-
Αλληλουχία RNA ενός πυρήνα
Η πρόοδος στη σύλληψη μεμονωμένων κυττάρων και την τεχνική κατασκευής μεμονωμένων βιβλιοθηκών σε συνδυασμό με την αλληλουχία υψηλής απόδοσης επιτρέπει μελέτες γονιδιακής έκφρασης σε βάση κύτταρο προς κύτταρο.Επιτρέπει μια βαθύτερη και πλήρη ανάλυση συστήματος σε σύνθετους κυτταρικούς πληθυσμούς, στους οποίους αποφεύγει σε μεγάλο βαθμό την απόκρυψη της ετερογένειάς τους λαμβάνοντας τον μέσο όρο όλων των κυττάρων.
Ωστόσο, ορισμένα κύτταρα δεν είναι κατάλληλα για να μετατραπούν σε εναιώρημα μονοκυττάρου, επομένως χρειάζονται άλλες μέθοδοι προετοιμασίας δειγμάτων - η εξαγωγή πυρήνα από ιστούς, δηλαδή ο πυρήνας εξάγεται απευθείας από ιστούς ή κύτταρο και παρασκευάζεται σε εναιώρημα ενός πυρήνα για μονοπύρηνο αλληλουχία κυττάρων.
Η BMK παρέχει 10× Genomics ChromiumTM υπηρεσία προσδιορισμού αλληλουχίας μονοκυττάρου RNA.Αυτή η υπηρεσία έχει χρησιμοποιηθεί ευρέως σε μελέτες για μελέτες σχετικές με ασθένειες, όπως η διαφοροποίηση των ανοσοκυττάρων, η ετερογένεια του όγκου, η ανάπτυξη ιστών κ.λπ.
Τσιπ χωρικής μεταγραφής: 10× Genomics
Πλατφόρμα: Πλατφόρμα Illumina NovaSeq
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
Η χωρική μεταγραφική βρίσκεται στην πρώτη γραμμή της επιστημονικής καινοτομίας, δίνοντας τη δυνατότητα στους ερευνητές να εμβαθύνουν σε περίπλοκα πρότυπα γονιδιακής έκφρασης εντός των ιστών, διατηρώντας παράλληλα το χωρικό τους πλαίσιο.Ανάμεσα σε διάφορες πλατφόρμες, η BMKGene έχει αναπτύξει το BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip, το οποίο διαθέτειβελτιωμένη ανάλυσητων 5 μΜ, φθάνοντας στο υποκυτταρικό εύρος και ενεργοποιώνταςρυθμίσεις ανάλυσης πολλαπλών επιπέδων.Το τσιπ S1000, που διαθέτει περίπου 2 εκατομμύρια σημεία, χρησιμοποιεί μικροπηγάδια με στρώματα με σφαιρίδια φορτωμένα με ανιχνευτές σύλληψης με χωρικά γραμμικό κώδικα.Μια βιβλιοθήκη cDNA, εμπλουτισμένη με χωρικούς γραμμικούς κώδικες, προετοιμάζεται από το τσιπ S1000 και στη συνέχεια προσδιορίζεται η αλληλουχία στην πλατφόρμα Illumina NovaSeq.Ο συνδυασμός δειγμάτων με χωρικά γραμμωτό κώδικα και UMI διασφαλίζει την ακρίβεια και την ειδικότητα των δεδομένων που δημιουργούνται.Το μοναδικό χαρακτηριστικό του τσιπ BMKManu S1000 έγκειται στην ευελιξία του, προσφέροντας ρυθμίσεις ανάλυσης πολλαπλών επιπέδων που μπορούν να ρυθμιστούν με ακρίβεια σε διαφορετικούς ιστούς και επίπεδα λεπτομέρειας.Αυτή η προσαρμοστικότητα τοποθετεί το τσιπ ως εξαιρετική επιλογή για ποικίλες χωρικές μεταγραφικές μελέτες, διασφαλίζοντας ακριβή χωρική ομαδοποίηση με ελάχιστο θόρυβο.
Χρησιμοποιώντας το τσιπ BMKManu S1000 και άλλες τεχνολογίες χωρικής μεταγραφικής, οι ερευνητές μπορούν να κατανοήσουν καλύτερα τη χωρική οργάνωση των κυττάρων και τις πολύπλοκες μοριακές αλληλεπιδράσεις που συμβαίνουν μέσα στους ιστούς, παρέχοντας ανεκτίμητες πληροφορίες για τους μηχανισμούς που διέπουν τις βιολογικές διεργασίες σε ένα ευρύ φάσμα πεδίων, όπως ογκολογία, νευροεπιστήμη, αναπτυξιακή βιολογία, ανοσολογία και βοτανικές μελέτες.
Πλατφόρμα: τσιπ BMKManu S1000 και Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Η χωρική μεταγραφική είναι μια τεχνολογία αιχμής που επιτρέπει στους ερευνητές να διερευνήσουν τα πρότυπα γονιδιακής έκφρασης εντός των ιστών διατηρώντας παράλληλα το χωρικό τους πλαίσιο.Μια ισχυρή πλατφόρμα σε αυτόν τον τομέα είναι το 10x Genomics Visium σε συνδυασμό με την αλληλουχία Illumina.Η αρχή του 10X Visium βρίσκεται σε ένα εξειδικευμένο τσιπ με μια καθορισμένη περιοχή σύλληψης όπου τοποθετούνται τμήματα ιστού.Αυτή η περιοχή σύλληψης περιέχει σημεία με γραμμωτό κώδικα, καθένα από τα οποία αντιστοιχεί σε μια μοναδική χωρική θέση μέσα στον ιστό.Τα δεσμευμένα μόρια RNA από τον ιστό στη συνέχεια επισημαίνονται με μοναδικά μοριακά αναγνωριστικά (UMIs) κατά τη διάρκεια της διαδικασίας αντίστροφης μεταγραφής.Αυτά τα σημεία με γραμμωτό κώδικα και τα UMI επιτρέπουν την ακριβή χωρική χαρτογράφηση και τον ποσοτικό προσδιορισμό της γονιδιακής έκφρασης σε ανάλυση ενός κυττάρου.Ο συνδυασμός δειγμάτων με χωρικά γραμμωτό κώδικα και UMI διασφαλίζει την ακρίβεια και την ειδικότητα των δεδομένων που δημιουργούνται.Χρησιμοποιώντας αυτήν την τεχνολογία Spatial Transcriptomics, οι ερευνητές μπορούν να αποκτήσουν μια βαθύτερη κατανόηση της χωρικής οργάνωσης των κυττάρων και των πολύπλοκων μοριακών αλληλεπιδράσεων που συμβαίνουν μέσα στους ιστούς, προσφέροντας πολύτιμες γνώσεις για τους μηχανισμούς που διέπουν τις βιολογικές διεργασίες σε πολλούς τομείς, όπως ογκολογία, νευροεπιστήμη, αναπτυξιακή βιολογία, ανοσολογία και βοτανικές μελέτες.
Πλατφόρμα: 10X Genomics Visium και Illumina NovaSeq
