MICROBIANO
La compatibilidad bacteriana y la inmovilización con biocarbón mejoraron la degradación del tebuconazol, la composición y el funcionamiento del microbioma del suelo
Secuenciación completa de amplicones 16S |PacBio alta fidelidad |Diversidad alfa |Diversidad beta
En este estudio, Biomarker Technologies proporcionó la secuenciación completa del amplicón 16S mediante PacBio y el análisis bioinformático.
Reflejos
Se estudió la eficiencia de la biodegradación y los efectos en el suelo contaminado con tebuconazol en comparación con la cepa de degradación libre WZ-2.
1. El WZ-2 inmovilizado con biocarbón mostró una degradación más eficiente del tebuconazol en comparación con el WZ-2 libre al reducir la vida media del tebuconazol en el suelo de 18,7 días a 13,3 días.
2. Los WZ-2 inmovilizados con biocarbón pudieron restaurar las actividades enzimáticas microbianas nativas del suelo, incluidas la ureasa, la deshidrogenasa y la invertasa, etc.
3. El perfil microbiano en suelo tratado con WZ-2 inmovilizado con biocarbón determinado mediante secuenciación completa de 16S apoyó firmemente que este sistema podría restaurar la salud del suelo al mejorar la estructura de la comunidad bacteriana bajo contaminación por tebuconazol.
Experimento (relacionado con la secuenciación)
Agrupación: CK: Suelo natural;T: Suelo enriquecido con tebuconazol;S: Tebuconazol contenía suelo con cepa libre WZ-2;BC: Tebuconazol contenía suelo con biocarbón;BCS: Tebuconazol contenía suelo con biocarbón WZ-2 inmovilizado.
Muestreo: extracción total de ADN del suelo amplificada por cebadores de ADNr 16S
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) y 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),que representa el ADNr 16S de longitud completa
Plataforma de secuenciación: PacBio RS II
Estrategia de secuenciación: lecturas CCS HIFI
Análisis de los datos:BMKNubeLas plataformas bioinformáticas hacen de los peces dorados un excelente sistema modelo genético para la fisiología y evolución de los peces.
Resultado
La estructura de la comunidad microbiana del suelo se determinó mediante secuenciación del ADNr 16S.Se evaluaron la riqueza de OTU y el índice de diversidad alfa, incluidos los índices Chao1, Ace, Shannon y Simpson, para revelar la diversidad de especies en cada sistema.Después de 60 días de incubación, todos los índices mostraron una tendencia similar, es decir, el tebuconazol podría inducir una reducción en la riqueza y diversidad de especies en el suelo.Sin embargo, al añadir la cepa WZ-2, la comunidad de bacterias del suelo se recuperó parcialmente en términos de riqueza y diversidad.Se observó una diferencia limitada entre BC, BCS y CK, lo que indica que el biocarbón y el WZ-2 inmovilizado con biocarbón podrían restaurar eficazmente la salud biológica del suelo.
En este estudio se aplicó el método de grupos de pares no ponderados con medias aritméticas (UPGMA) para mostrar la diversidad beta entre los grupos.Como se muestra en la siguiente figura, BC, BSC y CK compartieron un patrón más similar de composición microbiana en comparación con los grupos T y S, lo que indicó además que la introducción de biocarbón en la biorremediación de suelos contaminados con tebuconazol podría facilitar en gran medida la recuperación de la comunidad microbiana en el suelo.
Cifra.Agrupación UPGMA de la comunidad bacteriana a nivel de filo bajo diferentes tratamientos
Referencia
Sun, Tong y col."La compatibilidad bacteriana y la inmovilización con biocarbón mejoraron la degradación del tebuconazol, la composición y el funcionamiento del microbioma del suelo".Diario de materiales peligrosos398 (2020): 122941.
Noticias y destacados tiene como objetivo compartir los últimos casos exitosos con Biomarker Technologies, capturando logros científicos novedosos, así como técnicas destacadas aplicadas durante el estudio.
Hora de publicación: 08-ene-2022