Λαμβάνοντας ως είσοδο δεδομένα αλληλουχίας ισομορφών Pacific Biosciences (PacBio), αυτή η εφαρμογή είναι σε θέση να αναγνωρίσει αλληλουχίες μεταγραφής πλήρους μήκους (χωρίς συναρμολόγηση).Με χαρτογράφηση αλληλουχιών πλήρους μήκους έναντι του γονιδιώματος αναφοράς, τα μεταγραφήματα μπορούν να βελτιστοποιηθούν από γνωστά γονίδια, μεταγραφές, κωδικοποιητικές περιοχές, κ.λπ.Η κοινή ανάλυση με δεδομένα αλληλουχίας μεταγραφής NGS επιτρέπει πιο ολοκληρωμένο σχολιασμό και πιο ακριβή ποσοτικοποίηση στην έκφραση σε επίπεδο μεταγραφής, κάτι που ωφελεί σε μεγάλο βαθμό τη διαφορική έκφραση και τη λειτουργική ανάλυση κατάντη.