Το μεταγραφικό είναι ο σύνδεσμος μεταξύ της γονιδιωματικής γενετικής πληροφορίας και του πρωτεώματος της βιολογικής λειτουργίας.Η ρύθμιση μεταγραφικού επιπέδου είναι ο πιο σημαντικός και ο πιο ευρέως μελετημένος τρόπος ρύθμισης των οργανισμών.Η αλληλουχία του μεταγραφώματος μπορεί να καθορίσει την αλληλουχία του μεταγραφώματος σε οποιαδήποτε χρονική στιγμή ή υπό οποιεσδήποτε συνθήκες, με ανάλυση ακριβή σε ένα μεμονωμένο νουκλεοτίδιο. Μπορεί να αντικατοπτρίζει δυναμικά το επίπεδο μεταγραφής γονιδίου, ταυτοχρόνως να αναγνωρίζει και να ποσοτικοποιεί σπάνια και φυσιολογικά μεταγραφήματα και να παρέχει τις δομικές πληροφορίες του δείγμα συγκεκριμένων μεταγραφών.
Επί του παρόντος, η τεχνολογία αλληλουχίας μεταγραφομένων έχει χρησιμοποιηθεί ευρέως στη γεωπονία, την ιατρική και άλλα ερευνητικά πεδία, συμπεριλαμβανομένης της ρύθμισης ανάπτυξης ζώων και φυτών, περιβαλλοντικής προσαρμογής, ανοσολογικής αλληλεπίδρασης, εντοπισμού γονιδίων, γενετικής εξέλιξης ειδών και ανίχνευσης όγκων και γενετικών ασθενειών.
