Το συρτάρι Heatmap χρησιμοποιείται για τη σχεδίαση χαρτών θερμότητας, το οποίο μπορεί να φιλτράρει, να ομαλοποιεί και να ομαδοποιεί δεδομένα μήτρας. Χρησιμοποιείται ως επί το πλείστον για ανάλυση συμπλέγματος του επιπέδου γονιδιακής έκφρασης μεταξύ διαφορετικών δειγμάτων.
Προσάρτηση βιολογικών συναρτήσεων σε ακολουθίες στο αρχείο FASTA ευθυγραμμίζοντας τις ακολουθίες στη βάση δεδομένων, συμπεριλαμβανομένων των NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam.
Το BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) είναι ένας αλγόριθμος και πρόγραμμα για την εύρεση περιοχών με παρόμοιες βιολογικές ακολουθίες.Συγκρίνει αυτές τις ακολουθίες με βάσεις δεδομένων ακολουθιών και υπολογίζει τη στατιστική σημασία.Το BLAST αποτελείται από τέσσερις τύπους εργαλείων με βάση τον τύπο ακολουθίας: blastn, lastp, blastx και tblastn.