Ολόκληρη αλληλουχία μεταγραφών – Illumina
Χαρακτηριστικά
● Διπλή βιβλιοθήκη για την αλληλουχία του πλήρους μεταγραφώματος: εξάντληση rRNA ακολουθούμενη από προετοιμασία βιβλιοθήκης PE150 και επιλογή μεγέθους ακολουθούμενη από προετοιμασία βιβλιοθήκης SE50
● Πλήρης ανάλυση βιοπληροφορικής των mRNA, lncRNA, circRNA και miRNA σε ξεχωριστές αναφορές βιοπληροφορικής
● Κοινή ανάλυση όλων των εκφράσεων RNA σε συνδυασμένη αναφορά, συμπεριλαμβανομένης της ανάλυσης δικτύων ceRNA.
Πλεονεκτήματα εξυπηρέτησης
●Σε βάθος ανάλυση των ρυθμιστικών δικτύων: Η ανάλυση δικτύου ceRNA ενεργοποιείται από την κοινή αλληλουχία mRNA, lncRNA, circRNA και miRNA και από μια εξαντλητική ροή εργασίας βιοπληροφορικής.
●Ολοκληρωμένος σχολιασμός: χρησιμοποιούμε πολλαπλές βάσεις δεδομένων για να σχολιάσουμε λειτουργικά τα διαφορικά εκφραζόμενα γονίδια (DEG) και να εκτελέσουμε την αντίστοιχη ανάλυση εμπλουτισμού, παρέχοντας πληροφορίες για τις κυτταρικές και μοριακές διεργασίες που διέπουν την απόκριση του μεταγραφώματος.
●Εκτεταμένη Τεχνογνωσία: με ένα ιστορικό επιτυχούς κλεισίματος πάνω από 2000 ολόκληρων έργων μεταγραφής σε διάφορους ερευνητικούς τομείς, η ομάδα μας φέρνει μια πληθώρα εμπειρίας σε κάθε έργο.
●Αυστηρός ποιοτικός έλεγχος: εφαρμόζουμε βασικά σημεία ελέγχου σε όλα τα στάδια, από την προετοιμασία του δείγματος και της βιβλιοθήκης μέχρι την αλληλούχιση και τη βιοπληροφορική.Αυτή η σχολαστική παρακολούθηση διασφαλίζει την παροχή σταθερά υψηλής ποιότητας αποτελεσμάτων.
● Ολοκληρωμένος σχολιασμός: χρησιμοποιούμε πολλαπλές βάσεις δεδομένων για να σχολιάσουμε λειτουργικά τα διαφορικά εκφραζόμενα γονίδια (DEG) και να εκτελέσουμε την αντίστοιχη ανάλυση εμπλουτισμού, παρέχοντας πληροφορίες για τις κυτταρικές και μοριακές διεργασίες που διέπουν την απόκριση του μεταγραφώματος.
●Υποστήριξη μετά την πώληση: Η δέσμευσή μας εκτείνεται πέρα από την ολοκλήρωση του έργου με περίοδο εξυπηρέτησης μετά την πώληση 3 μηνών.Κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, προσφέρουμε παρακολούθηση έργου, βοήθεια για την αντιμετώπιση προβλημάτων και συνεδρίες Q&A για την αντιμετώπιση τυχόν ερωτημάτων σχετικά με τα αποτελέσματα
Απαιτήσεις δειγμάτων και παράδοση
| Βιβλιοθήκη | Στρατηγική αλληλουχίας | Συνιστώμενα δεδομένα | Ελεγχος ποιότητας |
| Το rRNA έχει εξαντληθεί | Illumina PE150 | 16 Gb | Q30≥85% |
| Επιλεγμένο μέγεθος | Illumina SE50 | 10-20 εκ. αναγνώσεις |
Απαιτήσεις δειγμάτων:
Νουκλεοτίδια:
| Συμπ.(ng/μl) | Ποσότητα (μg) | Καθαρότητα | Ακεραιότητα |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Περιορισμένη ή καθόλου μόλυνση πρωτεϊνών ή DNA που εμφανίζεται στο gel. | Φυτά: RIN≥6,5 Ζώο: RIN≥7,0 5,0≥28S/18S≥1,0; περιορισμένη ή καθόλου βασική ανύψωση |
Συνιστώμενη παράδοση δειγμάτων
Δοχείο:
Σωλήνας φυγοκέντρησης 2 ml (δεν συνιστάται αλουμινόχαρτο)
Επισήμανση δείγματος: Ομάδα+αντίγραφο π.χ. A1, A2, A3;Β1, Β2, Β3... ...
Αποστολή:
1. Ξηρός πάγος: Τα δείγματα πρέπει να συσκευάζονται σε σάκους και να ταφούν σε ξηρό πάγο.
2.Σταθεροί σωλήνες RNA: Τα δείγματα RNA μπορούν να στεγνώσουν σε σωλήνα σταθεροποίησης RNA (π.χ. RNAstable®) και να αποσταλούν σε θερμοκρασία δωματίου.
Ροή εργασιών εξυπηρέτησης
Σχεδιασμός πειράματος
Παράδοση δειγμάτων
Εκχύλιση RNA
Κατασκευή βιβλιοθήκης
Αλληλουχία
Ανάλυση δεδομένων
Υπηρεσίες μετά την πώληση
Βιοπληροφορική
Επισκόπηση έκφρασης RNA
Διαφορικά εκφραζόμενα γονίδια
ανάλυση ceRNA
Διαφορικά εκφραζόμενα miRNAs και σχετικά RNA
Εξερευνήστε τις προόδους της έρευνας που διευκολύνονται από τις υπηρεσίες αλληλουχίας μεταγραφογραμμών του BMKGene μέσω μιας επιμελημένης συλλογής δημοσιεύσεων.
Dai, Υ. et αϊ.(2022) 'Ολοκληρωμένα προφίλ έκφρασης mRNAs, lncRNAs και miRNAs στη νόσο Kashin-Beck που ταυτοποιούνται με αλληλούχιση RNA', Molecular Omics, 18(2), σελ. 154-166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, Ν. nan et αϊ.(2022) 'Πλήρους μήκους μεταγραφομετρική ανάλυση της αντοχής στο κρύο του Apis cerana στο όρος Changbai κατά τη διάρκεια της περιόδου διαχείμασης', Gene, 830, σελ. 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al.(2022) «Προτεραιότητα βασισμένη στην ολοκλήρωση πολλαπλών ωμικών δικτύων ανταγωνιστικών ενδογενών δικτύων ρύθμισης RNA στον μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα: Μοριακά χαρακτηριστικά και υποψήφιοι για φάρμακα», Frontiers in Oncology, 12, σελ.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, Ρ. et αϊ.(2022) «Ολοκληρωμένη ανάλυση των προφίλ έκφρασης lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA αποκαλύπτει νέες γνώσεις σχετικά με πιθανούς μηχανισμούς ως απόκριση στους νηματώδεις ρίζες στο φιστίκι», BMC Genomics, 23(1), σελ. 1–12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
Yan, Ζ. et αϊ.(2022) «Η αλληλουχία RNA ολόκληρου του μεταγραφώματος υπογραμμίζει τους μοριακούς μηχανισμούς που σχετίζονται με τη διατήρηση της ποιότητας μετά τη συγκομιδή στο μπρόκολο με ακτινοβολία με κόκκινο LED», Postharvest Biology and Technology, 188, σελ.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
