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proteómica
La proteómica implica las aplicaciones de tecnologías para la cuantificación del contenido total de proteínas presentes en una célula, tejido u organismo.Las tecnologías basadas en la proteómica se utilizan en diversas capacidades para diferentes entornos de investigación, como la detección de diversos marcadores de diagnóstico, candidatos para la producción de vacunas, la comprensión de los mecanismos de patogenicidad, la alteración de los patrones de expresión en respuesta a diferentes señales y la interpretación de vías de proteínas funcionales en diferentes enfermedades.En la actualidad, las tecnologías de proteómica cuantitativa se dividen principalmente en estrategias cuantitativas TMT, Label Free y DIA.
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Metabolómica
El metaboloma es el producto terminal del genoma y consiste en el complemento total de todas las moléculas de bajo peso molecular (metabolitos) en una célula, tejido u organismo.La metabolómica tiene como objetivo medir una amplia gama de moléculas pequeñas en el contexto de estímulos fisiológicos o estados patológicos.Las metodologías de metabolómica se dividen en dos grupos distintos: metabolómica no dirigida, un análisis exhaustivo previsto de todos los analitos medibles en una muestra, incluidas sustancias químicas desconocidas mediante GC-MS/LC-MS, y metabolómica dirigida, la medición de grupos definidos de sustancias químicamente caracterizadas y Metabolitos bioquímicamente anotados.
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Análisis segregante masivo
El análisis segregante masivo (BSA) es una técnica empleada para identificar rápidamente marcadores genéticos asociados al fenotipo.El flujo de trabajo principal de BSA consiste en seleccionar dos grupos de individuos con fenotipos extremadamente opuestos, combinar el ADN de todos los individuos para formar dos grupos de ADN e identificar secuencias diferenciales entre dos grupos.Esta técnica se ha empleado ampliamente en la identificación de marcadores genéticos fuertemente asociados con genes específicos en genomas de plantas y animales.
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Secuenciación de ADN/ARN – Secuenciador de nanoporos
La secuenciación ONT es una tecnología de secuenciación de señales eléctricas en tiempo real de una sola molécula basada en nanoporos; el principio de secuenciación de cada plataforma es el mismo.El ADN/ARN de doble hebra se unirá a la proteína nanoporosa incrustada en la biopelícula y se desenrollará bajo la dirección de la proteína motora. Bajo la acción de la diferencia de voltaje de ambos lados de la biopelícula, las hebras de ADN/ARN pasan a través de la proteína del canal de nanoporo a una cierta tasa.Debido a las diferencias en las propiedades químicas de las diferentes bases en la cadena de ADN/ARN, cuando una sola base o molécula de ADN pasa a través del canal de nanoporos, provocará el cambio de diferentes señales eléctricas.Al detectar y corresponder a estas señales, se pueden calcular los tipos de bases correspondientes y se puede completar la detección en tiempo real de la secuencia.
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Secuenciación de ADN/ARN -PacBio Sequencer
La plataforma de secuenciación PacBio es una plataforma de secuenciación de lectura larga, que también se conoce como una de las tecnologías de secuenciación de tercera generación (TGS).La tecnología central, SMRT, permite la generación de lecturas con decenas de kilobases de longitud.Sobre la base de la "secuenciación por síntesis", la resolución de un solo nucleótido se logra mediante una guía de ondas de modo cero (ZMW), donde solo se ilumina un volumen limitado en la parte inferior (sitio de síntesis de la molécula).Además, la secuenciación SMRT evita en gran medida el sesgo específico de secuencia en el sistema NGS, ya que la mayoría de los pasos de amplificación por PCR no son necesarios en el proceso de construcción de la biblioteca.
Plataforma: Secuela II, Revio
