-
Genaro-kovranta Asocia Analizo
Genaro-kovranta asocio-studo (GWAS) celas identigi genetikajn variaĵojn (genotipo) kiuj asociis kun specifaj trajtoj (fenotipo).GWAS-studo esploras genetikajn signojn transiras tutan genaron de granda nombro da individuoj kaj antaŭdiras gentip-fenotipajn asociojn per statistika analizo sur populacionivelo.Ĝi estis vaste aplikita en esplorado pri homaj malsanoj kaj funkcia gena minado pri kompleksaj trajtoj de bestoj aŭ plantoj.
-
Planto/Besto Tuta Genaro Sekvencado
Tuta genar-resekvencado, ankaŭ konata kiel WGS, ebligas la riveladon de kaj oftaj kaj maloftaj mutacioj sur la tuta genaro inkluzive de Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure-vario (SV), kaj Copy Number Variation (CNV). ).SVoj konsistigas pli grandan parton de la variadbazo ol SNPoj kaj havas pli grandan efikon al la genaro, kiu havas signifan efikon al vivantaj organismoj.Long-lega resekvencado permesas pli precizan identigon de grandaj fragmentoj kaj komplikajn variojn ĉar longaj legadoj multe faciligas kromosoman krucadon super komplikaj regionoj kiel tandemripetoj, GC/AT-riĉaj regionoj kaj hiper-variaj regionoj.
Platformo: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Evolua Genetiko
Evolua genetiko estas plenplena sekvenca servo dizajnita por disponigado de ampleksa interpreto pri evoluaj informoj de antaŭfiksitaj materialoj bazitaj sur genetikaj varioj, inkluzive de SNPoj, InDels, SVoj kaj CNVoj.Ĝi disponigas ĉiujn fundamentajn analizojn necesajn por priskribi evoluajn ŝanĝojn kaj genetikajn trajtojn de populacioj, kiel populaciostrukturo, genetika diverseco, filogeniaj rilatoj, ktp. Ĝi ankaŭ enhavas studojn pri genfluo, kiu rajtigas takson de efika populaciograndeco, diverĝtempo.
-
Kompara Genomiko
Kompara genaro laŭvorte signifas kompari la kompletajn genarsekvencojn kaj strukturojn de malsamaj specioj.Ĉi tiu disciplino celas malkaŝi speciovolucion, genfunkcion, genan reguligan mekanismon sur genarnivelo identigante la sekvencstrukturojn kaj elementojn kiuj konservis aŭ diferenciĝis trans malsamaj specioj.Tipa kompara genaro studo inkludas analizojn en genfamilio, evolua evoluo, tuta genarmultobligo, selektema premo, ktp.
-
Hi-C bazita Genoma Asembleo
Hi-C estas metodo dizajnita por kapti kromosomkonfiguracion kombinante sondantajn proksimec-bazitajn interagojn kaj alt-trafian sekvencon.La intenseco de tiuj interagoj verŝajne estas negative korelaciita kun fizika distanco sur kromosomoj.Tial, Hi-C-datenoj povus gvidi la grupigon, ordigon kaj orientiĝon de kunvenitaj sekvencoj en skiza genaro kaj ankri tiujn sur certa nombro da kromosomoj.Tiu teknologio povigas kromosom-nivelan genaron en foresto de populaci-bazita genetika mapo.Ĉiu ununura genaro bezonas Hi-C.
Platformo: Platformo Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Plant/Animal De Novo Genome Sequencing
De Novosekvencado rilatas al konstruado de la tuta genaro de specio uzanta sekvencteknologiojn, ekz. PacBio, Nanopore, NGS, ktp., en foresto de referenca genaro.La rimarkinda plibonigo en legolongo de triageneraciaj sekvencaj teknologioj alportis novajn ŝancojn en kunigado de kompleksaj genaroj, kiel tiuj kun alta heterozigoseco, alta proporcio de ripetemaj regionoj, poliploidoj, ktp. Kun legolongo je dekoj da kilobazoj, ĉi tiuj sekvencaj legadoj ebligas. solvado de ripetemaj elementoj, regionoj kun eksternorma GC-enhavo kaj aliaj tre kompleksaj regionoj.
Platformo: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/Illumina NovaSeq Platform
-
Homa Tuta Ekzoma Sekvencado
Tuta eksom-sekvencado (WES) estas rigardita kiel kostefika sekvenca strategio por identigado de malsan-kaŭzantaj mutacioj.Kvankam ekson nur okupas proksimume 1.7% de tuta genaro, ĝi reprezentas la profilon de totalaj proteinfunkcioj rekte.En homa genaro, estis raportite ke pli ol 85% de malsanrilataj mutacioj okazas en protein-kodregiono.
BMKGENE ofertas ampleksajn kaj flekseblajn homajn tutajn ekzomajn sekvengajn servojn kun malsamaj ekson-kaptaj strategioj disponeblaj por plenumi diversajn esplorcelojn.
Platformo: Platformo Illumina NovaSeq
-
Specif-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
Altprodukta genotipado, precipe sur grandskala populacio, estas fundamenta paŝo en genetikaj asociostudoj, kiu provizas genetikan bazon por funkcia gena malkovro, evolua analizo, ktp. Anstataŭ profunda tuta genaro-resekvencado, reduktita reprezenta genaro-sekvencado (RRGS). ) estas lanĉita por minimumigi sekvencan koston per provaĵo, dum konservi akcepteblan efikecon sur genetika signomalkovro.Ĉi tio estas ofte atingita per ekstraktado de restriktofragmento ene de antaŭfiksita grandecintervalo, kiu estas nomita reduktita reprezenta biblioteko (RRL).Specif-loka plifortigita fragmentsekvencado (SLAF-Seq) estas mem-evoluinta strategio por SNP-genotipado kun aŭ sen referenca genaro.
Platformo: Platformo Illumina NovaSeq
