Enprofundiĝi en la eblon studi sovaĝan varion de esploraj specioj, ekzempligita de pivota kazo de la klientoj de BMKGENE.Lastatempe eldonita en la ĉi-jara eldono de la Plant Biotechnology Journal, la artikolo titolita "Kromosoma-nivela Sovaĝa Hevea brasiliensis Genome: Empowering Genomic-Assisted Breeding and Unarthing Vital Loci for Elevated Rubber Yield" staras kiel valora referenco.
La brazila kaŭĉuka arbo ( Hevea brasiliensis ) staras alta kiel pivota natura kaŭĉuka fonto.Dum la lasta jarcento, tradiciaj bredado-metodaroj ekigis rimarkindan sesoblan pliiĝon en kaŭĉuka produktado.Tamen, la subesta genetika praroko respondeca por ebla kaŭĉuka rendimentopliigo restas enigma.
Ĉi tiu studo komencis konstrui kromosom-nivelan genaron por la sovaĝa kaŭĉukarbo, utiligante sinergion de Nanopore longlega sekvencado, Illumina NGS-sekvencado kaj Hi-C-teknologio.
Paralele, amaso da 147 ĝermoplasmo-resursoj, ampleksantaj alt-rendimentajn variojn, sovaĝajn trostreĉojn kaj rilatajn speciojn, estis kunvenita por ampleksa tuta genaro-resekvencado (WGS) uzante la Illumina-platformon.La sekvaj sekvencaj datumoj spertis rigoran analizon pri populacia genetiko, ebligante la dissekcion de populaciostrukturo, diverseco kaj ligmalekvilibro.Ĉi tiu analizo lumigas malsovaĝajn variojn inter populacioj.
Pliaj enketoj ampleksis analizon ampleksantan Fst, π, D de Tajima, kaj LD, celante riveli selektadsignalojn ekestiĝantajn de plibonigita lateksrendimento, precipe temigante Wickham-klonojn.
Kulminante per Genome-wide Association Analysis (GWAS), markiloj ligitaj al rendimentaj trajtoj kaj poste rendiment-rilataj genoj estis precizigitaj.Komenca validumado rivelis karakterizajn transskribajn agadojn trans malsamaj mutaciuloj por du ERF-genoj, disponigante preparan rigardon en ilian funkcian signifon.Plia konfirmo estas planita ene de venonta esplorado.
BMKGENE fieras pri kontribuado al la ampleksa tuta genar-resekvencado de ĉi tiu konsiderinda populacio, kune kun granda rolo en la bioinformatika analizo.Nia vasta sperto ampleksas NGS/TGS-sekvencadon kaj multiomikan bioinformatikan analizon tra aro de 1000+ specioj.Ni antaŭĝojas la perspektivon partneri kun vi en viaj venontaj projektoj.
Klaku ĉi tie porlerni pli pri ĉi tiu studo
Afiŝtempo: Aŭg-29-2023