Υψηλή απόδοση ανακάλυψης δείκτη- Η τεχνολογία προσδιορισμού αλληλουχίας υψηλής απόδοσης βοηθά το SLAF-Seq να ανακαλύψει εκατοντάδες χιλιάδες ετικέτες σε ολόκληρο το γονιδίωμα.
Χαμηλή εξάρτηση από το γονιδίωμα- Μπορεί να εφαρμοστεί σε είδη είτε με είτε χωρίς γονιδίωμα αναφοράς.
Ευέλικτη σχεδίαση σχεδίου- Πέψη ενός ενζύμου, διπλού ενζύμου, πολλαπλών ενζύμων και διάφοροι τύποι ενζύμων, όλα μπορούν να επιλεγούν για την κάλυψη διαφορετικών ερευνητικών στόχων ή ειδών.Η προ-αξιολόγηση σε πυρίτιο χρησιμοποιείται για να εξασφαλιστεί ο βέλτιστος σχεδιασμός ενζύμων.
Αποτελεσματική ενζυματική πέψη- Πραγματοποιήθηκε προπείραμα για τη βελτιστοποίηση των συνθηκών, γεγονός που καθιστά το επίσημο πείραμα σταθερό και αξιόπιστο.Η απόδοση συλλογής θραυσμάτων μπορεί να φτάσει πάνω από 95%.
Ομοιόμορφα κατανεμημένες ετικέτες SLAF- Οι ετικέτες SLAF κατανέμονται ομοιόμορφα σε όλα τα χρωμοσώματα στο μέγιστο βαθμό, επιτυγχάνοντας κατά μέσο όρο 1 SLAF ανά 4 kb.
Αποτελεσματική αποφυγή επαναλήψεων- Η επαναλαμβανόμενη αλληλουχία στα δεδομένα SLAF-Seq μειώνεται σε λιγότερο από 5%, ειδικά σε είδη με υψηλό επίπεδο επαναλήψεων, όπως σιτάρι, καλαμπόκι κ.λπ.
Εκτεταμένη εμπειρία-Πάνω από 2000 κλειστά έργα SLAF-Seq σε εκατοντάδες είδη που καλύπτουν φυτά, θηλαστικά, πτηνά, έντομα, υδρόβιους οργανισμούς κ.λπ.
Αυτο-αναπτυγμένη ροή εργασιών βιοπληροφορικής- Μια ολοκληρωμένη ροή εργασίας βιοπληροφορικής για το SLAF-Seq αναπτύχθηκε από την BMKGENE για να διασφαλίσει την αξιοπιστία και την ακρίβεια της τελικής παραγωγής.
Πλατφόρμα | Συμπ.(ng/gl) | Σύνολο (ug) | OD260/280 |
Illumina NovaSeq | >35 | >1.6(Τόμος>15μl) | 1,6-2,5 |
Βάθος αλληλουχίας: 10Χ/Ετικέτα
Μέγεθος γονιδιώματος | Προτεινόμενες ετικέτες SLAF |
< 500 Mb | 100K ή WGS |
500 Mb- 1 Gb | 100 Κ |
1 Gb -2 Gb | 200 Κ |
Γιγαντιαία ή πολύπλοκα γονιδιώματα | 300 - 400 χιλ |
Εφαρμογές
| Συνιστάται Πληθυσμιακή Κλίμακα
| Στρατηγική και βάθος αλληλουχίας
| |
Βάθος
| Αριθμός ετικέτας
| ||
GWAS
| Αριθμός δείγματος ≥ 200
| 10Χ
|
Σύμφωνα με μέγεθος γονιδιώματος
|
Γενετική Εξέλιξη
| Τα άτομα του καθενός υποομάδα ≥ 10; συνολικά δείγματα ≥ 30
| 10Χ
|
Δοχείο: Σωλήνας φυγοκέντρησης 2 ml
Για τα περισσότερα δείγματα, συνιστούμε να μην διατηρείται σε αιθανόλη.
Επισήμανση δειγμάτων: Τα δείγματα πρέπει να φέρουν σαφή σήμανση και να είναι πανομοιότυπα με το υποβληθέν δείγμα φόρμας πληροφοριών.
Αποστολή: Ξηρός πάγος: Τα δείγματα πρέπει πρώτα να συσκευάζονται σε σάκους και να ταφούν σε ξηρό πάγο.
1. Στατιστικά αποτελέσματος χάρτη
2. Ανάπτυξη δείκτη SLAF
3. Σχολιασμός παραλλαγής
Ετος | Εφημερίδα | IF | Τίτλος | Εφαρμογές |
2022 | Επικοινωνίες με τη φύση | 17.694 | Γονιδιωματική βάση των γιγα-χρωμοσωμάτων και γιγα-γονιδίωμα της παιώνιας δέντρου Paeonia ostii | SLAF-GWAS |
2015 | Νέος Φυτολόγος | 7.433 | Τα ίχνη εξημερώσεως αγκυρώνουν γονιδιωματικές περιοχές αγρονομικής σημασίας σόγια | SLAF-GWAS |
2022 | Journal of Advanced Research | 12.822 | Τεχνητές εισβολές Gossypium barbadense σε όλο το γονιδίωμα στο G. hirsutum αποκαλύπτουν ανώτερους τόπους για ταυτόχρονη βελτίωση της ποιότητας και της απόδοσης των ινών βαμβακιού χαρακτηριστικά | SLAF-Εξελικτική γενετική |
2019 | Μοριακό φυτό | 10,81 | Η γονιδιωματική ανάλυση πληθυσμού και η συναρμολόγηση De Novo αποκαλύπτουν την προέλευση του Weedy Το ρύζι ως εξελικτικό παιχνίδι | SLAF-Εξελικτική γενετική |
2019 | Γενετική της Φύσης | 31.616 | Αλληλουχία γονιδιώματος και γενετική ποικιλότητα του κοινού κυπρίνου, Cyprinus carpio | Χάρτης SLAF-Linkage |
2014 | Γενετική της Φύσης | 25.455 | Το γονιδίωμα του καλλιεργημένου φιστικιού παρέχει μια εικόνα για τους καρυότυπους οσπρίων, πολυπλοειδούς εξέλιξη και εξημέρωση των καλλιεργειών. | Χάρτης SLAF-Linkage |
2022 | Plant Biotechnology Journal | 9.803 | Η αναγνώριση του ST1 αποκαλύπτει μια επιλογή που περιλαμβάνει ωτοστόπ της μορφολογίας των σπόρων και περιεκτικότητα σε λάδι κατά την εξημέρωση της σόγιας | Ανάπτυξη SLAF-Marker |
2022 | International Journal of Molecular Sciences | 6.208 | Αναγνώριση και ανάπτυξη δεικτών DNA για ένα Wheat-Leymus mollis 2Ns (2D) Δισωματική υποκατάσταση χρωμοσώματος | Ανάπτυξη SLAF-Marker |