Small RNA sequencing-Illumina
Χαρακτηριστικά
● Επιλογή μεγέθους RNA πριν από την προετοιμασία της βιβλιοθήκης
● Η βιοπληροφορική ανάλυση επικεντρώνεται στην πρόβλεψη του miRNA και στους στόχους τους
Πλεονεκτήματα εξυπηρέτησης
●Ολοκληρωμένη βιοπληροφορική ανάλυση:που επιτρέπει την αναγνώριση τόσο γνωστών όσο και νέων miRNAs, αναγνώριση στόχων miRNA και αντίστοιχο λειτουργικό σχολιασμό και εμπλουτισμό με πολλαπλές βάσεις δεδομένων (KEGG, GO)
●Αυστηρός ποιοτικός έλεγχος: εφαρμόζουμε βασικά σημεία ελέγχου σε όλα τα στάδια, από την προετοιμασία του δείγματος και της βιβλιοθήκης μέχρι την αλληλούχιση και τη βιοπληροφορική.Αυτή η σχολαστική παρακολούθηση διασφαλίζει την παροχή σταθερά υψηλής ποιότητας αποτελεσμάτων.
●Υποστήριξη μετά την πώληση: Η δέσμευσή μας εκτείνεται πέρα από την ολοκλήρωση του έργου με περίοδο εξυπηρέτησης μετά την πώληση 3 μηνών.Κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, προσφέρουμε παρακολούθηση έργου, βοήθεια για την αντιμετώπιση προβλημάτων και συνεδρίες Q&A για την αντιμετώπιση τυχόν ερωτημάτων που σχετίζονται με τα αποτελέσματα.
●Εκτεταμένη Τεχνογνωσία: με ένα ιστορικό επιτυχούς κλεισίματος πολλών έργων sRNA που καλύπτουν περισσότερα από 100 είδη σε διάφορους ερευνητικούς τομείς, η ομάδα μας φέρνει μια πλούσια εμπειρία σε κάθε έργο.
Απαιτήσεις δειγμάτων και παράδοση
| Βιβλιοθήκη | Πλατφόρμα | Προτεινόμενα δεδομένα | QC δεδομένων |
| Επιλεγμένο μέγεθος | Illumina SE50 | 10M-20M αναγνώσεις | Q30≥85% |
Απαιτήσεις δειγμάτων:
Νουκλεοτίδια:
| Συμπ.(ng/μl) | Ποσότητα (μg) | Καθαρότητα | Ακεραιότητα |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Περιορισμένη ή καθόλου μόλυνση πρωτεϊνών ή DNA που εμφανίζεται στο gel. | RIN≥6,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; περιορισμένη ή καθόλου βασική ανύψωση |
● Φυτά:
Ρίζα, στέλεχος ή πέταλο: 450 mg
Φύλλο ή Σπόρος: 300 mg
Φρούτα: 1,2 γρ
● Ζώο:
Καρδιά ή Έντερο: 450 mg
Σπλάχνα ή Εγκέφαλος: 240 mg
Μύες: 600 mg
Οστά, μαλλιά ή δέρμα: 1,5 γρ
● Αρθρόποδα:
Έντομα: 9γρ
Οστρακόδερμα: 450 mg
● Ολόκληρο αίμα: 2 σωλήνες
● Κύτταρα: 106 κύτταρα
● Ορός και πλάσμα:6 mL
Συνιστώμενη παράδοση δειγμάτων
Δοχείο:
Σωλήνας φυγοκέντρησης 2 ml (δεν συνιστάται αλουμινόχαρτο)
Επισήμανση δείγματος: Ομάδα+αντίγραφο π.χ. A1, A2, A3;Β1, Β2, Β3... ...
Αποστολή:
1. Ξηρός πάγος: Τα δείγματα πρέπει να συσκευάζονται σε σάκους και να ταφούν σε ξηρό πάγο.
2.Σταθεροί σωλήνες RNA: Τα δείγματα RNA μπορούν να στεγνώσουν σε σωλήνα σταθεροποίησης RNA (π.χ. RNAstable®) και να αποσταλούν σε θερμοκρασία δωματίου.
Ροή εργασιών εξυπηρέτησης
Σχεδιασμός πειράματος
Παράδοση δειγμάτων
Εκχύλιση RNA
Κατασκευή βιβλιοθήκης
Αλληλουχία
Ανάλυση δεδομένων
Υπηρεσίες μετά την πώληση
Βιοπληροφορική
Προσδιορισμός του miRNA: δομή και βάθος
Διαφορική έκφραση miRNA – ιεραρχική ομαδοποίηση
Λειτουργικός σχολιασμός στόχου διαφορικά εκφραζόμενων miRNAs
Εξερευνήστε τις ερευνητικές προόδους που διευκολύνονται από τις υπηρεσίες αλληλουχίας sRNA του BMKGene μέσω μιας επιμελημένης συλλογής δημοσιεύσεων.
Chen, Η. et αϊ.(2023) «Οι λοιμώξεις από ιούς αναστέλλουν τη βιοσύνθεση και τη φωτοσύνθεση της σαπωνίνης στο Panax notoginseng», Plant Physiology and Biochemistry, 203, σελ.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, Η. et αϊ.(2023) «Η πρωτεΐνη FREE1 που περιέχει το φυτό FYVE συσχετίζεται με στοιχεία μικροεπεξεργαστή για την καταστολή της βιογένεσης miRNA», αναφέρει το EMBO, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et αϊ.(2023) «The MicroRNA Ame-Bantam-3p Controls Larval Pupal Development by Targeting the Multiple Epidermal Growth Factor-like Domains 8 Gene (megf8) in the Honeybee, Apis mellifera», International Journal of Molecular Sciences, 24(6), p .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, Μ. et αϊ.(2018) «Ολοκληρωμένη ανάλυση του MiRNA και των γονιδίων που σχετίζονται με την ποιότητα του κρέατος αποκαλύπτει ότι το Gga-MiR-140-5p επηρεάζει την ενδομυϊκή εναπόθεση λίπους στα κοτόπουλα», Cellular Physiology and Biochemistry, 46(6), σελ. 2421–2433.doi: 10.1159/000489649.
