualmente en estudios de asociación de todo el genoma (GWAS).
circo
El diagrama CIRCOS permite la presentación directa de las distribuciones de SNP, InDeL, SV y CNV en el genoma.
GO_Enriquecimiento
TopGO es una herramienta diseñada para el enriquecimiento funcional.El paquete TopGO-Bioconductor consta de análisis de expresión diferencial, análisis de enriquecimiento de GO y visualización de los resultados.Generará una carpeta con resultados llamados "Gráfico", que contiene resultados para topGO_BP, topGO_CC y topGO_MF.
WGCNA
WGCNA es un método de extracción de datos ampliamente utilizado para descubrir módulos de coexpresión de genes.Es aplicable a varios conjuntos de datos de expresión, incluidos datos de microarrays y datos de expresión génica originados a partir de secuenciación de próxima generación.
InterProScan
Análisis y clasificación de secuencias de proteínas InterPro.
GO_KEGG_Enriquecimiento
Esta herramienta está diseñada para generar un histograma de enriquecimiento GO, un histograma de enriquecimiento KEGG y una vía de enriquecimiento KEGG según el conjunto de genes proporcionado y la anotación correspondiente.