● Tre Sperta: Pli ol 200,000 specimenoj estis prilaboritaj en BMK kovrante diversajn specimenajn tipojn, inkluzive de ĉelkulturo, histo, korpa fluidaĵo, ktp. kaj pli ol 7,000 mRNA-Seq-projektoj fermitaj kovrante diversajn esplorajn areojn.
● Strikta kvalitkontrola sistemo: Kernaj kvalitkontrolaj punktoj tra ĉiuj paŝoj inkluzive de specimena preparado, biblioteka preparado, sekvencado kaj bioinformadiko estas sub proksima monitorado por liveri altkvalitajn rezultojn.
● Multoblaj datumbazoj disponeblaj por funkciaj komentarioj kaj pliriĉigaj studoj por plenumi diversajn esplorajn celojn.
● Post-vendaj servoj: Post-vendaj servoj validaj dum 3 monatoj post la finiĝo de la projekto, inkluzive de sekvado de projektoj, solvo de problemoj, rezultoj kaj demandoj ktp.
Biblioteko | Sekvenca strategio | Datenoj rekomenditaj | Kontrolo de kvalito |
Poly A riĉigita | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Nukleotidoj:
Konk. (ng/μl) | Kvanto (μg) | Pureco | Integreco |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Limigita aŭ neniu proteino aŭ DNA-poluado montrita sur ĝelo. | Por plantoj: RIN≥6.5; Por bestoj: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; limigita aŭ neniu bazlinia alteco |
Histo: Pezo (seka):≥1 g
*Por histo pli malgranda ol 5 mg, ni rekomendas sendi fulmfrostitan (en likva nitrogeno) histo-provaĵo.
Ĉela suspendo:Ĉelkalkulo = 3×106- 1×107
*Ni rekomendas sendi frostitan ĉelan lizaton.Se tiu ĉelo nombras pli malgranda ol 5×105.
Sangaj specimenoj:Volumo ≥1 ml
Mikroorganismo:Maso ≥ 1 g
Ujo: 2 ml centrifuga tubo (Stana folio ne rekomendas)
Ekzempla etikedado: Grupo+replikato ekz. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Sendado:
Bioinformadiko
Eŭkariota mRNA-sekvenca analiza laborfluo
Bioinformadiko
ØKontrolo de kvalito de krudaj datumoj
ØReferenca genaro vicigo
ØAnalizo de transskriba strukturo
ØKvantigo de esprimo
ØDiferenca esprima analizo
ØFunkcia komentario kaj riĉigo
1.mRNA-datuma satura kurbo
2.Diferenciala esprimo analizo-Vulkanintrigo
3.KEGG komentario pri DEG-oj
4.GO-klasifiko sur DEG-oj