BMKCloud Log in
条形 banner-03

Προϊόντα

Αλληλουχία θραύσματος ενισχυμένης ειδικής θέσης (SLAF-Seq)

Ο προσδιορισμός γονότυπου υψηλής απόδοσης, ειδικά σε πληθυσμό μεγάλης κλίμακας, είναι ένα θεμελιώδες βήμα στις μελέτες γενετικής συσχέτισης, το οποίο παρέχει γενετική βάση για ανακάλυψη λειτουργικών γονιδίων, εξελικτική ανάλυση, κ.λπ. ) εισάγεται για να ελαχιστοποιηθεί το κόστος αλληλουχίας ανά δείγμα, διατηρώντας παράλληλα λογική αποτελεσματικότητα στην ανακάλυψη γενετικών δεικτών.Αυτό επιτυγχάνεται συνήθως με την εξαγωγή περιοριστικού τμήματος εντός δεδομένου εύρους μεγέθους, το οποίο ονομάζεται βιβλιοθήκη μειωμένης αναπαράστασης (RRL).Ο προσδιορισμός αλληλουχίας θραύσματος ενισχυμένου ειδικού τόπου (SLAF-Seq) είναι μια στρατηγική που αναπτύχθηκε μόνος του για τον προσδιορισμό του γονότυπου SNP με ή χωρίς γονιδίωμα αναφοράς.
Πλατφόρμα: Πλατφόρμα Illumina NovaSeq


Στοιχεία υπηρεσίας

Αποτελέσματα επίδειξης

Προβεβλημένες Εκδόσεις

Στοιχεία υπηρεσίας

Τεχνικό Σχέδιο

111

Ροή εργασίας

流程图

Πλεονεκτήματα εξυπηρέτησης

Υψηλή απόδοση ανακάλυψης δείκτη- Η τεχνολογία προσδιορισμού αλληλουχίας υψηλής απόδοσης βοηθά το SLAF-Seq να ανακαλύψει εκατοντάδες χιλιάδες ετικέτες σε ολόκληρο το γονιδίωμα.

Χαμηλή εξάρτηση από το γονιδίωμα- Μπορεί να εφαρμοστεί σε είδη είτε με είτε χωρίς γονιδίωμα αναφοράς.

Ευέλικτη σχεδίαση σχεδίου- Πέψη ενός ενζύμου, διπλού ενζύμου, πολλαπλών ενζύμων και διάφοροι τύποι ενζύμων, όλα μπορούν να επιλεγούν για την κάλυψη διαφορετικών ερευνητικών στόχων ή ειδών.Η προ-αξιολόγηση σε πυρίτιο χρησιμοποιείται για να εξασφαλιστεί ο βέλτιστος σχεδιασμός ενζύμων.

Αποτελεσματική ενζυματική πέψη- Πραγματοποιήθηκε προπείραμα για τη βελτιστοποίηση των συνθηκών, γεγονός που καθιστά το επίσημο πείραμα σταθερό και αξιόπιστο.Η απόδοση συλλογής θραυσμάτων μπορεί να φτάσει πάνω από 95%.

Ομοιόμορφα κατανεμημένες ετικέτες SLAF- Οι ετικέτες SLAF κατανέμονται ομοιόμορφα σε όλα τα χρωμοσώματα στο μέγιστο βαθμό, επιτυγχάνοντας κατά μέσο όρο 1 SLAF ανά 4 kb.

Αποτελεσματική αποφυγή επαναλήψεων- Η επαναλαμβανόμενη αλληλουχία στα δεδομένα SLAF-Seq μειώνεται σε λιγότερο από 5%, ειδικά σε είδη με υψηλό επίπεδο επαναλήψεων, όπως σιτάρι, καλαμπόκι κ.λπ.

Εκτεταμένη εμπειρία-Πάνω από 2000 κλειστά έργα SLAF-Seq σε εκατοντάδες είδη που καλύπτουν φυτά, θηλαστικά, πτηνά, έντομα, υδρόβιους οργανισμούς κ.λπ.

Αυτο-αναπτυγμένη ροή εργασιών βιοπληροφορικής- Μια ολοκληρωμένη ροή εργασίας βιοπληροφορικής για το SLAF-Seq αναπτύχθηκε από την BMKGENE για να διασφαλίσει την αξιοπιστία και την ακρίβεια της τελικής παραγωγής.

 

Προδιαγραφές Υπηρεσίας

 

Πλατφόρμα

Συμπ.(ng/gl)

Σύνολο (ug)

OD260/280

Illumina NovaSeq

>35

>1.6(Τόμος>15μl)

1,6-2,5

Σημείωση: Τρία δείγματα, το καθένα με τρία σχήματα ενζύμων, θα εκτελεστούν για προ-πείραμα.

Συνιστώμενη στρατηγική αλληλουχίας

Βάθος αλληλουχίας: 10Χ/Ετικέτα

Μέγεθος γονιδιώματος

Προτεινόμενες ετικέτες SLAF

< 500 Mb

100K ή WGS

500 Mb- 1 Gb

100 Κ

1 Gb -2 Gb

200 Κ

Γιγαντιαία ή πολύπλοκα γονιδιώματα

300 - 400 χιλ

 

Εφαρμογές

 

Συνιστάται

Πληθυσμιακή Κλίμακα

 

Στρατηγική και βάθος αλληλουχίας

 

Βάθος

 

Αριθμός ετικέτας

 

GWAS

 

Αριθμός δείγματος ≥ 200

 

10Χ

 

 

 

 

 

Σύμφωνα με

μέγεθος γονιδιώματος

 

Γενετική Εξέλιξη

 

Τα άτομα του καθενός

υποομάδα ≥ 10;

συνολικά δείγματα ≥ 30

 

10Χ

 

Συνιστώμενη παράδοση δειγμάτων

Δοχείο: Σωλήνας φυγοκέντρησης 2 ml

Για τα περισσότερα δείγματα, συνιστούμε να μην διατηρείται σε αιθανόλη.

Επισήμανση δειγμάτων: Τα δείγματα πρέπει να φέρουν σαφή σήμανση και να είναι πανομοιότυπα με το υποβληθέν δείγμα φόρμας πληροφοριών.

Αποστολή: Ξηρός πάγος: Τα δείγματα πρέπει πρώτα να συσκευάζονται σε σάκους και να ταφούν σε ξηρό πάγο.

Ροή εργασιών εξυπηρέτησης

Δείγμα QC
Πιλοτικό πείραμα
Πείραμα SLAF
Προετοιμασία Βιβλιοθήκης
Αλληλουχία
Ανάλυση δεδομένων
Υπηρεσίες μετά την πώληση

Δείγμα QC

Πιλοτικό πείραμα

Πείραμα SLAF

Προετοιμασία Βιβλιοθήκης

Αλληλουχία

Ανάλυση δεδομένων

Υπηρεσίες μετά την πώληση


  • Προηγούμενος:
  • Επόμενο:

  • 1. Στατιστικά αποτελέσματος χάρτη

    εικόνα 1

    Α'1

    2. Ανάπτυξη δείκτη SLAF

    Α2

    3. Σχολιασμός παραλλαγής

    Α3

    Ετος

    Εφημερίδα

    IF

    Τίτλος

    Εφαρμογές

    2022

    Επικοινωνίες με τη φύση

    17.694

    Γονιδιωματική βάση των γιγα-χρωμοσωμάτων και γιγα-γονιδίωμα της παιώνιας δέντρου

    Paeonia ostii

    SLAF-GWAS

    2015

    Νέος Φυτολόγος

    7.433

    Τα ίχνη εξημερώσεως αγκυρώνουν γονιδιωματικές περιοχές αγρονομικής σημασίας

    σόγια

    SLAF-GWAS

    2022

    Journal of Advanced Research

    12.822

    Τεχνητές εισβολές Gossypium barbadense σε όλο το γονιδίωμα στο G. hirsutum

    αποκαλύπτουν ανώτερους τόπους για ταυτόχρονη βελτίωση της ποιότητας και της απόδοσης των ινών βαμβακιού

    χαρακτηριστικά

    SLAF-Εξελικτική γενετική

    2019

    Μοριακό φυτό

    10,81

    Η γονιδιωματική ανάλυση πληθυσμού και η συναρμολόγηση De Novo αποκαλύπτουν την προέλευση του Weedy

    Το ρύζι ως εξελικτικό παιχνίδι

    SLAF-Εξελικτική γενετική

    2019

    Γενετική της Φύσης

    31.616

    Αλληλουχία γονιδιώματος και γενετική ποικιλότητα του κοινού κυπρίνου, Cyprinus carpio

    Χάρτης SLAF-Linkage

    2014

    Γενετική της Φύσης

    25.455

    Το γονιδίωμα του καλλιεργημένου φιστικιού παρέχει μια εικόνα για τους καρυότυπους οσπρίων, πολυπλοειδούς

    εξέλιξη και εξημέρωση των καλλιεργειών.

    Χάρτης SLAF-Linkage

    2022

    Plant Biotechnology Journal

    9.803

    Η αναγνώριση του ST1 αποκαλύπτει μια επιλογή που περιλαμβάνει ωτοστόπ της μορφολογίας των σπόρων

    και περιεκτικότητα σε λάδι κατά την εξημέρωση της σόγιας

    Ανάπτυξη SLAF-Marker

    2022

    International Journal of Molecular Sciences

    6.208

    Αναγνώριση και ανάπτυξη δεικτών DNA για ένα Wheat-Leymus mollis 2Ns (2D)

    Δισωματική υποκατάσταση χρωμοσώματος

    Ανάπτυξη SLAF-Marker

    λάβετε μια προσφορά

    Γράψτε το μήνυμά σας εδώ και στείλτε το σε εμάς

    Στείλτε μας το μήνυμά σας: