● Στοχευμένη περιοχή κωδικοποίησης πρωτεΐνης: με τη σύλληψη και τον προσδιορισμό της αλληλουχίας της περιοχής κωδικοποίησης πρωτεΐνης, το hWES χρησιμοποιείται για την αποκάλυψη παραλλαγών που σχετίζονται με τη δομή της πρωτεΐνης.
● Υψηλή Ακρίβεια: με υψηλό βάθος αλληλουχίας, το hWES διευκολύνει τον εντοπισμό κοινών παραλλαγών και σπάνιων παραλλαγών με συχνότητες μικρότερες από 1%.
● Οικονομική: Το hWES αποδίδει περίπου το 85% των μεταλλάξεων ανθρώπινων ασθενειών από το 1% του ανθρώπινου γονιδιώματος.
● Πέντε αυστηρές διαδικασίες QC που καλύπτουν όλη τη διαδικασία με Q30>85% εγγυημένη.
Πλατφόρμα
| Βιβλιοθήκη
| Exon Capture Strategy
| Προτείνετε τη στρατηγική αλληλουχίας
|
Πλατφόρμα Illumina NovaSeq
| ΠΕ150 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 IDT xGen Exome Hyb Panel V2 | 5 Gb 10 Gb |
Τύπος δείγματος
| Ποσό(Qubit®)
| Ενταση ΗΧΟΥ
| Συγκέντρωση
| Καθαρότητα (NanoDrop™) |
Γονιδιωματικό DNA
| ≥ 300 ng | ≥ 15 μL | ≥ 20 ng/μL | OD260/280=1,8-2,0 καμία υποβάθμιση, καμία μόλυνση
|
Για μεντελικές διαταραχές/σπάνιες ασθένειες: αποτελεσματικό βάθος προσδιορισμού αλληλουχίας άνω του 50×
Για δείγματα όγκου: αποτελεσματικό βάθος προσδιορισμού αλληλουχίας πάνω από 100×
1.Στατιστικά στοιχεία ευθυγράμμισης
Πίνακας 1 Στατιστικά αποτελέσματος χάρτη
Πίνακας 2 Στατιστικά στοιχεία σύλληψης εξωμάτων
2.Ανίχνευση παραλλαγής
Σχήμα 1 Στατιστικά στοιχεία SNV και InDel
3.Προηγμένη Ανάλυση
Εικόνα 2 Διάγραμμα Circos του επιβλαβούς SNV και InDel σε όλο το γονιδίωμα
Πίνακας 3 Έλεγχος γονιδίων που προκαλούν νόσο