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Secuenciación de transcriptomas de longitud completa basada en nanoporos

La secuenciación por nanoporos se distingue de otras plataformas de secuenciación en que los nucleótidos se leen directamente sin síntesis de ADN y genera lecturas largas a decenas de kilobases.Esto permite la lectura directa de transcripciones completas y abordar los desafíos en los estudios transcriptómicos.

√ Bajo sesgo específico de secuencia

√ Lectura completa de ADNc para estudios de estructura genética

√ Se requieren menos datos para cubrir la misma cantidad de expedientes académicos

√ Identificación de múltiples isoformas por gen.

√ Cuantificación de expresiones a nivel de isoformas

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Tubería típica de bioinformática

Trans-bix-1024x254 de larga duración

Últimos casos de éxito con tecnologías de biomarcadores

1. Los análisis comparativos de transcriptomas completos revelan la dinámica de desarrollo del tallo de Gnetum luofuense

Revista: Fronteras en genética

Publicado: marzo de 2021

Palabras clave: MiniÓN |Empalme alternativo |APA |ARNnc |Transcripciones expresadas diferencialmente

Leer texto completo

2. Movimiento unidireccional de pequeños ARN desde brotes a raíces en heteroinjertos interespecíficos

Diario: Plantas de la naturaleza

Publicado: enero de 2021

Palabras clave: Nanoporo |iluminar |detección móvil de ARNm de longitud completa

3. El análisis completo del transcriptoma de raíces de espárragos revela el mecanismo molecular de la tolerancia a la sal inducida por hongos micorrízicos arbusculares

Revista: Botánica Ambiental y Experimental

Publicado: enero de 2021

Palabras clave: MiniÓN |Transcripciones expresadas diferencialmente |Factores de transcripción |Splicing alternativo

4. Cambios característicos fisiológicos y transcriptoma completo de raíces y hojas de rosa (Rosa chinensis) en respuesta al estrés por sequía

Revista: Fisiología vegetal y celular

Publicado: octubre de 2020

Palabras clave: PromethION |Transcripciones expresadas diferencialmente |Predicción funcional |Isoformas empalmadas |TF y ARNc

5. Análisis y comparación integral de PacBio y secuenciación de ARN basada en nanoporos del transcriptoma de Arabidopsis

Diario: Método de la planta

Publicado: abril de 2020

Palabras clave: GridION |PromethION |Secuela de PacBio |Illumina NovaSeq |Alineación del genoma |Identificación de transcripción |Empalme alternativo |RSS |ARNnc |Cuantificación de isoformas

Noticias y destacados tiene como objetivo compartir los últimos casos exitosos con Biomarker Technologies, capturando logros científicos novedosos, así como técnicas destacadas aplicadas durante el estudio.


Hora de publicación: 08-ene-2022

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