Καλύτερες στιγμές
Σε αυτό το δίωρο διαδικτυακό σεμινάριο, είναι μεγάλη μας τιμή που προσκαλέσαμε έξι ειδικούς στον τομέα της γονιδιωματικής των καλλιεργειών.Οι ομιλητές μας θα δώσουν μια εις βάθος ερμηνεία σε δύο γονιδιωματικές μελέτες Rye, οι οποίες δημοσιεύθηκαν πρόσφατα στιςΓενετική της Φύσης:
1. Η συναρμολόγηση γονιδιώματος σε κλίμακα χρωμοσώματος παρέχει πληροφορίες για τη βιολογία της σίκαλης, την εξέλιξη και το αγρονομικό δυναμικό
2. Ένα συγκρότημα γονιδιώματος υψηλής ποιότητας αναδεικνύει τα γονιδιωματικά χαρακτηριστικά της σίκαλης και τα γεωπονικά σημαντικά γονίδια
Επίσης, χαιρόμαστε που έχουμε τον Ανώτερο Επιστήμονα Ε&Α της Biomarker Technologies να μοιραστεί την εμπειρία του στη de novo συναρμολόγηση γονιδιώματος.
Ημερήσια διάταξη
09:00 π.μ. CET
Χαιρετισμοί
Ζενγκ Χονγκ Κουν
Ιδρυτής & Διευθύνων Σύμβουλος Biomarker Technologies
Ντενγκ Σινγκ Γουάνγκ
Πρόεδρος, Σχολή Προηγμένων Γεωργικών Επιστημών του Πανεπιστημίου του Πεκίνου
09:15 π.μ
Ενίσχυση της βελτίωσης της σίκαλης, του τριτικάλε και του σίτου μέσω της χρήσης υψηλής ποιότητας αλληλουχίας γονιδιώματος αναφοράς
Σε αυτό το διαδικτυακό σεμινάριο, ο καθηγητής Wang μας έδωσε μια γενική ενημέρωση σχετικά με την τρέχουσα κατάσταση της γονιδιωματικής έρευνας των triticeae και έδειξε την επιτυχία και τα επιτεύγματα των δύο εξαιρετικών εργασιών για τις μελέτες γονιδιώματος της σίκαλης, οι οποίες μόλις πρόσφατα δημοσιεύθηκαν στο Nature Genetics και εισάγουν ολόκληρη την έρευνα ομάδες που ηγούνται και συμβάλλουν στις εργασίες.
09:25 π.μ
Γονιδιωματική σιτηρών @ IPK Gatersleben
Τα δημητριακά της φυλής Triticeae ήταν μια σημαντική πηγή τροφής σε εύκρατες περιοχές, οι οποίες θεωρούνταν από καιρό ως hotspot για τη βελτίωση και την αναπαραγωγή των καλλιεργειών.Μεταξύ όλων των καλλιεργούμενων ειδών, αυτή η φυλή είναι διάσημη για τα εξαιρετικά πολύπλοκα γονιδιωματικά χαρακτηριστικά της, όπως μεγάλα μεγέθη γονιδιώματος, υψηλή περιεκτικότητα σε ΤΕ, πολυπλοειδία, κ.λπ. γονιδιωματική έρευνα@IPK Gatersleben.
09:35 π.μ
Η συγκρότηση γονιδιώματος σε κλίμακα χρωμοσωμάτων παρέχει πληροφορίες για τη βιολογία της σίκαλης, την εξέλιξη και το αγρονομικό δυναμικό
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Ινστιτούτο Leibniz για τη Γενετική Φυτών και την Έρευνα Σχεδίου Καλλιεργειών (IPK)Η σίκαλη (Secale cereale L.) είναι μια εξαιρετικά ανθεκτική στο κλίμα καλλιέργεια δημητριακών, που χρησιμοποιείται εκτενώς για την παραγωγή βελτιωμένων ποικιλιών σιταριού μέσω ενδογενούς υβριδισμού και διαθέτει ολόκληρο το ρεπερτόριο των γονιδίων που είναι απαραίτητα για να καταστεί δυνατή η υβριδική αναπαραγωγή.Η σίκαλη είναι αλλογαμική και μόλις πρόσφατα εξημερωμένη, γεγονός που δίνει στις καλλιεργούμενες σίκαλες πρόσβαση σε μια ποικιλόμορφη και εκμεταλλεύσιμη άγρια γονιδιακή δεξαμενή.Για να ενισχύσουμε περαιτέρω το αγρονομικό δυναμικό της σίκαλης, δημιουργήσαμε ένα σχολιασμένο σύνολο χρωμοσωμάτων του γονιδιώματος της σίκαλης 7,9 Mbp και επικυρώσαμε εκτενώς την ποιότητά του χρησιμοποιώντας μια σειρά μοριακών γενετικών πόρων.Επιδεικνύουμε εφαρμογές αυτού του πόρου με ένα ευρύ φάσμα ερευνών.Παρουσιάζουμε ευρήματα σχετικά με την ατελή γενετική απομόνωση της καλλιεργούμενης σίκαλης από άγριους συγγενείς, τους μηχανισμούς δομικής εξέλιξης του γονιδιώματος, την αντοχή στα παθογόνα, την ανοχή σε χαμηλή θερμοκρασία, τα συστήματα ελέγχου γονιμότητας για την αναπαραγωγή υβριδίων και τα οφέλη απόδοσης των εισβολών σίκαλης-σίτου.
10:05 π.μ
Ένα συγκρότημα γονιδιώματος υψηλής ποιότητας αναδεικνύει τα γονιδιωματικά χαρακτηριστικά της σίκαλης και τα γεωπονικά σημαντικά γονίδια
Η σίκαλη είναι μια πολύτιμη τροφή και κτηνοτροφική καλλιέργεια, ένας σημαντικός γενετικός πόρος για τη βελτίωση του σιταριού και του τριτικάλ και ένα απαραίτητο υλικό για αποτελεσματικές συγκριτικές μελέτες γονιδιωματικής στα χόρτα.Εδώ, προσδιορίσαμε την αλληλουχία του γονιδιώματος της Weining σίκαλης, μιας ελίτ κινεζικής ποικιλίας σίκαλης.Τα συναρμολογημένα contigs (7,74 Gb) αντιπροσώπευαν το 98,47% του εκτιμώμενου μεγέθους γονιδιώματος (7,86 Gb), με το 93,67% των contigs (7,25 Gb) να εκχωρούνται σε επτά χρωμοσώματα.Τα επαναλαμβανόμενα στοιχεία αποτελούσαν το 90,31% του συναρμολογημένου γονιδιώματος.Σε σύγκριση με προηγούμενα γονιδιώματα Triticeae, τα ρετροτρανσποζόνια Daniela, Sumaya και Sumana έδειξαν ισχυρή επέκταση στη σίκαλη.Περαιτέρω αναλύσεις της συναρμολόγησης Weining ρίχνουν νέο φως στους διπλασιασμούς γονιδίων σε όλο το γονιδίωμα και τον αντίκτυπό τους στα γονίδια βιοσύνθεσης αμύλου, τις φυσικές οργανώσεις σύνθετων θέσεων προλαμίνης, τα χαρακτηριστικά έκφρασης γονιδίων που υποκρύπτουν το χαρακτηριστικό πρώιμης επικεφαλίδας και τις πιθανές χρωμοσωμικές περιοχές και τόπους στη σίκαλη που σχετίζονται με την εξημέρωση.Αυτή η αλληλουχία γονιδιώματος υπόσχεται να επιταχύνει τις μελέτες γονιδιωματικής και αναπαραγωγής της σίκαλης και των σχετικών καλλιεργειών δημητριακών.
10:35 π.μ
Προκλήσεις, λύσεις και μέλλον για τη συναρμολόγηση του γονιδιώματος de novo
Το γονιδίωμα υψηλής ποιότητας είναι η βάση της γονιδιωματικής μελέτης.Αν και η ταχεία ανάπτυξη στον προσδιορισμό αλληλουχίας και στον αλγόριθμο έχει ενισχύσει μια πολύ απλούστερη και πιο αποτελεσματική συναρμολόγηση γονιδιώματος, οι απαιτήσεις για την ακρίβεια και την πληρότητα της συναρμολόγησης αυξάνονται επίσης με την εμβάθυνση των ερευνητικών στόχων.Σε αυτήν την ομιλία θα συζητήσω τις τρέχουσες δημοφιλείς τεχνολογίες στη συναρμολόγηση γονιδιώματος με αρκετές επιτυχημένες περιπτώσεις και θα ρίξω μια ματιά στη μελλοντική ανάπτυξη.
Ώρα δημοσίευσης: Ιαν-08-2022