Secuenciación de transcriptomas de longitud completa basada en nanoporos
La secuenciación por nanoporos se distingue de otras plataformas de secuenciación en que los nucleótidos se leen directamente sin síntesis de ADN y genera lecturas largas a decenas de kilobases.Esto permite la lectura directa de transcripciones completas y abordar los desafíos en los estudios transcriptómicos.
√ Bajo sesgo específico de secuencia
√ Lectura completa de ADNc para estudios de estructura genética
√ Se requieren menos datos para cubrir la misma cantidad de expedientes académicos
√ Identificación de múltiples isoformas por gen.
√ Cuantificación de expresiones a nivel de isoformas
Tubería típica de bioinformática
Últimos casos de éxito con tecnologías de biomarcadores
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Revista: Fronteras en genética
Publicado: marzo de 2021
Palabras clave: MiniÓN |Empalme alternativo |APA |ARNnc |Transcripciones expresadas diferencialmente
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Diario: Plantas de la naturaleza
Publicado: enero de 2021
Palabras clave: Nanoporo |iluminar |detección móvil de ARNm de longitud completa
3. El análisis completo del transcriptoma de raíces de espárragos revela el mecanismo molecular de la tolerancia a la sal inducida por hongos micorrízicos arbusculares
Revista: Botánica Ambiental y Experimental
Publicado: enero de 2021
Palabras clave: MiniÓN |Transcripciones expresadas diferencialmente |Factores de transcripción |Splicing alternativo
4. Cambios característicos fisiológicos y transcriptoma completo de raíces y hojas de rosa (Rosa chinensis) en respuesta al estrés por sequía
Revista: Fisiología vegetal y celular
Publicado: octubre de 2020
Palabras clave: PromethION |Transcripciones expresadas diferencialmente |Predicción funcional |Isoformas empalmadas |TF y ARNc
5. Análisis y comparación integral de PacBio y secuenciación de ARN basada en nanoporos del transcriptoma de Arabidopsis
Diario: Método de la planta
Publicado: abril de 2020
Palabras clave: GridION |PromethION |Secuela de PacBio |Illumina NovaSeq |Alineación del genoma |Identificación de transcripción |Empalme alternativo |RSS |ARNnc |Cuantificación de isoformas
Noticias y destacados tiene como objetivo compartir los últimos casos exitosos con Biomarker Technologies, capturando logros científicos novedosos, así como técnicas destacadas aplicadas durante el estudio.
Hora de publicación: 08-ene-2022