BMKGENE proporcionó servicios de secuenciación espacial del transcriptoma para el estudio "STEEL permite la delineación de alta resolución de datos transcriptómicos espaciotemporales", que se publicó en Briefings in Bioinformatics.
Este estudio propuso un algoritmo múltiple y no supervisado basado en el aprendizaje, la agrupación de tipo cEll de transcriptoma espacial (STEEL), que identifica dominios del transcriptoma espacial agrupando cuentas que exhiben perfiles de expresión genética muy similares y una distancia espacial cercana en forma de gráficos.
Una evaluación exhaustiva de STEEL en conjuntos de datos transcriptómicos espaciales de la plataforma 10X Visium demuestra que no solo logra una alta resolución para caracterizar estructuras finas del cerebro del ratón, sino que también permite la integración de múltiples portaobjetos de tejido analizados individualmente en uno más grande.
Con el avance de las tecnologías de transcriptoma espacial, nuestro método tendrá una gran aplicabilidad en la identificación de dominios y la reconstrucción de atlas de expresión génica.
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Hora de publicación: 20 de octubre de 2023