Οι σύνθετες και μεταβλητές εναλλακτικές ισομορφές σε οργανισμούς είναι σημαντικοί γενετικοί μηχανισμοί για τη ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης και της ποικιλότητας των πρωτεϊνών.Η ακριβής αναγνώριση των δομών μεταγραφής είναι η βάση για τη σε βάθος μελέτη των μοτίβων ρύθμισης της γονιδιακής έκφρασης.Η πλατφόρμα προσδιορισμού αλληλουχίας νανοπόρων έχει φέρει με επιτυχία τη μεταγραφική μελέτη σε επίπεδο ισομορφής.Αυτή η πλατφόρμα ανάλυσης έχει σχεδιαστεί για να αναλύει δεδομένα RNA-Seq που δημιουργούνται στην πλατφόρμα Nanopore με βάση το γονιδίωμα αναφοράς, το οποίο επιτυγχάνει ποιοτικές και ποσοτικές αναλύσεις τόσο σε επίπεδο γονιδίου όσο και σε επίπεδο μεταγραφών.