Ununuklea RNA-sekvencado

La antaŭeniĝo en unuĉela kaptado kaj individua biblioteka konstrutekniko kombinanta kun alt-trafia sekvencado permesas genekspresion studojn sur ĉel-post-ĉela bazo.Ĝi ebligas pli profundan kaj kompletan sisteman analizon pri kompleksaj ĉelpopulacioj, en kiuj ĝi plejparte evitas maskadon de ilia heterogeneco per mezumo de ĉiuj ĉeloj.

Tamen, iuj ĉeloj ne taŭgas por esti transformitaj en unuĉelan suspendon, do aliaj specimenaj preparmetodoj - kernekstraktado estas necesa el histoj, tio estas, nukleo estas rekte ĉerpita el histoj aŭ ĉelo kaj preparita en unukernsuspendo por unu-kerno. ĉelsekvenco.

BMK disponigas 10× Genomics ChromiumTM bazitan unuĉelan RNA-sekvencan servon.Ĉi tiu servo estis vaste uzata en studoj pri malsano rilataj studoj, kiel imunĉela diferencigo, tumora heterogeneco, histo-disvolviĝo ktp.

Spaca transkriptompeceto: 10× Genomics

Platformo: Platformo Illumina NovaSeq

Kontaktu Nin

Servaj Detaloj

Bioinformadiko

Demo Rezultoj

Teknika principo

La izolado de nukleoj estas atingita per 10× Genomics ChromiumTM, kiu konsistas ok-kanala mikrofluidika sistemo kun duoblaj krucoj.En ĉi tiu sistemo, ĝelaj bidoj kun strekkodoj kaj enkonduko, enzimoj kaj ununura kerno estas enkapsuligitaj en nanolitro-granda oleo-guto, generante Gel Bead-in-Emulsion (GEM).Post kiam GEMO estas formita, ĉellizo kaj liberigo de strekkodoj estas faritaj en ĉiu GEMO.mRNA estas inverse transskribita en cDNA-molekulojn kun 10× strekkodoj kaj UMI, kiuj estas plue kondiĉigitaj de norma sekvenca bibliotekkonstruo.

Histo ne taŭga por preparado de unuĉela suspendo

Ĉelo / histo	Kialo
Nefreŝa frostita histo	Ne eblas akiri freŝajn aŭ longe konservitajn organizojn
Muskola ĉelo, Megakariocito, Graso...	Ĉela diametro estas tro granda por eniri la instrumenton
Hepato…	Tro fragila por rompi, nekapabla distingi ununurajn ĉelojn
Neŭrona ĉelo, Cerbo...	Pli sentema, facile stresebla, ŝanĝos la sinsekvajn rezultojn
Pankreato, Tiroido...	Riĉa je endogenaj enzimoj, influante la produktadon de unuĉela suspendo

Ununuklea vs Unuĉela

Ununukleo	Unuĉela
Senlima ĉela diametro	Ĉela diametro: 10-40 μm
La materialo povas esti frostigita histo	La materialo devas esti freŝa ŝtofo
Malalta streso de frostaj ĉeloj	Enzima traktado povas kaŭzi ĉelan streĉan reagon
Neniuj ruĝaj globuloj devas esti forigitaj	Ruĝaj globuloj devas esti forigitaj
Nuklea esprimas bioinformon	La tuta ĉelo esprimas bioinformon