ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΟΣ
Βακτηριακή συμβατότητα και ακινητοποίηση με biochar βελτίωσε την αποικοδόμηση της τεβουκοναζόλης, τη σύνθεση και τη λειτουργία του μικροβιώματος του εδάφους
Αλληλουχία αμπλικονίου πλήρους μήκους 16S |PacBio HiFi |Άλφα ποικιλομορφία |Βήτα ποικιλομορφία
Σε αυτή τη μελέτη, η αλληλουχία αμπλικονίου πλήρους μήκους 16S από το PacBio και η βιοπληροφορική ανάλυση παρέχονται από τη Biomarker Technologies.
Καλύτερες στιγμές
Τα ακινητοποιημένα βακτήρια αποικοδόμησης της τεβουκοναζόλης με βιοκάρβουνο Alcaligenes faecalis WZ-2 μελετήθηκαν σχετικά με την αποτελεσματικότητα της βιοαποδόμησης και τις επιπτώσεις στο μολυσμένο έδαφος με tebuconazole σε σύγκριση με το ελεύθερο αποικοδομητικό στέλεχος WZ-2.
1. Το ακινητοποιημένο με βιοαπάνθρακες WZ-2 έδειξε πιο αποτελεσματική αποικοδόμηση της τεβουκοναζόλης σε σύγκριση με την ελεύθερη WZ-2 μειώνοντας τον χρόνο ημιζωής της τεβουκοναζόλης στο έδαφος από 18,7 ημέρες σε 13,3 ημέρες.
2. Το WZ-2 που ακινητοποιήθηκε με βιοchar ήταν ικανό να αποκαταστήσει τις εγγενείς μικροβιακές ενζυμικές δραστηριότητες του εδάφους, συμπεριλαμβανομένης της ουρεάσης, της αφυδρογονάσης και της ινβερτάσης, κ.λπ.
3. Το μικροβιακό προφίλ σε ακινητοποιημένο με βιοκάρβουνο χώμα επεξεργασμένο με WZ-2 που προσδιορίστηκε με αλληλουχία πλήρους μήκους 16S υποστήριξε σθεναρά ότι αυτό το σύστημα θα μπορούσε να αποκαταστήσει την υγεία του εδάφους βελτιώνοντας τη δομή της βακτηριακής κοινότητας υπό μόλυνση από τεβουκοναζόλη.
Πείραμα (Σχετικά με την αλληλουχία)
Ομαδοποίηση: CK: Φυσικό έδαφος;T: Έδαφος με τεβουκοναζόλη.S: Χώμα που περιείχε τεβουκοναζόλη με ελεύθερο στέλεχος WZ-2.π.Χ.: Η τεβουκοναζόλη περιείχε χώμα με βιοαπάνθρακες.BCS: Η τεβουκοναζόλη περιείχε χώμα με ακινητοποιημένο βιοαπάνθρακα WZ-2.
Δειγματοληψία: Ολική εξαγωγή DNA εδάφους ενισχύθηκε με εκκινητές 16S rDNA
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) και 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),επαναλαμβανόμενο 16S rDNA πλήρους μήκους
Πλατφόρμα αλληλουχίας: PacBio RS II
Στρατηγική αλληλουχίας: διαβάζει το CCS HIFI
Ανάλυση δεδομένων:BMKCloudΗ Βιοπληροφορική Πλατφόρμα καθιστά τα χρυσόψαρα ένα εξαιρετικό σύστημα γενετικού μοντέλου για τη φυσιολογία και την εξέλιξη των ψαριών.
Αποτέλεσμα
Η δομή της μικροβιακής κοινότητας του εδάφους προσδιορίστηκε με αλληλουχία 16S rDNA.Ο πλούτος OTU και ο δείκτης ποικιλότητας άλφα, συμπεριλαμβανομένων των δεικτών Chao1, Ace, Shannon και Simpson αξιολογήθηκαν για να αποκαλυφθεί η ποικιλότητα των ειδών σε κάθε σύστημα.Μετά από 60 ημέρες επώασης, όλοι οι δείκτες παρουσίασαν παρόμοια τάση, δηλαδή η τεβουκοναζόλη θα μπορούσε να προκαλέσει μείωση του πλούτου των ειδών και της ποικιλομορφίας στο έδαφος.Ωστόσο, με την προσθήκη του στελέχους WZ-2, η κοινότητα των βακτηρίων του εδάφους ανακτήθηκε εν μέρει τόσο από άποψη πλούτου όσο και από άποψη ποικιλομορφίας.Παρατηρήθηκε περιορισμένη διαφορά μεταξύ των BC, BCS και CK, υποδεικνύοντας ότι ο βιοαπάνθρακας και το ακινητοποιημένο με βιοάνθρακες WZ-2 θα μπορούσαν να αποκαταστήσουν αποτελεσματικά τη βιολογική υγεία του εδάφους.
Σε αυτή τη μελέτη εφαρμόστηκε μέθοδος μη σταθμισμένης ομάδας ζευγών με αριθμητικούς μέσους όρους (UPGMA) για να δείξει τη βήτα ποικιλομορφία μεταξύ των ομάδων.Όπως φαίνεται στο παρακάτω σχήμα, τα BC, BSC και CK μοιράζονταν περισσότερο παρόμοιο μοτίβο μικροβιακής σύνθεσης σε σύγκριση με τις ομάδες T και S, γεγονός που έδειξε περαιτέρω ότι η εισαγωγή βιοαπανθράκων στη βιοαποκατάσταση εδάφους μολυσμένου με tebuconazole θα μπορούσε να διευκολύνει σε μεγάλο βαθμό την ανάκτηση της μικροβιακής κοινότητας στο έδαφος.
Εικόνα.Ομαδοποίηση UPGMA της βακτηριακής κοινότητας σε επίπεδο φυλής υπό διαφορετική επεξεργασία
Αναφορά
Sun, Tong, et al.«Η βακτηριακή συμβατότητα και η ακινητοποίηση με βιοσάνθρακες βελτίωσαν την αποικοδόμηση της τεβουκοναζόλης, τη σύνθεση και τη λειτουργία του μικροβιώματος του εδάφους».Journal of Hazardous Materials398 (2020): 122941.
Νέα και Στιγμιότυπα στοχεύει στο να μοιράζεται τις πιο πρόσφατες επιτυχημένες περιπτώσεις με τη Biomarker Technologies, αποτυπώνοντας νέα επιστημονικά επιτεύγματα καθώς και εξέχουσες τεχνικές που εφαρμόστηκαν κατά τη διάρκεια της μελέτης.
Ώρα δημοσίευσης: Ιαν-08-2022