-
Metagenomia Sekvencado (NGS)
Metagenomo rilatas al kolekto de totala genetika materialo de miksita komunumo de organismoj, kiel media metagenomo, homa metagenomo, ktp. Ĝi enhavas genamojn de kaj kultiveblaj kaj nekultiveblaj mikroorganismoj.Metagenomic-sekvencado estas molekula ilo uzita por analizi la miksitajn genomicmaterialojn eltiritajn de mediaj provaĵoj, kiu disponigas detalajn informojn pri speciodiverseco kaj abundo, populaciostrukturo, filogenetika rilato, funkciaj genoj kaj korelacia reto kun medifaktoroj.
Platformo:Illumina NovaSeq6000
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics estas molekula ilo uzata por analizi la miksitajn genomajn materialojn ĉerpitaj el mediaj specimenoj, kiu disponigas detalajn informojn pri speciodiverseco kaj abundo, populaciostrukturo, filogenetika rilato, funkciaj genoj kaj korelacia reto kun mediaj faktoroj, ktp. Lastatempe enkondukis platformojn de sinsekvo Nanopore. al metagenomaj studoj.Ĝia elstara agado en legolongo plejparte plibonigis laŭfluan metagenomican analizon, precipe metagenomasembleon.Profite de leg-longo, Nanopor-bazita metagenomic-studo povas atingi pli kontinuan kunigon kompare kun pafila metagenomics.Estis publikigita ke Nanopor-bazita metagenomics sukcese generis kompletajn kaj fermitajn bakteriajn genamojn de mikrobiomoj (Moss, EL, et. al,Nature Biotech, 2020)
Platformo:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
La subunuo sur 16S kaj 18S rRNA enhavanta kaj tre konservitajn kaj hiper-variajn regionojn estas perfekta molekula fingrospuro por identigo de prokariotaj kaj eŭkariotaj organismoj.Profitante de sekvencado, tiuj amplikonoj povas esti celitaj surbaze de la konservitaj partoj kaj la hiper-variaj regionoj povas esti plene karakterizitaj por mikroba identigo kontribuante al studoj kovrantaj mikroba diversecanalizon, taksonomio, filogenio, ktp. Unumolekulaj realtempaj (SMRT). ) sekvencado de PacBio-platformo ebligas akiri tre precizajn longajn legadojn, kiuj povus kovri plenlongajn amplikonojn (ĉ. 1,5 Kb).La plilarĝiga vido de genetika kampo tre plifortigis la rezolucion en specia komentario en bakterioj aŭ fungaj komunumoj.
Platformo:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS-amplikonsekvencado celas malkaŝi filogenion, taksonomion, kaj specioabundon en mikroba komunumo esplorante PCR-produktojn de mastrumadaj genetikaj signoj kiuj enhavas kaj tre konversaciajn kaj hipervariajn partojn.La enkonduko de ĉi tiuj perfektaj molekulaj fingrospuroj de Woeses et al, (1977) rajtigas izolitecan mikrobiomprofiladon.Sekvencado de 16S (bakterioj), 18S (fungoj) kaj Interna transskribita interspacigilo (ITS, fungoj) permesas identigon de kaj abundaj specioj same kiel raraj kaj neidentigitaj specioj.Tiu teknologio fariĝis vaste aplikata kaj grava ilo en identigado de diferenciga mikroba kunmetaĵo en diversaj medioj, kiel ekzemple homa buŝo, intestoj, feko, ktp.
Platformo:Illumina NovaSeq6000
-
Bakteria kaj Funga Tuta Genaro Re-sekvencado
Bakteria kaj funga tuta genaro re-sekvencado estas kritika ilo por kompletigi la genarojn de konataj bakterioj kaj fungoj, same kiel por kompari multoblajn genarojn aŭ mapi genarojn de novaj organismoj.Gravas sekvenci tutajn genarojn de bakterio kaj fungoj por generi precizajn referencgenarojn, fari mikroban identigon kaj aliajn komparajn genarstudojn.
Platformo: Illumina NovaSeq 6000
-
Funga Genaro
Biomarker Technologies disponigas genaron enketon, bonan genaron kaj pen-kompletan genaron de fungoj depende de specifa esplorcelo.Genaro-sekvencado, kunigo kaj funkcia komentario povas esti atingita kombinante Venontan-generacian sekvencon + Tria-generacian sekvencon por atingi altnivelan genaran asembleon.Hi-C-teknologio ankaŭ povas esti utiligita por faciligi genarmuntadon sur kromosomnivelo.
Platformo:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Bakteria Kompleta Genaro
Biomarker Technologies disponigas sekvencan servon dum konstruado de kompleta genaro de bakterioj kun nula interspaco.Ĉefa laborfluo de bakterioj kompleta genarkonstruo inkluzivas triageneracian sekvencon, kunigon, funkcian komentarion kaj altnivelan bioinformatikan analizon plenumantan specifajn esplorcelojn.Pli ampleksa profilado de bakteria genaro rajtigas riveladon de fundamentaj mekanismoj subestaj iliaj biologiaj procesoj, kiuj ankaŭ povus disponigi valoran referencon por genomaj esploradoj en pli altaj eŭkariotaj specioj.
Platformo:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
