Αλληλουχία μεταγραφής πλήρους μήκους βασισμένη σε νανοπόρους
Η αλληλουχία νανοπόρων διακρίνεται από άλλες πλατφόρμες προσδιορισμού αλληλουχίας, καθώς τα νουκλεοτίδια διαβάζονται απευθείας χωρίς σύνθεση DNA και παράγει μεγάλες αναγνώσεις σε δεκάδες κιλοβάσεις.Αυτό ενδυναμώνει την άμεση ανάγνωση μεταγραφών πλήρους μήκους και την αντιμετώπιση των προκλήσεων στις μεταγραφικές μελέτες.
√ Χαμηλή προκατάληψη ειδικής ακολουθίας
√ Πλήρης ανάγνωση cDNA για μελέτες γονιδιακής δομής
√ Απαιτούνται λιγότερα δεδομένα για την κάλυψη του ίδιου αριθμού μεταγραφών
√ Ταυτοποίηση πολλαπλών ισομορφών ανά γονίδιο
√ Ποσοτικοποίηση έκφρασης σε επίπεδο ισομορφής
Τυπικός αγωγός βιοπληροφορικής
Τελευταίες επιτυχημένες περιπτώσεις με τεχνολογίες βιοδεικτών
1. Συγκριτικές αναλύσεις μεταγραφωμάτων πλήρους μήκους αποκαλύπτουν την αναπτυξιακή δυναμική του στελέχους Gnetum luofuense
Περιοδικό: Frontiers in Genetics
Δημοσίευση: Μάρτιος 2021
Λέξεις-κλειδιά: MinION |Εναλλακτικό μάτισμα |APA |lncRNA |Διαφορικά εκφρασμένες μεταγραφές
Διαβάστε το πλήρες κείμενο
2. Μονοκατευθυντική κίνηση μικρών RNA από τους βλαστούς στις ρίζες σε μεσοειδικά ετερομοσχεύματα
Περιοδικό: Φύση Φυτά
Δημοσιεύθηκε: Ιαν. 2021
Λέξεις-κλειδιά: Nanopore |Illumina |ανίχνευση κινητού mRNA πλήρους μήκους
3. Η ανάλυση μεταγραφής πλήρους μήκους των ριζών των σπαραγγιών αποκαλύπτει τον μοριακό μηχανισμό της ανοχής στο αλάτι που προκαλείται από τους μυκορριζικούς μύκητες
Περιοδικό: Environmental and Experimental Botany
Δημοσιεύθηκε: Ιαν. 2021
Λέξεις-κλειδιά: MinION |Διαφορικά εκφρασμένες μεταγραφές |Παράγοντες μεταγραφής |Εναλλακτικό μάτισμα
4. Φυσιολογικές χαρακτηριστικές αλλαγές και ολόσωμη μεταγραφή ριζών και φύλλων τριαντάφυλλου (Rosa chinensis) ως απόκριση στο στρες της ξηρασίας
Περιοδικό: Φυσιολογία Φυτών και Κυττάρων
Δημοσιεύθηκε: Οκτ. 2020
Λέξεις-κλειδιά: ΠρομηθΙΟΝ |Διαφορικά εκφρασμένες μεταγραφές |Λειτουργική πρόβλεψη |Συναρμολογημένες ισομορφές |TF και lncRNA
5. Ανάλυση και ολοκληρωμένη σύγκριση της αλληλουχίας RNA του PacBio και του νανοπόρου του μεταγραφώματος Arabidopsis
Περιοδικό: Μέθοδος φυτών
Δημοσιεύθηκε: Απρ. 2020
Λέξεις-κλειδιά: GridION |Προμηθέιον |Συνέχεια PacBio |Illumina NovaSeq |Ευθυγράμμιση γονιδιώματος |Αναγνώριση μεταγραφής |Εναλλακτικό μάτισμα |SSR |LncRNA |Ποσοτικοποίηση ισομορφών
Νέα και Στιγμιότυπα στοχεύει στο να μοιράζεται τις πιο πρόσφατες επιτυχημένες περιπτώσεις με τη Biomarker Technologies, αποτυπώνοντας νέα επιστημονικά επιτεύγματα καθώς και εξέχουσες τεχνικές που εφαρμόστηκαν κατά τη διάρκεια της μελέτης.
Ώρα δημοσίευσης: Ιαν-08-2022