Illumina και BGI
Χαρακτηριστικά
●Πλατφόρμες:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten και BGI-DNB-T7
●Λειτουργίες αλληλουχίας:PE50, PE100, PE150, PE250
●Ποιοτικός έλεγχος βιβλιοθηκών πριν από την αλληλουχία
●Αλληλουχία παράδοσης δεδομένων και QC:παράδοση της αναφοράς QC και των ακατέργαστων δεδομένων σε μορφή fastq μετά από αποπολυπλέξη και φιλτράρισμα αναγνώσεων Q30.
Πλεονεκτήματα εξυπηρέτησης
●Ευελιξία των υπηρεσιών αλληλουχίας:ο πελάτης μπορεί να επιλέξει την αλληλουχία ανά λωρίδα, κυψέλη ροής ή ποσότητα δεδομένων.
●Ευελιξία πλατφορμών:Οι βιβλιοθήκες DNB μπορούν να μεταφερθούν σε πλατφόρμες Illumina
●Εκτεταμένη εμπειρία στην πλατφόρμα αλληλουχίας Illumina:με χιλιάδες κλειστά έργα με διάφορα είδη.
●Παράδοση αναφοράς QC αλληλουχίας:με μετρήσεις ποιότητας, ακρίβεια δεδομένων και συνολική απόδοση του έργου αλληλουχίας.
●Διαδικασία ώριμης αλληλουχίας:με σύντομο χρόνο περιστροφής.
●Αυστηρός ποιοτικός έλεγχος: εφαρμόζουμε αυστηρές απαιτήσεις QC για να εγγυηθούμε την παράδοση σταθερά υψηλής ποιότητας αποτελεσμάτων.
Απαιτήσεις δειγμάτων*
Μερική αλληλουχία λωρίδων
| Ποσό δεδομένων (X) | Συγκέντρωση (qPCR/nM) | Ενταση ΗΧΟΥ |
| X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| 50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
| X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Single Lane (Illumina)
| Πλατφόρμα | Συγκέντρωση (qPCR/nM) | Ενταση ΗΧΟΥ |
| HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Εκτός από τη συγκέντρωση και τη συνολική ποσότητα, απαιτείται επίσης ένα κατάλληλο μοτίβο κορυφής.
Επικοινωνήστε μαζί μας εάν τα δείγματά σας δεν πληρούν τις απαιτήσεις πρώτης ύλης.
Ροή εργασιών εξυπηρέτησης
Έλεγχος ποιότητας βιβλιοθήκης
Αλληλουχία
Έλεγχος ποιότητας δεδομένων
παράδοση έργου
Έκθεση QC βιβλιοθήκης
Μια αναφορά για την ποιότητα της βιβλιοθήκης παρέχεται πριν από την αλληλουχία, την αξιολόγηση του όγκου της βιβλιοθήκης και τον κατακερματισμό.
Αλληλουχία αναφοράς QC
Πίνακας 1. Στατιστικά στοιχεία για την αλληλουχία δεδομένων.
| Δείγμα ταυτότητας | BMKID | Ακατέργαστα διαβάζει | Ακατέργαστα δεδομένα (bp) | Καθαρές αναγνώσεις (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Εικόνα 1. Κατανομή ποιότητας κατά μήκος των αναγνώσεων σε κάθε δείγμα
Εικόνα 2. Κατανομή βασικού περιεχομένου
Εικόνα 3. Κατανομή των αναγνωσμένων περιεχομένων σε δεδομένα αλληλουχίας
