Προϊόντα

Ανάλυση συσχέτισης σε επίπεδο γονιδιώματος

Επιλεγμένη εικόνα ανάλυσης συσχέτισης σε όλο το γονιδίωμα

Η μελέτη συσχέτισης σε επίπεδο γονιδιώματος (GWAS) στοχεύει στον εντοπισμό γενετικών παραλλαγών (γονότυπος) που σχετίζονται με συγκεκριμένα χαρακτηριστικά (φαινότυπος).Η μελέτη GWAS διερευνά γενετικούς δείκτες που διασχίζουν ολόκληρο το γονιδίωμα μεγάλου αριθμού ατόμων και προβλέπει συσχετίσεις γονότυπου-φαινοτύπου μέσω στατιστικής ανάλυσης σε επίπεδο πληθυσμού.Έχει εφαρμοστεί ευρέως στην έρευνα για τις ανθρώπινες ασθένειες και την εξόρυξη λειτουργικών γονιδίων σε πολύπλοκα χαρακτηριστικά ζώων ή φυτών.

Επικοινωνήστε μαζί μας

Στοιχεία υπηρεσίας

Αποτέλεσμα επίδειξης

Επιλεγμένη δημοσίευση

1.Πλεονεκτήματα υπηρεσιών

● Πληθώρα περιπτώσεων έργου: από την ίδρυσή του το 2009, το BMKGENE έχει ολοκληρώσει εκατοντάδες έργα ειδών στην πληθυσμιακή έρευνα GWAS, βοήθησε ερευνητές να δημοσιεύσουν περισσότερα από 100 άρθρα και ο αθροιστικός παράγοντας αντίκτυπου έφτασε τα 500.
● Επαγγελματίες αναλυτές.
● Σύντομος κύκλος ανάλυσης.
● Ακριβής εξόρυξη δεδομένων.

2. Προδιαγραφές σέρβις

Τύπος	Πληθυσμιακή Κλίμακα	Στρατηγική και βάθος αλληλουχίας
SLAF-GWAS	Αριθμός δείγματος ≥200	Μέγεθος γονιδιώματος < 400M, με ref-genome, συνιστάται WGS
		Μέγεθος γονιδιώματος ≤ 1G, 100K ετικέτες και 10X
		1G ≤ Μέγεθος γονιδιώματος ≤ 2G, 200K ετικέτες και 10X
		Μέγεθος γονιδιώματος > 2G, 300K ετικέτες και 10X
WGS-GWAS	Αριθμός δείγματος ≥200	10X για κάθε δείγμα

3. Επιλογή υλικού

Διαφορετικές ποικιλίες, υποείδη, ντόπια/τράπεζες γονιδίων/μεικτές οικογένειες/άγριοι πόροι

Διαφορετικές ποικιλίες, υποείδη, τοπικές φυλές

Οικογένεια Half-Sib/Full-sib οικογένεια/άγριοι πόροι

4. Ανάλυση βιοπληροφοριών

● Ανάλυση συσχέτισης σε επίπεδο γονιδιώματος
● Ανάλυση και έλεγχος σημαντικών SNP
● Λειτουργικός σχολιασμός υποψήφιου γονιδίου

5. Ροή εργασιών εξυπηρέτησης

Σχεδιασμός πειράματος

Παράδοση δειγμάτων

Εκχύλιση RNA

Κατασκευή βιβλιοθήκης

Αλληλουχία

Ανάλυση δεδομένων

Υπηρεσίες μετά την πώληση

Προηγούμενος: Αλληλουχία RNA ενός πυρήνα

Επόμενο:

ένα.Φαινότυπος QC

Ιστόγραμμα κατανομής συχνότητας

Στατιστικά φαινοτύπων

σι.Ανάλυση συσχέτισης (Μοντέλο: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

Οικόπεδο QQ

Οικόπεδο Μανχάταν

Ετος	Εφημερίδα	IF	Τίτλος
2022	NC	17,69	Γονιδιωματική βάση των γιγα-χρωμοσωμάτων και γιγα-γονιδίωμα της παιώνιας δέντρου Paeonia ostii
2015	NP	7.43	Τα ίχνη εξημερώσεως αγκυρώνουν γονιδιωματικές περιοχές αγρονομικής σημασίας στη σόγια
2018	MP	9.32	Η επανεξέταση ολόκληρου του γονιδιώματος μιας παγκόσμιας συλλογής προσαρτήσεων ελαιοκράμβης αποκαλύπτει τη γενετική βάση της οικολογικής τους απόκλισης
2022	HR	7.29	Η ανάλυση συσχέτισης σε όλο το γονιδίωμα παρέχει μοριακές γνώσεις σχετικά με τη φυσική διακύμανση του μεγέθους των σπόρων του καρπουζιού