Προϊόντα

DNA/RNA Sequencing – Nanopore Sequencer

Αλληλουχία DNA/RNA – Επιλεγμένη εικόνα του Sequencer Nanopore

Η αλληλουχία ONT είναι μια τεχνολογία αλληλουχίας ηλεκτρικών σημάτων σε πραγματικό χρόνο ενός μορίου που βασίζεται σε νανοπόρους, η αρχή της αλληλουχίας κάθε πλατφόρμας είναι η ίδια.Το δίκλωνο DNA/RNA θα συνδεθεί με τη νανοπορώδη πρωτεΐνη που είναι ενσωματωμένη στο βιοφίλμ και θα ξετυλίγεται κάτω από το μόλυβδο της πρωτεΐνης κινητήρα, υπό τη δράση της διαφοράς τάσης και από τις δύο πλευρές του βιοφίλμ, οι κλώνοι DNA/RNA περνούν μέσω της πρωτεΐνης καναλιού νανοπόρου σε ορισμένο τιμή.Λόγω των διαφορών στις χημικές ιδιότητες των διαφορετικών βάσεων στον κλώνο DNA/RNA, όταν μια μεμονωμένη βάση ή μόριο DNA διέρχεται από το κανάλι νανοπόρου, θα προκαλέσει την αλλαγή διαφορετικών ηλεκτρικών σημάτων.Ανιχνεύοντας και αντιστοιχώντας σε αυτά τα σήματα, μπορούν να υπολογιστούν οι αντίστοιχοι τύποι βάσεων και να ολοκληρωθεί η ανίχνευση της ακολουθίας σε πραγματικό χρόνο.

Επικοινωνήστε μαζί μας

Στοιχεία υπηρεσίας

Αποτέλεσμα επίδειξης

Στοιχεία υπηρεσίας Χαρακτηριστικά

Πλατφόρμα	Μέγεθος βιβλιοθήκης	Θεωρητική απόδοση δεδομένων (ανά κελί)	Ακρίβεια μίας βάσης	Εφαρμογές
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90Gb/Κυψέλη	85-92%	Κλήση SV, De novo, Αλληλουχία πλήρους μήκους, Iso-Seq, Σχολιασμός γονιδίου, Ανίχνευση μεθυλίωσης DNA

Πλεονεκτήματα εξυπηρέτησης

● Πάνω από 5 χρόνια εμπειρίας στην πλατφόρμα αλληλούχισης PacBio με χιλιάδες κλειστά έργα με διάφορα είδη.
● Η BMKGENE είναι επίσημος συνεργάτης της Oxford Nanopore, με πιστοποίηση διπλής πλατφόρμας RNA/DNA.
● Υπάρχουν κύρια μοντέλα ακολουθιών με πλήρη εξοπλισμό και επαρκή απόδοση αλληλουχίας.
● Με βάση την πλατφόρμα Nanopore, περισσότερες από 10 έρευνες σε ζώα και φυτά της Denovo έχουν δημοσιευθεί σε διεθνούς φήμης περιοδικά.

Απαιτήσεις δειγμάτων

Τύπος δείγματος

Ποσό

Συγκέντρωση (Qubit ®)

Ενταση ΗΧΟΥ

Καθαρότητα

Οι υπολοιποι

Γονιδιωματικό DNA

Εξαρτήστε από την Απαίτηση Δεδομένων

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5；

Καθαρή κορυφή στα 260 nm, χωρίς μολύνσεις

Η συγκέντρωση πρέπει να μετρηθεί με Qubit και Qubit/Nanopore ≤ 2

Ολικό RNA

≥1,2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5；καμία μόλυνση

Τιμή RIN ≥7,5

Ροή εργασιών εξυπηρέτησης

Η προετοιμασία των δειγμάτων

Κατασκευή βιβλιοθήκης

Αλληλουχία

Ανάλυση δεδομένων

παράδοση έργου

Προηγούμενος: DNA/RNA Sequencing – Illumina Sequencer

Επόμενο: Αλληλουχία θραύσματος ενισχυμένης ειδικής θέσης (SLAF-Seq)

Αξιολόγηση Ποιότητας Δεδομένων Δείγματος DNA

Πίνακας 1. Στατιστικά στοιχεία για καθαρά δεδομένα.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	καθαρόN50Len	καθαρόN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1.218.239	26.37	1.121.736	25,90	28.014	15.764	23.090	143.181	9

Αξιολόγηση Ποιότητας Δεδομένων Δείγματος RNA

Πίνακας 1. Στατιστικά στοιχεία για καθαρά δεδομένα.

Ονομα αρχείου	Ταυτότητα πελάτη	ReadNum	Αριθμός βάσης	N50	Μέσο Μήκος	Μέγιστο μήκος	MeanQscore
RNA_BMK001	C2	8.947.708	4.047.230.083	398	452	129.227	Ε12