Prenante Pacific Biosciences (PacBio) Isoformajn sekvengajn datumojn kiel enigaĵon, ĉi tiu Apo kapablas identigi plenlongajn transskribajn sekvencojn (sen asembleo).Mapante plenlongajn sekvencojn kontraŭ referenca genaro, transskribaĵoj povas esti optimumigitaj per konataj genoj, transskribaĵoj, kodaj regionoj, ktp. En ĉi tiu kazo, pli preciza identigo de mRNA-strukturoj, kiel ekzemple alternativa splisado, ktp, povas esti atingita.Komuna analizo kun NGS-transkriptome-sekvencaj datumoj ebligas pli ampleksan komentadon kaj pli precizan kvantigon en esprimo sur transskriba nivelo, kiu plejparte profitas kontraŭfluan diferencigan esprimon kaj funkcian analizon.