Malgranda RNA-sekvencado-Illumina
Trajtoj
● Grandeca elekto de RNA antaŭ biblioteka preparado
● Bioinformatika analizo centrita ĉirkaŭ miRNA-prognozo kaj iliaj celoj
Servaj Avantaĝoj
●Ampleksa bioinformatika analizo:ebligante la identigon de kaj konataj kaj novaj miRNAoj, identigo de miRNA-celoj kaj ekvivalenta funkcia komentario kaj riĉigo kun multoblaj datumbazoj (KEGG, GO)
●Rigora Kvalita Kontrolo: ni efektivigas kernajn kontrolpunktojn tra ĉiuj stadioj, de specimena kaj biblioteka preparo ĝis sekvencado kaj bioinformadiko.Ĉi tiu zorgema monitorado certigas la liveron de konstante altkvalitaj rezultoj.
●Postvenda Subteno: Nia devontigo etendiĝas preter la kompletiĝo de la projekto kun 3-monata post-venda servoperiodo.Dum ĉi tiu tempo, ni ofertas projektan sekvadon, helpon pri solvo de problemoj kaj sesiojn pri demandoj kaj respondoj por trakti demandojn rilate al la rezultoj.
●Vasta Sperto: kun rekordo de sukcese fermado de multoblaj sRNA-projektoj kovrantaj pli ol 100 speciojn en diversaj esploraj domajnoj, nia teamo alportas riĉecon da sperto al ĉiu projekto.
Specimenaj Postuloj kaj Livero
| Biblioteko | Platformo | Rekomenditaj datumoj | Datumoj QC |
| Grando elektita | Illumina SE50 | 10M-20M legas | Q30≥85% |
Ekzemplaj Postuloj:
Nukleotidoj:
| Konk. (ng/μl) | Kvanto (μg) | Pureco | Integreco |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Limigita aŭ neniu proteino aŭ DNA-poluado montrita sur ĝelo. | RIN≥6.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; limigita aŭ neniu bazlinia alteco |
● Plantoj:
Radiko, Tigo aŭ Petalo: 450 mg
Folio aŭ Semo: 300 mg
Frukto: 1,2 g
● Besto:
Koro aŭ Intesto: 450 mg
Intestoj aŭ Cerbo: 240 mg
Muskolo: 600 mg
Ostoj, Haro aŭ Haŭto: 1,5 g
● Artropodoj:
Insektoj: 9 g
Krustacoj: 450 mg
● Tuta sango: 2 tuboj
● Ĉeloj: 106 ĉeloj
● Serumo kaj Plasmo:6 ml
Rekomendita Specimena Livero
Ujo:
2 ml centrifuga tubo (Stana folio ne rekomendas)
Ekzempla etikedado: Grupo+replikato ekz. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Sendado:
1.Seka glacio: Specimenoj devas esti pakitaj en sakoj kaj enterigitaj en seka glacio.
2.RNAstable-tuboj: RNA-provaĵoj povas esti sekigitaj en RNA-stabiliga tubo (ekz. RNAstable®) kaj senditaj en ĉambra temperaturo.
Serva Laborfluo
Eksperimenta dezajno
Specimena livero
RNA-eltiro
Bibliotekokonstruo
Sekvencado
Analizo de datumoj
Post-vendaj servoj
Bioinformadiko
Identigo de miRNA: strukturo kaj profundo
Diferenciga esprimo de miRNA - hierarkia clustering
Funkcia komentario de celo de diferencige esprimitaj miRNAoj
Esploru la esplorajn progresojn faciligitaj de sRNA-sekvencaj servoj de BMKGene per vikariita kolekto de publikaĵoj.
Chen, H. et al.(2023) "Viralaj infektoj malhelpas saponin-biosintezon kaj fotosintezon en Panax notoginseng", Plant Physiology and Biochemistry, 203, p.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al.(2023) 'La planto FYVE-domajna proteino FREE1 asocias kun mikroprocesoraj komponantoj por subpremi miRNA-biogenezon', EMBO-raportoj, 24 (1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) 'The MicroRNA Ame-Bantam-3p Controls Larval Pupal Development by Targeting the Multiple Epidermal Growth Factor-like Domains 8 Gene (megf8) in the Honeybee, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24 (6), p. .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al.(2018) 'Integra Analizo de MiRNA kaj Genoj Asociitaj kun Viandkvalito Rivelas, ke Gga-MiR-140-5p Affects Intramuscular Fat Deposition in Chickens', Ĉela Fiziologio kaj Biokemio, 46 (6), pp 2421–2433.doi: 10.1159/000489649.
