● Multoblaj sinsekvaj strategioj disponeblaj por malsamaj esplorceloj
● Bakterioj kompleta genaro kun 0 Gap garantiita.
● Tre sperta en asembleo de bakterioj genaro kun pli ol 10,000 kompleta genaro kunvenita.
● Profesia postvenda teknika subtena teamo plenumanta pli specifajn esplorbezonojn.
SekvencadoStrategio | Biblioteko | Kvalito garantiita | Laŭtaksa turniĝotempo |
Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanoporo 20K PE150 | 0 Gap | 30 Tagoj |
PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
● Kontrolo de kvalito de krudaj datumoj
● Genoma asembleo
● Genoma kompona analizo
● Gena funkcio komentario
● Kompara genoma analizo
PorDNA-ekstraktoj:
Specimena Tipo | Kvanto | Koncentriĝo | Pureco |
DNA-ekstraktoj | > 2 μg | > 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Por histoprovaĵoj:
Specimena tipo | Rekomendita specimena traktado | Specimena stokado kaj sendo |
Bakterioj | Observu bakteriojn sub mikroskopo kaj kolektu bakteriojn en ilia eksponenta fazo Transmetu la bakterian kulturon (enhavantan ĉ. 3-4,5e9 ĉelojn) en 1,5 aŭ 2 ml eppendorf.(Konservu sur glacio) Centrifugu la tubon dum 1 min je 14000 g por kolekti bakteriojn kaj zorge forigi la supernatanton. Sigelu la tubon kaj frostigu la bakteriojn en likva nitrogeno dum almenaŭ 30 minutoj.Konservu la tubon en -80 ℃ fridujo. | Frostigu la specimenojn en likva nitrogeno dum 3-4 horoj kaj konservu en likva nitrogeno aŭ -80 gradojn al longtempa rezervo.Specimena sendado kun seka glacio estas postulata. |
1.Cirkoj de bakteria genaro
2.Kodiga gena prognozo
3.Kompara genomika analizo: filogenetika arbo