Η BMKGENE παρείχε πλήρους μήκους υπηρεσίες προσδιορισμού αλληλουχίας μεταγραφώματος χρησιμοποιώντας τεχνολογίες PacBio και ONT για μια μελέτη με τίτλο «Συγκριτική ανάλυση των μεθόδων αλληλούχισης PacBio και ONT RNA για την ταυτοποίηση του δηλητηρίου του Nemopilema Nomurai», η οποία δημοσιεύτηκε στο περιοδικό Genomics.Η μελέτη είχε ως στόχο να συγκρίνει την αποτελεσματικότητα των μεθόδων προσδιορισμού αλληλουχίας RNA PacBio και ONT στην αναγνώριση του δηλητηρίου του είδους των μεδουσών Nemopilema nomurai.
Τα ευρήματα της μελέτης υποδεικνύουν ότι το ONT παρήγαγε γενικά υψηλότερη ποιότητα ακατέργαστων δεδομένων στην ανάλυση μεταγραφής, ενώ το PacBio δημιούργησε μεγαλύτερα μήκη ανάγνωσης.Το PacBio βρέθηκε να είναι ανώτερο στον εντοπισμό κωδικοποιητικών αλληλουχιών και μακράς αλυσίδας μη κωδικοποιημένου RNA, ενώ το ONT ήταν πιο οικονομικό για την πρόβλεψη εναλλακτικών γεγονότων ματίσματος, απλών επαναλήψεων αλληλουχιών και παραγόντων μεταγραφής.
Αυτή η μελέτη έχει σημαντικές επιπτώσεις για τις μελλοντικές τεχνολογίες αλληλουχίας στις θαλάσσιες μέδουσες και υπογραμμίζει τη δύναμη της ανάλυσης μεταγραφικού πλήρους μήκους στην ανακάλυψη πιθανών θεραπευτικών στόχων για τη δερματίτιδα των μεδουσών.
Κάντε κλικεδώγια να μάθετε περισσότερα για αυτό το άρθρο.
Ώρα δημοσίευσης: Δεκ-20-2023