-
Ununuklea RNA-sekvencado
La antaŭeniĝo en unuĉela kaptado kaj individua biblioteka konstrutekniko kombinanta kun alt-trafia sekvencado permesas genekspresion studojn sur ĉel-post-ĉela bazo.Ĝi ebligas pli profundan kaj kompletan sisteman analizon pri kompleksaj ĉelpopulacioj, en kiuj ĝi plejparte evitas maskadon de ilia heterogeneco per mezumo de ĉiuj ĉeloj.
Tamen, iuj ĉeloj ne taŭgas por esti transformitaj en unuĉelan suspendon, do aliaj specimenaj preparmetodoj - kernekstraktado estas necesa el histoj, tio estas, nukleo estas rekte ĉerpita el histoj aŭ ĉelo kaj preparita en unukernsuspendo por unu-kerno. ĉelsekvenco.
BMK disponigas 10× Genomics ChromiumTM bazitan unuĉelan RNA-sekvencan servon.Ĉi tiu servo estis vaste uzata en studoj pri malsano rilataj studoj, kiel imunĉela diferencigo, tumora heterogeneco, histo-disvolviĝo ktp.
Spaca transkriptompeceto: 10× Genomics
Platformo: Platformo Illumina NovaSeq
-
Planto/Besto Tuta Genaro Sekvencado
Tuta genar-resekvencado, ankaŭ konata kiel WGS, ebligas la riveladon de kaj oftaj kaj maloftaj mutacioj sur la tuta genaro inkluzive de Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure-vario (SV), kaj Copy Number Variation (CNV). ).SVoj konsistigas pli grandan parton de la variadbazo ol SNPoj kaj havas pli grandan efikon al la genaro, kiu havas signifan efikon al vivantaj organismoj.Long-lega resekvencado permesas pli precizan identigon de grandaj fragmentoj kaj komplikajn variojn ĉar longaj legadoj multe faciligas kromosoman krucadon super komplikaj regionoj kiel tandemripetoj, GC/AT-riĉaj regionoj kaj hiper-variaj regionoj.
Platformo: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spaca Transcriptome
Spaca transcriptomics staras ĉe la avangardo de scienca novigado, rajtigante esploristojn enprofundiĝi en malsimplajn genesprimopadronojn ene de histoj konservante ilian spacan kuntekston.Inter diversaj platformoj, BMKGene evoluigis la BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip, fanfaronante priplibonigita rezoluciode 5µM, atingante la subĉelan intervalon, kaj ebliganteplurnivelaj rezoluciaj agordoj.La blato S1000, havanta proksimume 2 milionojn da makuloj, uzas mikroputojn tavoligitajn per bidoj ŝarĝitaj per space strekkoditaj kaptaj sondiloj.cDNA-biblioteko, riĉigita per spacaj strekkodoj, estas preparita de la S1000-peceto kaj poste sekvencita sur la Illumina NovaSeq-platformo.La kombinaĵo de space strekkoditaj provaĵoj kaj UMI-oj certigas la precizecon kaj specifecon de la datenoj generitaj.La unika atributo de la blato BMKManu S1000 kuŝas en sia ĉiuflankeco, ofertante plurnivelajn rezoluciajn agordojn, kiuj povas esti fajne agorditaj al malsamaj histoj kaj niveloj de detalo.Tiu adaptebleco poziciigas la peceton kiel elstara elekto por diversspecaj spacaj transcriptomics studoj, certigante precizan spacan amasiĝon kun minimuma bruo.
Uzante la BMKManu S1000-peceton kaj aliajn spacajn transkriptomicajn teknologiojn, esploristoj povas akiri pli bonan komprenon de la spaca organizo de ĉeloj kaj la kompleksaj molekulaj interagoj kiuj okazas ene de histoj, disponigante valoregajn sciojn pri la mekanismoj subestaj biologiaj procezoj en larĝa gamo de kampoj, inkluzive de. onkologio, neŭroscienco, evolubiologio, imunologio kaj botanikaj studoj.
Platformo: blato BMKManu S1000 kaj Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Spaca transcriptomics estas avangarda teknologio kiu permesas al esploristoj esplori gen-esprimpadronojn ene de histoj konservante ilian spacan kuntekston.Unu potenca platformo en ĉi tiu domajno estas 10x Genomics Visium kunligita kun Illumina-sekvencado.La principo de 10X Visium kuŝas sur speciala blato kun elektita kapta areo kie histosekcioj estas metitaj.Tiu kaptareo enhavas strekkoditajn punktojn, ĉiu egalrilatante al unika spaca loko ene de la histo.La kaptitaj RNA-molekuloj de la histo tiam estas etikeditaj kun unikaj molekulaj identigiloj (UMI) dum la inversa transskriba procezo.Tiuj strekkoditaj punktoj kaj UMIoj ebligas precizan spacan mapadon kaj kvantigon de genekspresio ĉe unuĉela rezolucio.La kombinaĵo de space strekkoditaj provaĵoj kaj UMI-oj certigas la precizecon kaj specifecon de la datenoj generitaj.Uzante ĉi tiun Spatial Transcriptomics-teknologion, esploristoj povas akiri pli profundan komprenon pri la spaca organizo de ĉeloj kaj la kompleksaj molekulaj interagoj okazantaj ene de histoj, ofertante valoregajn sciojn pri la mekanismoj subestaj biologiaj procezoj en multoblaj kampoj, inkluzive de onkologio, neŭroscienco, evolubiologio, imunologio. , kaj botanikaj studoj.
Platformo: 10X Genomics Visium kaj Illumina NovaSeq
-
Plenlonga mRNA Sequencing-Nanopore
Dum NGS-bazita mRNA-sekvencado funkcias kiel multflanka ilo por genekspresio-kvantigo, ĝia dependeco de mallongaj legadoj limigas sian efikecon en kompleksaj transcriptomaj analizoj.Nanoporsekvencado, aliflanke, utiligas long-legatan teknologion, ebligante la sekvencadon de plenlongaj mRNA-transskribaĵoj.Tiu aliro faciligas ampleksan esploradon de alternativa splisado, genfuzioj, poli-adeniligo, kaj la kvantigon de mRNA-izoformoj.
Nanoporsekvencado dependas de nanoporaj unu-molekulaj realtempaj elektraj signaloj.Gvidite per motorproteinoj, duoble-senhelpa DNA ligas al nanoporproteinoj enigitaj en biofilmo, malvolviĝante kiam ĝi pasas tra la nanoporkanalo sub tensiodiferenco.La karakterizaj elektraj signaloj generitaj de malsamaj bazoj sur la DNA-fadeno estas detektitaj kaj klasifikitaj en reala tempo, faciligante precizan kaj kontinuan nukleotidsekvencadon.Ĉi tiu noviga aliro venkas mallonglegajn limigojn kaj disponigas dinamikan platformon por malsimpla genoma analizo, inkluzivas kompleksajn transcriptomic-studojn.
Platformo: Nanopore Promethion P48
-
Plenlonga mRNA-sekvencado -PacBio
Dum NGS-bazita mRNA-sekvencado estas multflanka ilo por kvantigi genekspresion, ĝia dependeco de mallongaj legadoj limigas sian uzon en kompleksaj transcriptomaj analizoj.PacBio-sekvencado (Iso-Seq), aliflanke, utiligas longlegatan teknologion, ebligante la sekvencadon de plenlongaj mRNA-transskribaĵoj.Tiu aliro faciligas ampleksan esploradon de alternativa splisado, genfuzioj kaj poli-adeniligo kvankam ĝi ne estas la primara elekto por genekspresiokvantigado, pro la alta kvanto de datenoj postulataj.
PacBio-sekvenca teknologio dependas de unu-molekula, realtempa (SMRT) sekvencado, disponigante klaran avantaĝon en kaptado de plenlongaj mRNA-transskribaĵoj.Tiu noviga aliro implikas la uzon de nul-reĝimaj ondgvidistoj (ZMWoj), mikrofabrikitaj putoj kiuj ebligas la realtempan observadon de DNA-polimerazagado dum sekvencado.Ene de tiuj ZMWoj, la DNA-polimerazo de PacBio sintezas komplementan fadenon de DNA, generante longajn legadojn kiuj ampleksas la tutecon de mRNA-transskribaĵoj.PacBio-operacio en Circular Consensus-sekvencado (CCS) reĝimo plibonigas precizecon plurfoje sekvencante la saman molekulon.La generitaj HiFi-legoj havas precizecon komparebla al NGS, plue kontribuante al ampleksa kaj fidinda analizo de kompleksaj transcriptomaj trajtoj.Platformo: PacBio Sequel II
-
Eŭkariota mRNA Sequencing-Illumina
mRNA-sekvencado povigas la ampleksan profiladon de ĉiuj mRNA-transskribaĵoj ene de ĉeloj sub specifaj kondiĉoj.Ĉi tiu avangarda teknologio funkcias kiel potenca ilo, malkaŝante malsimplajn genajn esprimojn profilojn, genajn strukturojn kaj molekulan mekanismojn asociitajn kun diversaj biologiaj procezoj.Vaste adoptita en fundamenta esplorado, klinika diagnozo kaj drog-evoluo, mRNA-sekvencado ofertas sciojn pri la komplikaĵoj de ĉela dinamiko kaj genetika reguligo.
Platformo: Illumina NovaSeq X
-
Ne-Referenco bazita mRNA Sequencing-Illumina
mRNA-sekvencado povigas la ampleksan profiladon de ĉiuj mRNA-transskribaĵoj ene de ĉeloj sub specifaj kondiĉoj.Ĉi tiu avangarda teknologio funkcias kiel potenca ilo, malkaŝante malsimplajn genajn esprimojn profilojn, genajn strukturojn kaj molekulan mekanismojn asociitajn kun diversaj biologiaj procezoj.Vaste adoptita en fundamenta esplorado, klinika diagnozo kaj drog-evoluo, mRNA-sekvencado ofertas sciojn pri la komplikaĵoj de ĉela dinamiko kaj genetika reguligo.
Platformo: Illumina NovaSeq X
-
Longa ne-koda sekvencado-Illumina
Longaj ne-kodigaj RNAoj (lncRNAoj) estas RNAoj pli longaj ol 200 nukleotidoj kiuj posedas minimuman kodan potencialon kaj estas pivotaj elementoj ene de ne-kodiga RNA.Trovita en la nukleo kaj citoplasmo, tiuj RNA-oj ludas decidajn rolojn en epigenetika, transskriba, kaj post-transskriba reguligo, substrekante sian signifon en formado de ĉelaj kaj molekulaj procezoj.LncRNA-sekvencado estas potenca ilo en Ĉeldiferencigo, Ontogenezo, kaj Homaj malsanoj.
Platformo: Illumina NovaSeq
-
Malgranda RNA-sekvencado-Illumina
Malgrandaj RNA (sRNA) molekuloj, tipe malpli ol 200 nukleotidoj en longo, inkludas mikroRNA-ojn (miRNA-ojn), malgrandajn interferajn RNA-ojn (siRNA-ojn), kaj piwi-interagantajn RNA-ojn (piRNA-oj).Inter tiuj, miRNAoj, proksimume 20-24 nukleotidoj longaj, estas precipe rimarkindaj por siaj pivotaj reguligaj roloj en diversaj ĉelaj procesoj.Kun histospecifaj kaj scenspecifaj esprimopadronoj, miRNAoj elmontras altan konservadon trans malsamaj specioj.
Platformo: Illumina NovaSeq
-
circRNA-sekvencado-Illumina
Cirkla RNA-sekvencado (circRNA-seq) devas profili kaj analizi cirklajn RNAojn, klason de RNA-molekuloj kiuj formas fermitajn buklojn pro ne-kanonikaj splisaj okazaĵoj, provizante tiujn RNA per pliigita stabileco.Dum kelkaj circRNA'oj pruviĝis funkcii kiel mikroRNA-spongoj, sekvestrante mikroRNA'ojn kaj malhelpante ilin reguligado de siaj celmRNA'oj, aliaj circRNA'oj povas interagi kun proteinoj, moduli genekspresion, aŭ havi rolojn en ĉelaj procesoj.CirRNA-esprim-analizo disponigas sciojn pri la reguligaj roloj de tiuj molekuloj kaj ilian signifon en diversaj ĉelaj procezoj, evoluaj stadioj, kaj malsankondiĉoj, kontribuante al pli profunda kompreno de la komplekseco de RNA-reguligo en la kunteksto de genekspresio.
-
Tuta transkriptomsekvencado - Illumina
Tuta transkriptomsekvencado ofertas ampleksan aliron al profilado de diversspecaj RNA-molekuloj, ampleksante kaj kodigajn (mRNA) kaj ne-kodigajn RNAojn (lncRNA, circRNA, kaj miRNA).Tiu tekniko kaptas la plenan transkriptomon de specifaj ĉeloj en antaŭfiksita momento, enkalkulante holisman komprenon de ĉelaj procezoj.Ankaŭ konata kiel "totala RNA-sekvencado", ĝi planas riveli malsimplajn reguligajn retojn sur la transcriptome-nivelo, ebligante profundan analizon kiel konkuranta endogena RNA (ceRNA) kaj komunan RNA-analizon.Tio markas la komencan paŝon direkte al funkcia karakterizado, precipe en malimplikado de la reguligaj retoj implikantaj circRNA-miRNA-mRNA-bazitajn ceRNA-interagojn.
