Reflejos
En este seminario web de dos horas, es un gran honor para nosotros haber invitado a seis expertos en el campo de la genómica de cultivos.Nuestros oradores darán una interpretación en profundidad de dos estudios genómicos de Rye, que se publicaron recientemente enGenética de la naturaleza:
1. El ensamblaje del genoma a escala cromosómica proporciona información sobre la biología, la evolución y el potencial agronómico del centeno
2. Un ensamblaje genómico de alta calidad resalta las características genómicas del centeno y los genes agronómicamente importantes
Además, nos complace contar con un científico senior de investigación y desarrollo de Biomarker Technologies para compartir su experiencia en el ensamblaje del genoma de novo.
Agenda
09:00 CET
Palabras de bienvenida
Zheng Hong Kun
Fundador y director ejecutivo de tecnologías de biomarcadores
Deng Xing Wang
Presidente, Facultad de Ciencias Agrícolas Avanzadas Universidad de Pekín
09:15 am
Mejora del centeno, el triticale y el trigo mediante el uso de una secuencia genómica de referencia de alta calidad
En este seminario web, el profesor Wang nos brindó actualizaciones generales sobre el estado actual de la investigación genómica de las triticeae y demostró el éxito y los avances de los dos trabajos destacados sobre los estudios del genoma del centeno, que se publicaron recientemente en Nature Genetics y presentan toda la investigación. grupos liderando y contribuyendo en las obras.
09:25 am
Genómica de cereales @ IPK Gatersleben
Los pastos de cereales de la tribu Triticeae han sido una importante fuente de alimento en las regiones templadas, que durante mucho tiempo se han considerado un punto importante para la mejora y el mejoramiento de cultivos.Entre todas las especies cultivadas, esta tribu es famosa por sus características genómicas extremadamente complejas, incluidos genomas de gran tamaño, alto contenido de TE, poliploidía, etc. En esta sesión, el Prof. Nils Stein nos dio una introducción general sobre IPK Gatersleben y el estado actual de los cereales. investigación genómica@IPK Gatersleben.
09:35 am
El ensamblaje del genoma a escala cromosómica proporciona información sobre la biología, la evolución y el potencial agronómico del centeno
Dr. M. Timothy Rabanus-Wallace, Instituto Leibniz de Genética Vegetal e Investigación de Planes de Cultivos (IPK)El centeno (Secale cereale L.) es un cultivo de cereales excepcionalmente resistente al clima, que se utiliza ampliamente para producir variedades mejoradas de trigo mediante hibridación introgresiva y que posee todo el repertorio de genes necesarios para permitir el mejoramiento híbrido.El centeno es alógamo y ha sido domesticado recientemente, lo que da a los centenos cultivados acceso a un acervo genético silvestre diverso y explotable.Para mejorar aún más el potencial agronómico del centeno, produjimos un ensamblaje anotado a escala cromosómica del genoma del centeno de 7,9 Mbp y validamos ampliamente su calidad utilizando un conjunto de recursos genéticos moleculares.Demostramos aplicaciones de este recurso con una amplia gama de investigaciones.Presentamos hallazgos sobre el aislamiento genético incompleto del centeno cultivado de sus parientes silvestres, los mecanismos de evolución estructural del genoma, la resistencia a patógenos, la tolerancia a las bajas temperaturas, los sistemas de control de la fertilidad para el mejoramiento híbrido y los beneficios de rendimiento de las introgresiones entre centeno y trigo.
10:05 am
Un ensamblaje genómico de alta calidad destaca las características genómicas del centeno y los genes agronómicamente importantes
El centeno es un valioso cultivo alimentario y forrajero, un recurso genético importante para el mejoramiento del trigo y el triticale, y un material indispensable para estudios genómicos comparativos eficientes en gramíneas.Aquí, secuenciamos el genoma del centeno Weining, una variedad de centeno chino de élite.Los contigs ensamblados (7,74 Gb) representaron el 98,47% del tamaño estimado del genoma (7,86 Gb), con el 93,67% de los contigs (7,25 Gb) asignados a siete cromosomas.Los elementos repetitivos constituyeron el 90,31% del genoma ensamblado.En comparación con los genomas de Triticeae previamente secuenciados, los retrotransposones de Daniela, Sumaya y Sumana mostraron una fuerte expansión en el centeno.Análisis adicionales del ensamblaje de Weining arrojan nueva luz sobre las duplicaciones de genes en todo el genoma y su impacto en los genes de biosíntesis de almidón, las organizaciones físicas de loci de prolamina complejos, las características de expresión genética subyacentes al rasgo de encabezado temprano y las supuestas regiones cromosómicas y loci asociados a la domesticación en el centeno.Esta secuencia del genoma promete acelerar los estudios genómicos y de mejoramiento del centeno y cultivos de cereales relacionados.
10:35 am
Retos, soluciones y futuro del ensamblaje del genoma de novo
Un genoma de alta calidad es la base del estudio genómico.Aunque el rápido desarrollo de la secuenciación y los algoritmos ha permitido un ensamblaje del genoma mucho más simple y eficiente, los requisitos en cuanto a precisión e integridad del ensamblaje también están aumentando a medida que se profundizan los objetivos de la investigación.En esta charla discutiré las tecnologías populares actuales en el ensamblaje del genoma con varios casos exitosos y echaré un vistazo al desarrollo futuro.
Hora de publicación: 08-ene-2022