BMKGENE disponigis spacajn transcriptome-sekvencajn servojn por la studo "ŜTALO ebligas alt-rezolucian limon de spatiotempaj transcriptomic-datenoj", kiu estis publikigita en Briefings in Bioinformatics.
Ĉi tiu studo proponis nekontrolitan kaj multoblan lernan-bazitan algoritmon, Spatial Transcriptome cell typE clustering (STEEL), kiu identigas domajnojn de spaca transcriptome kunigante bidojn elmontrantajn kaj tre similajn genesprimprofilojn kaj proksiman spacan distancon laŭ la maniero de grafeoj.
Ampleksa taksado de STEEL pri spacaj transcriptomaj datumaroj de la platformo 10X Visium pruvas, ke ĝi ne nur atingas altan rezolucion por karakterizi bonajn strukturojn de la musa cerbo, sed ankaŭ ebligas la integriĝon de multoblaj histolumbildoj individue analizitaj en pli grandan unu.
Kun la progreso de spacaj transcriptomaj teknologioj, nia metodo havos grandan aplikeblecon en domajna identigo kaj genesprimo-atlasa rekonstruo.
Klakuĉi tiepor lerni pli pri ĉi tiu studo.
Afiŝtempo: Oct-20-2023