Platformo | Biblioteko Grandeco | Teoria Datuma Rendimento (Poĉelo) | Unubaza Precizeco | Aplikoj |
Nanoporo | 8Kb, 10kb, 20kb, Ultralonga, cDNA-PCR | 70-90Gb/Ĉelo | 85-92% | SV-voko, De novo, Plenlonga sekvencado, Iso-Seq, Geno komentario, Detekto de DNA-metiligo |
● Pli ol 5-jara sperto en PacBio-sekvenca platformo kun miloj da fermitaj projektoj kun diversaj specioj.
● BMKGENE estas oficiala partnero de Oxford Nanopore, kun duobla platforma RNA/DNA-atestilo.
● Estas ĉefaj modeloj de sekvenciloj kun kompleta ekipaĵo kaj sufiĉa sekvenca trairo.
● Surbaze de la platformo Nanopore, pli ol 10 esploroj pri bestoj kaj plantaj Denovo estis publikigitaj en internacie famaj ĵurnaloj.
Specimena Tipo | Kvanto | Koncentriĝo (Qubit®) | Volumo | Pureco | Aliaj |
Genoma DNA | Dependu de Datuma Postulo | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1,7-2,2; OD260/230≥1.5; Klara pinto je 260 nm, neniu poluado | Koncentriĝo devas esti mezurita per Qubit kaj Qubit/Nanopore ≤ 2 |
Tuta RNA | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1,7-2,5; OD260/230 = 0.5-2.5; neniu poluado | RIN-valoro ≥7.5 |
Datuma Kvalita Takso de DNA-Provizo
Tablo 1. Statistiko pri puraj datumoj.
BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | cleanSumBase | puraN50Len | puraN90Len | cleanMeanLen | cleanMaxLen | cleanMeanQual |
DNA_BMK01 | 1.218.239 | 26.37 | 1.121.736 | 25.90 | 28.014 | 15.764 | 23.090 | 143.181 | 9 |
Datuma Kvalita Takso de RNA-Provizo
Tablo 1. Statistiko pri puraj datumoj.
Dosiernomo | KlientoID | ReadNum | BaseNum | N50 | MeanLength | Maksimuma Longo | MeanQscore |
RNA_BMK001 | C2 | 8.947.708 | 4.047.230.083 | 398 | 452 | 129.227 | Q12 |
Figuro 1. Legu longodistribuon
Figuro 2. Kvalita poentaro distribuado de puraj datumoj
Figuro 3. Longa kaj kvalita poentaro distribuado de puraj datumoj