GENOMO
Kromosom-skala kunigo kaj analizo de biomaskultivaĵo Miscanthus lutarioriparius genaro
Nanopora sekvencado |Ilumino |Saluton-C |RNA-sekvencado |Filogenio
En ĉi tiu studo, Biomarker Technologies disponigis teknikan subtenon pri Nanopore-sekvencado, de novo genarasembleo, Hi-C helpita kunigo, ktp.
Abstraktaĵo
Miskanto, rizomatoza plurjara planto, havas grandan potencialon por bioenergioproduktado por sia alta biomaso kaj strestoleremo.Ni raportas kromosom-skalan asembleon deMiscanthus lutarioripariusgenaro kombinante Oxford Nanopore-sekvencadon kaj Hi-C-teknologiojn.La 2.07-Gb-asembleo kovras 96.64% de la genaro, kun kontig N50 de 1.71 Mb.La centromero kaj telomersekvencoj estas kunvenitaj por ĉiuj 19 kromosomoj kaj kromosomo 10, respektive.Alotetraploida origino de la M. lutarioriparius estas konfirmita uzante centromerajn satelitripetojn.La tetraploida genarstrukturo kaj pluraj kromosomaj rearanĝoj relative al sorgo estas klare montritaj.Tandem duplikataj genoj deM. lutarioripariusestas funkciaj riĉigitaj ne nur laŭ stresrespondo, sed ĉela muro-biosintezo.Genfamilioj rilataj al malsanrezisto, ĉelmuro-biosintezo kaj metaljontransporto estas tre vastigitaj kaj evoluitaj.La vastiĝo de tiuj familioj povas esti grava genoma bazo por la plibonigo de rimarkindaj trajtoj deM. lutarioriparius.
Ŝlosilstatistikoj de genarasembleo
Figuro.Superrigardo de la M. lutarioriparius genarasembleo
Novaĵoj kaj Ĉefaĵoj celas kunhavigi la plej novajn sukcesajn kazojn kun Biomarker Technologies, kaptante novajn sciencajn atingojn kaj ankaŭ elstarajn teknikojn aplikatajn dum la studo.
Afiŝtempo: Jan-05-2022