-
Kromatina Imunprecipita Sekvencado (ChIP-seq)
ChIP-Seq disponigas genar-kovrantan profiladon de DNA-celoj por histonmodifo, transkripcifaktoroj, kaj aliaj DNA-rilataj proteinoj.Ĝi kombinas la selektivecon de kromatina imun-precipitaĵo (ChIP) por reakiri specifajn protein-DNA-kompleksojn, kun la potenco de venontgeneracia sekvencado (NGS) por alt-trafia sekvencado de la reakirita DNA.Plie, ĉar la protein-DNA-kompleksoj estas reakiritaj de vivantaj ĉeloj, liglokoj povas esti komparitaj en malsamaj ĉeltipoj kaj histoj, aŭ sub malsamaj kondiĉoj.Aplikoj intervalas de transskriba reguligo ĝis evoluaj padoj ĝis malsanmekanismoj kaj pretere.
Platformo: Illumina NovaSeq 6000
-
Tuta genaro bisulfito-sekvencado
DNA-metiligo ĉe la kvina pozicio en citozino (5-mC) havas fundamentan influon sur gen-esprimo kaj ĉela agado.Nenormalaj metiligpadronoj estis asociitaj kun pluraj kondiĉoj kaj malsanoj, kiel ekzemple kancero.WGBS fariĝis la ora normo por studi genar-kovrantan metiigon ĉe unubaza rezolucio.
Platformo: Illumina NovaSeq6000
-
Analizo por Transposase-Alirebla Kromatino kun Alta Trafia Sekvencado (ATAC-seq)
ATAC-seq estas alt-produkta sekvencmetodo por analizo de genar-kovranta kromatinirebleco, kio estas grava por tutmonda epigenetika kontrolo de genekspresio.Sekvencaj adaptiloj estas enigitaj en malfermajn kromatinregionojn per hiperaktiva Tn5-transposazo.Post PCR-plifortigo, sekvenca biblioteko estas konstruita.Ĉiuj malfermaj kromatinregionoj povas esti akiritaj sub specifa spactempa kondiĉo, ne nur limigitaj al la liglokoj de transkripcifaktoro, aŭ certa histona modifita regiono.
-
Reduktita Reprezenta Bisulfita Sekvencado (RRBS)
Esplorado pri DNA-metiligo ĉiam estis varma temo en esploro pri malsano, kaj estas proksime rilatita al genesprimo kaj fenotipaj trajtoj.RRBS estas preciza, efika kaj ekonomia metodo por DNA-metiligesplorado.Riĉigo de iniciatinto kaj CpG-insulaj regionoj per enzimeca fendetaĵo (Msp I), kombinita kun Bisulfite-sekvencado, disponigas altan rezolucian DNA-metiligdetekton.
Platformo: Illumina NovaSeq 6000
