Elstaraĵoj
En ĉi tiu du-hora retseminario, estas nia granda honoro esti invitinta ses spertulojn pri kultiva genomiko.Niaj prelegantoj faros profundan interpreton pri du genomaj studoj de Rye, kiuj ĵus estis publikigitaj enNatura Genetiko:
1. Kromosom-skala genarasembleo disponigas sciojn pri sekalbiologio, evoluo kaj agronomia potencialo
2. Altkvalita genarasembleo elstarigas sekalajn genomajn trajtojn kaj agronomie gravajn genojn
Ankaŭ, ni ĝojas havi Ĉefan R&D-Scienciston de Biomarker-Teknologioj por dividi sian sperton pri nova genoma asembleo.
Tagordo
09:00 CET
Bonvenaj Rimarkoj
Zheng Hong-kun
Fondinto kaj CEO Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
Prezidanto, Lernejo de Altnivelaj Agrikulturaj Sciencoj Pekina Universitato
09:15
Plibonigo de sekalo, tritikalo kaj tritika plibonigo per uzado de altkvalita referenca genarsekvenco
En ĉi tiu retseminario, Prof. Wang donis al ni ĝeneralajn ĝisdatigojn pri nuna stato de triticeae genoma esplorado kaj montris la sukceson kaj sukcesojn de la du elstaraj laboroj pri Rye-genarostudoj, kiuj ĵus estis publikigitaj en Nature Genetics kaj enkondukas la tutan esploradon. grupoj gvidantaj kaj kontribuantaj en la verkoj.
09:25 a.m
Cereala genaro @ IPK Gatesleben
Cerealaj herboj de Triticeae-tribo estis grava nutraĵfonto en moderklimataj regionoj, kiu estis longe rigardita kiel varmpunkto en kultivaĵoplibonigo kaj reproduktado.Inter ĉiuj kultivitaj specioj, ĉi tiu tribo estas fama pro siaj ekstreme kompleksaj genomaj trajtoj inkluzive de grandaj genargrandoj, alta enhavo de TE-oj, poliploidio, ktp. En ĉi tiu sesio, profesoro Nils Stein donis al ni ĝeneralan enkondukon pri IPK Gatesleben kaj nunan staton de cerealo. genomic research@IPK Gatesleben.
09:35 a.m
Kromosom-skala genarasembleo disponigas sciojn pri sekalbiologio, evoluo, kaj agronomia potencialo
D-ro M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plan Research (IPK)Sekalo (Secale cereale L.) estas escepte klimat-rezistema cerealkultivaĵo, uzita grandskale por produkti plibonigitajn tritikvariaĵojn per introgresa hibridiĝo, kaj posedanta la tutan repertuaron de genoj necesaj por ebligi hibridan reproduktadon.Sekalo estas alogama kaj nur lastatempe malsovaĝigita, kio donas al kultivitaj sekaloj aliron al varia kaj ekspluatebla sovaĝa genkomunumo.Por plue plibonigi la agronomian potencialon de sekalo, ni produktis kromosom-skalan komentitan aron de la 7.9 Mbp-genaro de sekalo, kaj vaste validigis ĝian kvaliton uzante aron de molekulaj genetikaj rimedoj.Ni montras aplikojn de ĉi tiu rimedo kun larĝa gamo de esploroj.Ni prezentas trovojn pri la nekompleta genetika izolado de kultivita sekalo de sovaĝaj parencoj, mekanismoj de genoma struktura evoluo, patogenrezisto, malalta temperaturtoleremo, fekundeckontrolsistemoj por hibrida reproduktado, kaj la rendimentaj avantaĝoj de sekal-tritikaj introgresoj.
10:05 a.m
Altkvalita genarasembleo elstarigas sekalajn genomajn karakterizaĵojn kaj agronomie gravajn genojn
Sekalo estas valora nutraĵo kaj furaĝkultivaĵo, grava genetika rimedo por tritiko kaj tritikale plibonigo, kaj nemalhavebla materialo por efikaj komparaj genomikostudoj en herboj.Ĉi tie, ni sekvencis la genaron de Weining-sekalo, elita ĉina sekalvario.La kunvenitaj kontigs (7.74 Gb) respondecis pri 98.47% de la laŭtaksa genargrandeco (7.86 Gb), kun 93.67% de la kontigs (7.25 Gb) asignitaj al sep kromosomoj.Ripetaj elementoj konsistigis 90.31% de la kunvenita genaro.Kompare al antaŭe sekvencitaj Triticeae-genaroj, Daniela, Sumaya kaj Sumana retrotranspozonoj montris fortan vastiĝon en sekalo.Pliaj analizoj de Weining-asembleo verŝas novan lumon sur genar-kovrantaj geno-duplikadojn kaj ilian efikon al amelo-biosintezgenoj, fizikaj organizoj de kompleksaj prolamin-lokusoj, gen-esprimo-trajtoj subestaj frua titoltrajto, kaj supozataj malsovaĝ-rilataj kromosomaj regionoj kaj lokusoj en sekalo.Ĉi tiu genarsekvenco promesas akceli la genomikon kaj reproduktajn studojn de sekalo kaj rilataj cerealkultivaĵoj.
10:35 a.m
Defioj, solvoj kaj estonteco por genaro de nova asembleo
Genaro de alta kvalito estas la bazo de genoma studo.Kvankam la rapida evoluo en sekvencado kaj algoritmo rajtigis multe pli simplan kaj efikan genararon, la postuloj en asembleoprecizeco kaj kompleteco ankaŭ pliiĝas kun la profundiĝo de esplorceloj.En ĉi tiu prelego mi diskutos la nunajn popularajn teknologiojn en genomasembleo kun pluraj sukcesaj kazoj kaj ekrigardos la estontan evoluon.
Afiŝtempo: Jan-08-2022