条形 banner-03

Προϊόντα

  • Αλληλουχία ανοσοκατακρήμνισης χρωματίνης (ChIP-seq)

    Αλληλουχία ανοσοκατακρήμνισης χρωματίνης (ChIP-seq)

    Η ανοσοκαθίζηση χρωματίνης (CHIP) είναι μια τεχνική που αξιοποιεί αντισώματα για να εμπλουτίσει επιλεκτικά τις πρωτεΐνες που δεσμεύουν το DNA και τους αντίστοιχους γονιδιωματικούς στόχους τους. Η ενσωμάτωσή του με το NGS επιτρέπει τη δημιουργία προφίλ σε ολόκληρο το γονιδίωμα στόχων DNA που σχετίζονται με τροποποίηση ιστόνης, παράγοντες μεταγραφής και άλλες πρωτεΐνες που δεσμεύουν το DNA. Αυτή η δυναμική προσέγγιση επιτρέπει συγκρίσεις θέσεων δέσμευσης μεταξύ διαφορετικών τύπων κυττάρων, ιστών ή συνθηκών. Οι εφαρμογές του ChIP-Seq εκτείνονται από τη μελέτη της μεταγραφικής ρύθμισης και των αναπτυξιακών οδών έως την αποσαφήνιση των μηχανισμών ασθενειών, καθιστώντας το απαραίτητο εργαλείο για την κατανόηση των τοπίων γονιδιωματικής ρύθμισης και την προώθηση των θεραπευτικών γνώσεων.

    Πλατφόρμα: Illumina NovaSeq

  • Μεταγονιδιωματική Αλληλουχία -NGS

    Μεταγονιδιωματική Αλληλουχία -NGS

    图片62

    Ένα μεταγονιδίωμα είναι μια συλλογή του συνολικού γενετικού υλικού μιας μεικτής κοινότητας οργανισμών, όπως περιβαλλοντικών και ανθρώπινων μεταγονιδιωμάτων. Περιέχει γονιδιώματα καλλιεργήσιμων και μη καλλιεργήσιμων μικροοργανισμών. Η μεταγονιδιωματική αλληλουχία κυνηγετικών όπλων με το NGS επιτρέπει τη μελέτη αυτών των περίπλοκων γονιδιωματικών τοπίων ενσωματωμένων σε περιβαλλοντικά δείγματα, παρέχοντας κάτι περισσότερο από ταξινομικό προφίλ, παρέχοντας επίσης αναλυτικές πληροφορίες για την ποικιλότητα των ειδών, τη δυναμική της αφθονίας και τις πολύπλοκες δομές πληθυσμού. Πέρα από τις ταξινομικές μελέτες, η μεταγονιδιωματική του κυνηγετικού όπλου προσφέρει επίσης μια προοπτική λειτουργικής γονιδιωματικής, επιτρέποντας την εξερεύνηση κωδικοποιημένων γονιδίων και τον υποτιθέμενο ρόλο τους στις οικολογικές διεργασίες. Τέλος, η δημιουργία δικτύων συσχέτισης μεταξύ γενετικών στοιχείων και περιβαλλοντικών παραγόντων συμβάλλει στην ολιστική κατανόηση της περίπλοκης αλληλεπίδρασης μεταξύ των μικροβιακών κοινοτήτων και του οικολογικού τους υπόβαθρου. Συμπερασματικά, η μεταγονιδιωματική αλληλουχία αποτελεί βασικό εργαλείο για την αποκάλυψη των γονιδιωματικών περιπλοκών διαφορετικών μικροβιακών κοινοτήτων, φωτίζοντας τις πολύπλευρες σχέσεις μεταξύ γενετικής και οικολογίας μέσα σε αυτά τα πολύπλοκα οικοσυστήματα.

    Πλατφόρμες: Illumina NovaSeq και DNBSEQ-T7

  • Μεταγονιδιωματική Αλληλουχία-TGS

    Μεταγονιδιωματική Αλληλουχία-TGS

    图片67

    Ένα μεταγονιδίωμα είναι μια συλλογή του γενετικού υλικού μιας μεικτής κοινότητας οργανισμών, όπως περιβαλλοντικά και ανθρώπινα μεταγονιδιώματα. Περιέχει γονιδιώματα καλλιεργήσιμων και μη καλλιεργήσιμων μικροοργανισμών. Η μεταγονιδιωματική αλληλουχία επιτρέπει τη μελέτη αυτών των περίπλοκων γονιδιωματικών τοπίων που είναι ενσωματωμένα σε οικολογικά δείγματα παρέχοντας κάτι περισσότερο από ταξινομικό προφίλ. Προσφέρει επίσης μια προοπτική λειτουργικής γονιδιωματικής διερευνώντας τα κωδικοποιημένα γονίδια και τους πιθανούς ρόλους τους σε περιβαλλοντικές διαδικασίες. Ενώ οι παραδοσιακές προσεγγίσεις κυνηγετικών όπλων με την αλληλουχία Illumina έχουν χρησιμοποιηθεί ευρέως σε μεταγονιδιωματικές μελέτες, η εμφάνιση της αλληλουχίας Nanopore και PacBio έχει αλλάξει το πεδίο. Η τεχνολογία Nanopore και PacBio ενισχύουν τις μεταγενέστερες βιοπληροφορικές αναλύσεις, ιδίως τη συναρμολόγηση μεταγονιδιώματος, διασφαλίζοντας πιο συνεχείς συναρμολογήσεις. Οι αναφορές δείχνουν ότι η μεταγονιδιωματική που βασίζεται σε Nanopore και PacBio έχει δημιουργήσει με επιτυχία πλήρη και κλειστά βακτηριακά γονιδιώματα από πολύπλοκα μικροβιώματα (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020). Η ενσωμάτωση των αναγνώσεων Nanopore με τις αναγνώσεις Illumina παρέχει μια στρατηγική προσέγγιση για τη διόρθωση σφαλμάτων, μετριάζοντας την εγγενή χαμηλή ακρίβεια του Nanopore. Αυτός ο συνεργιστικός συνδυασμός αξιοποιεί τα πλεονεκτήματα κάθε πλατφόρμας αλληλούχισης, προσφέροντας μια ισχυρή λύση για την υπέρβαση πιθανών περιορισμών και την προώθηση της ακρίβειας και της αξιοπιστίας των μεταγονιδιωματικών αναλύσεων.

    Πλατφόρμα: Nanopore PromethION 48, Illumia και PacBio Revio

  • Αλληλουχία διθειώδους ολικού γονιδιώματος (WGBS)

    Αλληλουχία διθειώδους ολικού γονιδιώματος (WGBS)

    图片78

    Ολόκληρο το γονιδίωμα διθειώδους αλληλουχίας (WGBS) αποτελεί τη μεθοδολογία χρυσού προτύπου για τη σε βάθος διερεύνηση της μεθυλίωσης του DNA, συγκεκριμένα την πέμπτη θέση στην κυτοσίνη (5-mC), έναν κεντρικό ρυθμιστή της γονιδιακής έκφρασης και της κυτταρικής δραστηριότητας. Η αρχή στην οποία βασίζεται το WGBS περιλαμβάνει την επεξεργασία διθειώδους, προκαλώντας τη μετατροπή των μη μεθυλιωμένων κυτοσινών σε ουρακίλη (C σε U), ενώ αφήνει τις μεθυλιωμένες κυτοσίνες αμετάβλητες. Αυτή η τεχνική προσφέρει ανάλυση μίας βάσης, επιτρέποντας στους ερευνητές να διερευνήσουν διεξοδικά το μεθυλώμα και να αποκαλύψουν μη φυσιολογικά μοτίβα μεθυλίωσης που σχετίζονται με διάφορες καταστάσεις, ιδίως τον καρκίνο. Χρησιμοποιώντας το WGBS, οι επιστήμονες μπορούν να αποκτήσουν απαράμιλλες γνώσεις για τα τοπία μεθυλίωσης σε όλο το γονιδίωμα, παρέχοντας μια λεπτή κατανόηση των επιγενετικών μηχανισμών που αποτελούν τη βάση διαφόρων βιολογικών διεργασιών και ασθενειών.

  • Δοκιμασία για προσβάσιμη σε τρανσποζάση χρωματίνη με αλληλουχία υψηλής απόδοσης (ATAC-seq)

    Δοκιμασία για προσβάσιμη σε τρανσποζάση χρωματίνη με αλληλουχία υψηλής απόδοσης (ATAC-seq)

    Το ATAC-seq είναι μια τεχνική προσδιορισμού αλληλουχίας υψηλής απόδοσης που χρησιμοποιείται για ανάλυση προσβασιμότητας χρωματίνης σε όλο το γονιδίωμα. Η χρήση του παρέχει βαθύτερη κατανόηση των πολύπλοκων μηχανισμών του παγκόσμιου επιγενετικού ελέγχου της γονιδιακής έκφρασης. Η μέθοδος χρησιμοποιεί μια υπερδραστήρια τρανσποτάση Tn5 για την ταυτόχρονη κατάτμηση και επισήμανση ανοικτών περιοχών χρωματίνης με την εισαγωγή προσαρμογέων αλληλουχίας. Η επακόλουθη ενίσχυση PCR έχει ως αποτέλεσμα τη δημιουργία μιας βιβλιοθήκης αλληλουχίας, η οποία επιτρέπει την πλήρη αναγνώριση των ανοιχτών περιοχών χρωματίνης κάτω από συγκεκριμένες χωροχρονικές συνθήκες. Το ATAC-seq παρέχει μια ολιστική άποψη προσβάσιμων τοπίων χρωματίνης, σε αντίθεση με μεθόδους που εστιάζουν αποκλειστικά σε θέσεις δέσμευσης μεταγραφικού παράγοντα ή σε συγκεκριμένες περιοχές τροποποιημένες με ιστόνη. Με τον προσδιορισμό της αλληλουχίας αυτών των ανοιχτών περιοχών χρωματίνης, το ATAC-seq αποκαλύπτει περιοχές που είναι πιο πιθανές για ενεργές ρυθμιστικές αλληλουχίες και πιθανές θέσεις δέσμευσης μεταγραφικού παράγοντα, προσφέροντας πολύτιμες πληροφορίες για τη δυναμική διαμόρφωση της γονιδιακής έκφρασης σε όλο το γονιδίωμα.

  • 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio

    16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio

    Τα γονίδια rRNA 16S και 18S, μαζί με την περιοχή Internal Transcribed Spacer (ITS), χρησιμεύουν ως βασικοί δείκτες μοριακών αποτυπωμάτων λόγω του συνδυασμού τους από εξαιρετικά διατηρημένες και υπερμεταβλητές περιοχές, καθιστώντας τα ανεκτίμητα εργαλεία για τον χαρακτηρισμό προκαρυωτικών και ευκαρυωτικών οργανισμών. Η ενίσχυση και η αλληλούχιση αυτών των περιοχών προσφέρουν μια προσέγγιση χωρίς απομόνωση για τη διερεύνηση της μικροβιακής σύνθεσης και ποικιλότητας σε διάφορα οικοσυστήματα. Ενώ η αλληλουχία Illumina στοχεύει συνήθως βραχείες υπερμεταβλητές περιοχές όπως το V3-V4 του 16S και το ITS1, έχει αποδειχθεί ότι ο ανώτερος ταξινομικός σχολιασμός μπορεί να επιτευχθεί με την αλληλουχία πλήρους μήκους των 16S, 18S και ITS. Αυτή η ολοκληρωμένη προσέγγιση έχει ως αποτέλεσμα υψηλότερα ποσοστά με ακρίβεια ταξινομημένων αλληλουχιών, επιτυγχάνοντας ένα επίπεδο ανάλυσης που επεκτείνεται στην αναγνώριση των ειδών. Η πλατφόρμα αλληλουχίας σε πραγματικό χρόνο (SMRT) του PacBio ξεχωρίζει με την παροχή μακρών αναγνώσεων υψηλής ακρίβειας (HiFi) που καλύπτουν τα πλήρους μήκους amplicons, συναγωνίζονται την ακρίβεια της αλληλουχίας Illumina. Αυτή η ικανότητα επιτρέπει στους ερευνητές να αποκτήσουν ένα απαράμιλλο πλεονέκτημα - μια πανοραμική άποψη του γενετικού τοπίου. Η εκτεταμένη κάλυψη αυξάνει σημαντικά την ανάλυση στον σχολιασμό ειδών, ιδιαίτερα σε κοινότητες βακτηρίων ή μυκήτων, επιτρέποντας μια βαθύτερη κατανόηση των περιπλοκών των μικροβιακών πληθυσμών.

  • 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS

    16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS

    Η αλληλουχία του αμπλικονίου με την τεχνολογία Illumina, που στοχεύει συγκεκριμένα τους γενετικούς δείκτες 16S, 18S και ITS, είναι μια ισχυρή μέθοδος για την αποκάλυψη της φυλογένεσης, της ταξινόμησης και της αφθονίας των ειδών στις μικροβιακές κοινότητες. Αυτή η προσέγγιση περιλαμβάνει τον προσδιορισμό της αλληλουχίας των υπερμεταβλητών περιοχών των γενετικών δεικτών νοικοκυριού. Αρχικά εισήχθη ως μοριακό δακτυλικό αποτύπωμα απόWoeses et alΤο 1977, αυτή η τεχνική έφερε επανάσταση στο προφίλ μικροβιώματος, επιτρέποντας αναλύσεις χωρίς απομόνωση. Μέσω της αλληλουχίας των 16S (βακτήρια), 18S (μύκητες) και Internal Transcribed Spacer (ITS, μύκητες), οι ερευνητές μπορούν να αναγνωρίσουν όχι μόνο άφθονα είδη αλλά και σπάνια και μη αναγνωρισμένα. Ευρέως υιοθετημένο ως βασικό εργαλείο, η αλληλουχία αμπλικονίου έχει καταστεί αποφασιστικής σημασίας για τη διάκριση διαφορικών μικροβιακών συνθέσεων σε διάφορα περιβάλλοντα, συμπεριλαμβανομένου του ανθρώπινου στόματος, των εντέρων, των κοπράνων και όχι μόνο.

  • Βακτηριακή και Μυκητιακή Ολόκληρη Ανα-αλληλουχία Γονιδιώματος

    Βακτηριακή και Μυκητιακή Ολόκληρη Ανα-αλληλουχία Γονιδιώματος

    图片48

     

     

    Τα έργα επαναπροσδιορισμού αλληλουχίας ολόκληρου του γονιδιώματος βακτηρίων και μυκήτων είναι ζωτικής σημασίας για την προώθηση της μικροβιακής γονιδιωματικής, επιτρέποντας την ολοκλήρωση και τη σύγκριση μικροβιακών γονιδιωμάτων. Αυτό διευκολύνει τη μηχανική ζύμωσης, τη βελτιστοποίηση των βιομηχανικών διεργασιών και την εξερεύνηση δευτερογενών οδών μεταβολισμού. Επιπλέον, ο επαναπροσδιορισμός της αλληλουχίας μυκήτων και βακτηρίων είναι ζωτικής σημασίας για την κατανόηση της περιβαλλοντικής προσαρμογής, τη βελτιστοποίηση των στελεχών και την αποκάλυψη της δυναμικής της γενετικής εξέλιξης, με ευρείες επιπτώσεις στην ιατρική, τη γεωργία και την περιβαλλοντική επιστήμη.

  • PacBio-Full-length 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing

    PacBio-Full-length 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing

    Η πλατφόρμα Amplicon (16S/18S/ITS) έχει αναπτυχθεί με πολυετή εμπειρία στην ανάλυση έργων μικροβιακής ποικιλότητας, η οποία περιέχει τυποποιημένη βασική ανάλυση και εξατομικευμένη ανάλυση: η βασική ανάλυση καλύπτει το κύριο περιεχόμενο ανάλυσης της τρέχουσας μικροβιακής έρευνας, το περιεχόμενο ανάλυσης είναι πλούσιο και περιεκτικό, και τα αποτελέσματα της ανάλυσης παρουσιάζονται με τη μορφή εκθέσεων έργου. Το περιεχόμενο της εξατομικευμένης ανάλυσης είναι ποικίλο. Τα δείγματα μπορούν να επιλεγούν και οι παράμετροι μπορούν να ρυθμιστούν με ευελιξία σύμφωνα με τη βασική αναφορά ανάλυσης και τον ερευνητικό σκοπό, για την πραγματοποίηση εξατομικευμένων απαιτήσεων. Λειτουργικό σύστημα Windows, απλό και γρήγορο.

  • PacBio-Πλήρης μεταγραφή (Μη Αναφορά)

    PacBio-Πλήρης μεταγραφή (Μη Αναφορά)

    Λαμβάνοντας ως είσοδο δεδομένα αλληλουχίας ισομορφών Pacific Biosciences (PacBio), αυτή η εφαρμογή είναι σε θέση να αναγνωρίσει αλληλουχίες μεταγραφής πλήρους μήκους (χωρίς συναρμολόγηση). Με χαρτογράφηση πλήρους μήκους αλληλουχιών έναντι του γονιδιώματος αναφοράς, τα μεταγραφήματα μπορούν να βελτιστοποιηθούν από γνωστά γονίδια, μεταγραφές, κωδικοποιητικές περιοχές, κ.λπ. Η κοινή ανάλυση με δεδομένα αλληλουχίας μεταγραφής NGS επιτρέπει πιο ολοκληρωμένο σχολιασμό και πιο ακριβή ποσοτικοποίηση στην έκφραση σε επίπεδο μεταγραφής, κάτι που ωφελεί σε μεγάλο βαθμό τη διαφορική έκφραση και τη λειτουργική ανάλυση κατάντη.

  • Αλληλουχία διθειώδους μειωμένης αναπαράστασης (RRBS)

    Αλληλουχία διθειώδους μειωμένης αναπαράστασης (RRBS)

    图片84

    Η Αλληλουχία Διθειώδους Μειωμένης Αναπαράστασης (RRBS) έχει αναδειχθεί ως μια οικονομικά αποδοτική και αποδοτική εναλλακτική λύση για την αλληλουχία διθειώδους ολικού γονιδιώματος (WGBS) στην έρευνα για τη μεθυλίωση του DNA. Ενώ το WGBS παρέχει ολοκληρωμένες πληροφορίες εξετάζοντας ολόκληρο το γονιδίωμα σε ανάλυση μίας βάσης, το υψηλό κόστος του μπορεί να είναι περιοριστικός παράγοντας. Το RRBS μετριάζει στρατηγικά αυτήν την πρόκληση αναλύοντας επιλεκτικά ένα αντιπροσωπευτικό τμήμα του γονιδιώματος. Αυτή η μεθοδολογία βασίζεται στον εμπλουτισμό περιοχών πλούσιων σε νησίδες CpG με διάσπαση MspI που ακολουθείται από επιλογή μεγέθους θραυσμάτων 200-500/600 bps. Κατά συνέπεια, αλληλουχούνται μόνο οι περιοχές που βρίσκονται κοντά στα νησιά CpG, ενώ αυτές με απομακρυσμένες νησίδες CpG εξαιρούνται από την ανάλυση. Αυτή η διαδικασία, σε συνδυασμό με την αλληλουχία διθειώδους, επιτρέπει την ανίχνευση υψηλής ανάλυσης της μεθυλίωσης του DNA και η προσέγγιση προσδιορισμού αλληλουχίας, PE150, εστιάζει ειδικά στα άκρα των ενθέτων και όχι στη μέση, αυξάνοντας την αποτελεσματικότητα του προφίλ μεθυλίωσης. Το RRBS είναι ένα ανεκτίμητο εργαλείο που επιτρέπει την οικονομική έρευνα για τη μεθυλίωση του DNA και προάγει τη γνώση των επιγενετικών μηχανισμών.

  • Προκαρυωτική αλληλουχία RNA

    Προκαρυωτική αλληλουχία RNA

    Ο προσδιορισμός αλληλουχίας RNA ενισχύει τον ολοκληρωμένο προσδιορισμό προφίλ όλων των μεταγραφών RNA εντός των κυττάρων υπό συγκεκριμένες συνθήκες. Αυτή η τεχνολογία αιχμής χρησιμεύει ως ένα ισχυρό εργαλείο, αποκαλύπτοντας περίπλοκα προφίλ γονιδιακής έκφρασης, γονιδιακές δομές και μοριακούς μηχανισμούς που σχετίζονται με ποικίλες βιολογικές διεργασίες. Ευρέως υιοθετημένος στη θεμελιώδη έρευνα, την κλινική διάγνωση και την ανάπτυξη φαρμάκων, η αλληλουχία RNA προσφέρει πληροφορίες για τις περιπλοκές της κυτταρικής δυναμικής και της γενετικής ρύθμισης. Η επεξεργασία δειγμάτων προκαρυωτικού RNA μας είναι προσαρμοσμένη για προκαρυωτικά μεταγραφώματα, που περιλαμβάνει εξάντληση rRNA και προετοιμασία κατευθυντικής βιβλιοθήκης.

    Πλατφόρμα: Illumina NovaSeq

  • Αλληλουχία Μεταμεταγραφών

    Αλληλουχία Μεταμεταγραφών

    Αξιοποιώντας την τεχνολογία αλληλουχίας Illumina, η υπηρεσία αλληλουχίας μετατρανγραφώματος του BMKGENE αποκαλύπτει τη δυναμική γονιδιακή έκφραση μιας ποικιλίας μικροβίων, που εκτείνονται από ευκαρυώτες έως προκαρυώτες και ιούς, σε φυσικά περιβάλλοντα όπως το έδαφος, το νερό, η θάλασσα, τα κόπρανα και το έντερο. Η ολοκληρωμένη υπηρεσία μας δίνει τη δυνατότητα στους ερευνητές να εμβαθύνουν σε ολοκληρωμένα προφίλ γονιδιακής έκφρασης σύνθετων μικροβιακών κοινοτήτων. Πέρα από την ταξινομική ανάλυση, η υπηρεσία μας για την αλληλουχία μεταμεταγραφομένων διευκολύνει την εξερεύνηση του λειτουργικού εμπλουτισμού, ρίχνοντας φως στα διαφορικά εκφραζόμενα γονίδια και τους ρόλους τους. Ανακαλύψτε μια πληθώρα βιολογικών γνώσεων καθώς περιηγείστε στα περίπλοκα τοπία της έκφρασης γονιδίων, της ταξινομικής ποικιλομορφίας και της λειτουργικής δυναμικής μέσα σε αυτές τις διαφορετικές περιβαλλοντικές θέσεις.

Στείλτε μας το μήνυμά σας: